Protein–RNA interactions for Protein: P02545

LMNA, Prelamin-A/C, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 664 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMNAP02545 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC30.03■■■□□ 2.4
LMNAP02545 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
LMNAP02545 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
LMNAP02545 INO80B-WBP1-202ENST00000452361 2040 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC30■■■□□ 2.39
LMNAP02545 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC30■■■□□ 2.39
LMNAP02545 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC29.99■■■□□ 2.39
LMNAP02545 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
LMNAP02545 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
LMNAP02545 NT5DC2-203ENST00000459839 1639 ntTSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
LMNAP02545 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
LMNAP02545 METRNL-201ENST00000320095 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
LMNAP02545 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC29.92■■■□□ 2.38
LMNAP02545 MAPK3-201ENST00000263025 1861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
LMNAP02545 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
LMNAP02545 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC29.9■■■□□ 2.38
LMNAP02545 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC29.9■■■□□ 2.38
LMNAP02545 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC29.89■■■□□ 2.38
LMNAP02545 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC29.89■■■□□ 2.38
LMNAP02545 C11orf84-201ENST00000294244 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
LMNAP02545 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
LMNAP02545 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC29.85■■■□□ 2.37
LMNAP02545 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC29.84■■■□□ 2.37
LMNAP02545 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
LMNAP02545 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
LMNAP02545 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC29.79■■■□□ 2.36
LMNAP02545 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
LMNAP02545 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC29.73■■■□□ 2.35
LMNAP02545 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
LMNAP02545 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC29.67■■■□□ 2.34
LMNAP02545 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
LMNAP02545 B4GALT2-203ENST00000372324 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
LMNAP02545 NECTIN3-201ENST00000319792 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
LMNAP02545 TPRG1L-201ENST00000344579 2189 ntTSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
LMNAP02545 PABPN1-201ENST00000216727 2001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
LMNAP02545 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
LMNAP02545 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
LMNAP02545 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC29.51■■■□□ 2.31
LMNAP02545 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC29.5■■■□□ 2.31
LMNAP02545 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
LMNAP02545 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC29.47■■■□□ 2.31
LMNAP02545 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC29.47■■■□□ 2.31
LMNAP02545 CRIP2-201ENST00000329146 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
LMNAP02545 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
LMNAP02545 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.3
LMNAP02545 MPND-207ENST00000599840 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.44■■■□□ 2.3
LMNAP02545 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.42■■■□□ 2.3
LMNAP02545 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
LMNAP02545 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC29.42■■■□□ 2.3
LMNAP02545 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC29.42■■■□□ 2.3
LMNAP02545 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
LMNAP02545 CAPNS1-206ENST00000588815 1471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
LMNAP02545 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
LMNAP02545 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
LMNAP02545 SLC25A10-203ENST00000545862 1911 ntTSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
LMNAP02545 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
LMNAP02545 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
LMNAP02545 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC29.3■■■□□ 2.28
LMNAP02545 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC29.29■■■□□ 2.28
LMNAP02545 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.29■■■□□ 2.28
LMNAP02545 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
LMNAP02545 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
LMNAP02545 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC29.27■■■□□ 2.28
LMNAP02545 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.27■■■□□ 2.28
LMNAP02545 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC29.25■■■□□ 2.27
LMNAP02545 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
LMNAP02545 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
LMNAP02545 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.21■■■□□ 2.27
LMNAP02545 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
LMNAP02545 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC29.21■■■□□ 2.27
LMNAP02545 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
LMNAP02545 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC29.2■■■□□ 2.26
LMNAP02545 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC29.2■■■□□ 2.26
LMNAP02545 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.16■■■□□ 2.26
LMNAP02545 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC29.14■■■□□ 2.26
LMNAP02545 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
LMNAP02545 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
LMNAP02545 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC29.1■■■□□ 2.25
LMNAP02545 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
LMNAP02545 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC29.09■■■□□ 2.25
LMNAP02545 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC29.09■■■□□ 2.25
LMNAP02545 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
LMNAP02545 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.07■■■□□ 2.24
LMNAP02545 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.07■■■□□ 2.24
LMNAP02545 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC29.07■■■□□ 2.24
LMNAP02545 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
LMNAP02545 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
LMNAP02545 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
LMNAP02545 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC29.02■■■□□ 2.24
LMNAP02545 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC29■■■□□ 2.23
LMNAP02545 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
LMNAP02545 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC28.97■■■□□ 2.23
LMNAP02545 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.97■■■□□ 2.23
LMNAP02545 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC28.96■■■□□ 2.23
LMNAP02545 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC28.94■■■□□ 2.22
LMNAP02545 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC28.93■■■□□ 2.22
LMNAP02545 KIAA2013-203ENST00000616327 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.91■■■□□ 2.22
LMNAP02545 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC28.89■■■□□ 2.22
LMNAP02545 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC28.89■■■□□ 2.22
LMNAP02545 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC28.89■■■□□ 2.22
LMNAP02545 NT5DC2-202ENST00000422318 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.88■■■□□ 2.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 8.3 ms