Protein–RNA interactions for Protein: P04629

NTRK1, High affinity nerve growth factor receptor, humanhuman

Predictions only

Length 796 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NTRK1P04629 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.06
NTRK1P04629 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
NTRK1P04629 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
NTRK1P04629 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
NTRK1P04629 KIAA2013-203ENST00000616327 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
NTRK1P04629 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
NTRK1P04629 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC27.87■■■□□ 2.05
NTRK1P04629 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
NTRK1P04629 C11orf84-201ENST00000294244 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
NTRK1P04629 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
NTRK1P04629 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
NTRK1P04629 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
NTRK1P04629 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC27.82■■■□□ 2.04
NTRK1P04629 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
NTRK1P04629 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
NTRK1P04629 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
NTRK1P04629 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
NTRK1P04629 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
NTRK1P04629 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
NTRK1P04629 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
NTRK1P04629 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
NTRK1P04629 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
NTRK1P04629 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
NTRK1P04629 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
NTRK1P04629 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
NTRK1P04629 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
NTRK1P04629 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
NTRK1P04629 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
NTRK1P04629 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
NTRK1P04629 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.01
NTRK1P04629 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
NTRK1P04629 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.62■■■□□ 2.01
NTRK1P04629 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC27.6■■■□□ 2.01
NTRK1P04629 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
NTRK1P04629 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
NTRK1P04629 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
NTRK1P04629 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
NTRK1P04629 TPRG1L-201ENST00000344579 2189 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
NTRK1P04629 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
NTRK1P04629 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
NTRK1P04629 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
NTRK1P04629 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC27.43■■□□□ 1.98
NTRK1P04629 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
NTRK1P04629 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
NTRK1P04629 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC27.4■■□□□ 1.98
NTRK1P04629 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
NTRK1P04629 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
NTRK1P04629 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
NTRK1P04629 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
NTRK1P04629 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
NTRK1P04629 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC27.34■■□□□ 1.97
NTRK1P04629 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC27.34■■□□□ 1.97
NTRK1P04629 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
NTRK1P04629 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
NTRK1P04629 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
NTRK1P04629 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
NTRK1P04629 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
NTRK1P04629 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC27.27■■□□□ 1.96
NTRK1P04629 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC27.26■■□□□ 1.96
NTRK1P04629 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
NTRK1P04629 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
NTRK1P04629 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC27.24■■□□□ 1.95
NTRK1P04629 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC27.24■■□□□ 1.95
NTRK1P04629 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
NTRK1P04629 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
NTRK1P04629 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC27.21■■□□□ 1.95
NTRK1P04629 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
NTRK1P04629 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
NTRK1P04629 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
NTRK1P04629 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
NTRK1P04629 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
NTRK1P04629 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
NTRK1P04629 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
NTRK1P04629 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
NTRK1P04629 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
NTRK1P04629 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC27.14■■□□□ 1.94
NTRK1P04629 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
NTRK1P04629 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
NTRK1P04629 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
NTRK1P04629 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC27.12■■□□□ 1.93
NTRK1P04629 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
NTRK1P04629 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
NTRK1P04629 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
NTRK1P04629 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
NTRK1P04629 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
NTRK1P04629 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
NTRK1P04629 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
NTRK1P04629 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC27.05■■□□□ 1.92
NTRK1P04629 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
NTRK1P04629 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
NTRK1P04629 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
NTRK1P04629 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
NTRK1P04629 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
NTRK1P04629 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
NTRK1P04629 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
NTRK1P04629 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
NTRK1P04629 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
NTRK1P04629 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
NTRK1P04629 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
NTRK1P04629 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.7 ms