Protein–RNA interactions for Protein: P08F94

PKHD1, Fibrocystin, humanhuman

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Length 4,074 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKHD1P08F94 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
PKHD1P08F94 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
PKHD1P08F94 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
PKHD1P08F94 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
PKHD1P08F94 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC19.46■□□□□ 0.7
PKHD1P08F94 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC19.45■□□□□ 0.7
PKHD1P08F94 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC19.45■□□□□ 0.7
PKHD1P08F94 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC19.44■□□□□ 0.7
PKHD1P08F94 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
PKHD1P08F94 SEPT3-204ENST00000406029 1866 ntTSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
PKHD1P08F94 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
PKHD1P08F94 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
PKHD1P08F94 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
PKHD1P08F94 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
PKHD1P08F94 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
PKHD1P08F94 NECTIN3-201ENST00000319792 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
PKHD1P08F94 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
PKHD1P08F94 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
PKHD1P08F94 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
PKHD1P08F94 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
PKHD1P08F94 NKAIN4-203ENST00000370316 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
PKHD1P08F94 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
PKHD1P08F94 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
PKHD1P08F94 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
PKHD1P08F94 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
PKHD1P08F94 CAPNS1-206ENST00000588815 1471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
PKHD1P08F94 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
PKHD1P08F94 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC19.19■□□□□ 0.66
PKHD1P08F94 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
PKHD1P08F94 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC19.17■□□□□ 0.66
PKHD1P08F94 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
PKHD1P08F94 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
PKHD1P08F94 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
PKHD1P08F94 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
PKHD1P08F94 PWWP2B-202ENST00000631148 2013 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
PKHD1P08F94 FAM149A-215ENST00000514153 2070 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
PKHD1P08F94 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
PKHD1P08F94 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
PKHD1P08F94 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
PKHD1P08F94 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
PKHD1P08F94 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
PKHD1P08F94 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
PKHD1P08F94 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
PKHD1P08F94 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
PKHD1P08F94 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
PKHD1P08F94 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
PKHD1P08F94 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC19■□□□□ 0.63
PKHD1P08F94 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC19■□□□□ 0.63
PKHD1P08F94 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
PKHD1P08F94 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
PKHD1P08F94 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
PKHD1P08F94 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC18.96■□□□□ 0.63
PKHD1P08F94 NT5DC2-202ENST00000422318 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
PKHD1P08F94 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
PKHD1P08F94 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
PKHD1P08F94 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
PKHD1P08F94 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
PKHD1P08F94 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
PKHD1P08F94 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
PKHD1P08F94 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
PKHD1P08F94 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC18.89■□□□□ 0.61
PKHD1P08F94 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
PKHD1P08F94 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
PKHD1P08F94 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
PKHD1P08F94 CCM2-219ENST00000544363 1620 ntTSL 3 BASIC18.85■□□□□ 0.61
PKHD1P08F94 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
PKHD1P08F94 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC18.82■□□□□ 0.6
PKHD1P08F94 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
PKHD1P08F94 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
PKHD1P08F94 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
PKHD1P08F94 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC18.81■□□□□ 0.6
PKHD1P08F94 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
PKHD1P08F94 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC18.8■□□□□ 0.6
PKHD1P08F94 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC18.8■□□□□ 0.6
PKHD1P08F94 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
PKHD1P08F94 CYHR1-209ENST00000530374 1870 ntTSL 3 BASIC18.78■□□□□ 0.6
PKHD1P08F94 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
PKHD1P08F94 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
PKHD1P08F94 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
PKHD1P08F94 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC18.76■□□□□ 0.59
PKHD1P08F94 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
PKHD1P08F94 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
PKHD1P08F94 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
PKHD1P08F94 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
PKHD1P08F94 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
PKHD1P08F94 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC18.7■□□□□ 0.58
PKHD1P08F94 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
PKHD1P08F94 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
PKHD1P08F94 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
PKHD1P08F94 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
PKHD1P08F94 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
PKHD1P08F94 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
PKHD1P08F94 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
PKHD1P08F94 MPND-207ENST00000599840 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
PKHD1P08F94 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
PKHD1P08F94 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
PKHD1P08F94 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC18.61■□□□□ 0.57
PKHD1P08F94 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
PKHD1P08F94 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
PKHD1P08F94 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
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