Protein–RNA interactions for Protein: P08922

ROS1, Proto-oncogene tyrosine-protein kinase ROS, humanhuman

Predictions only

Length 2,347 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ROS1P08922 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
ROS1P08922 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC25.13■■□□□ 1.61
ROS1P08922 RAB12-201ENST00000329286 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
ROS1P08922 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC25.09■■□□□ 1.61
ROS1P08922 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
ROS1P08922 C11orf84-201ENST00000294244 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
ROS1P08922 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
ROS1P08922 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
ROS1P08922 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
ROS1P08922 HAPLN2-201ENST00000255039 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
ROS1P08922 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
ROS1P08922 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC24.95■■□□□ 1.58
ROS1P08922 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
ROS1P08922 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
ROS1P08922 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
ROS1P08922 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
ROS1P08922 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
ROS1P08922 ILK-212ENST00000532063 1617 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
ROS1P08922 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
ROS1P08922 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC24.91■■□□□ 1.58
ROS1P08922 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC24.9■■□□□ 1.58
ROS1P08922 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
ROS1P08922 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
ROS1P08922 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
ROS1P08922 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
ROS1P08922 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
ROS1P08922 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC24.84■■□□□ 1.57
ROS1P08922 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
ROS1P08922 B4GALT2-203ENST00000372324 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
ROS1P08922 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
ROS1P08922 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC24.77■■□□□ 1.56
ROS1P08922 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
ROS1P08922 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
ROS1P08922 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
ROS1P08922 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
ROS1P08922 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
ROS1P08922 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
ROS1P08922 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
ROS1P08922 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
ROS1P08922 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
ROS1P08922 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
ROS1P08922 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
ROS1P08922 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
ROS1P08922 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
ROS1P08922 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
ROS1P08922 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
ROS1P08922 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC24.62■■□□□ 1.53
ROS1P08922 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
ROS1P08922 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
ROS1P08922 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
ROS1P08922 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
ROS1P08922 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
ROS1P08922 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
ROS1P08922 KHSRP-213ENST00000619396 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
ROS1P08922 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
ROS1P08922 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
ROS1P08922 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
ROS1P08922 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
ROS1P08922 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
ROS1P08922 PABPN1-201ENST00000216727 2001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
ROS1P08922 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
ROS1P08922 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
ROS1P08922 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
ROS1P08922 TPRG1L-201ENST00000344579 2189 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
ROS1P08922 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
ROS1P08922 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
ROS1P08922 TGIF1-202ENST00000343820 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
ROS1P08922 MAPK3-202ENST00000322266 1743 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
ROS1P08922 PPP2CB-201ENST00000221138 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
ROS1P08922 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
ROS1P08922 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
ROS1P08922 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
ROS1P08922 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
ROS1P08922 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
ROS1P08922 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
ROS1P08922 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.5
ROS1P08922 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
ROS1P08922 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
ROS1P08922 CRIP2-201ENST00000329146 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
ROS1P08922 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
ROS1P08922 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
ROS1P08922 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.48
ROS1P08922 FOXD1-202ENST00000615637 2272 ntAPPRIS P1 BASIC24.31■■□□□ 1.48
ROS1P08922 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
ROS1P08922 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
ROS1P08922 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
ROS1P08922 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
ROS1P08922 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
ROS1P08922 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
ROS1P08922 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
ROS1P08922 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
ROS1P08922 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
ROS1P08922 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
ROS1P08922 KIAA2013-203ENST00000616327 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
ROS1P08922 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
ROS1P08922 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
ROS1P08922 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
ROS1P08922 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
ROS1P08922 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
ROS1P08922 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17 ms