Protein–RNA interactions for Protein: O75335

PPFIA4, Liprin-alpha-4, humanhuman

Predictions only

Length 1,185 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPFIA4O75335 TRIP10-202ENST00000313285 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.85■■■□□ 2.85
PPFIA4O75335 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.83■■■□□ 2.85
PPFIA4O75335 ILK-212ENST00000532063 1617 ntTSL 2 BASIC32.82■■■□□ 2.84
PPFIA4O75335 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.82■■■□□ 2.84
PPFIA4O75335 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.8■■■□□ 2.84
PPFIA4O75335 C11orf84-201ENST00000294244 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.77■■■□□ 2.84
PPFIA4O75335 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC32.77■■■□□ 2.84
PPFIA4O75335 TGIF1-202ENST00000343820 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.76■■■□□ 2.84
PPFIA4O75335 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.76■■■□□ 2.83
PPFIA4O75335 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.75■■■□□ 2.83
PPFIA4O75335 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC32.74■■■□□ 2.83
PPFIA4O75335 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC32.72■■■□□ 2.83
PPFIA4O75335 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.66■■■□□ 2.82
PPFIA4O75335 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC32.62■■■□□ 2.81
PPFIA4O75335 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.61■■■□□ 2.81
PPFIA4O75335 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.61■■■□□ 2.81
PPFIA4O75335 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC32.57■■■□□ 2.8
PPFIA4O75335 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC32.56■■■□□ 2.8
PPFIA4O75335 HAPLN2-201ENST00000255039 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.48■■■□□ 2.79
PPFIA4O75335 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.47■■■□□ 2.79
PPFIA4O75335 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC32.44■■■□□ 2.78
PPFIA4O75335 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC32.44■■■□□ 2.78
PPFIA4O75335 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.43■■■□□ 2.78
PPFIA4O75335 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.43■■■□□ 2.78
PPFIA4O75335 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.42■■■□□ 2.78
PPFIA4O75335 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC32.4■■■□□ 2.78
PPFIA4O75335 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC32.37■■■□□ 2.77
PPFIA4O75335 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC32.35■■■□□ 2.77
PPFIA4O75335 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.35■■■□□ 2.77
PPFIA4O75335 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC32.35■■■□□ 2.77
PPFIA4O75335 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC32.3■■■□□ 2.76
PPFIA4O75335 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC32.3■■■□□ 2.76
PPFIA4O75335 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.29■■■□□ 2.76
PPFIA4O75335 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC32.29■■■□□ 2.76
PPFIA4O75335 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.24■■■□□ 2.75
PPFIA4O75335 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC32.23■■■□□ 2.75
PPFIA4O75335 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.19■■■□□ 2.74
PPFIA4O75335 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.19■■■□□ 2.74
PPFIA4O75335 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.19■■■□□ 2.74
PPFIA4O75335 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.18■■■□□ 2.74
PPFIA4O75335 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC32.18■■■□□ 2.74
PPFIA4O75335 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.13■■■□□ 2.73
PPFIA4O75335 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.12■■■□□ 2.73
PPFIA4O75335 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC32.12■■■□□ 2.73
PPFIA4O75335 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC32.1■■■□□ 2.73
PPFIA4O75335 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC32.09■■■□□ 2.73
PPFIA4O75335 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC32.09■■■□□ 2.73
PPFIA4O75335 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC32.06■■■□□ 2.72
PPFIA4O75335 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC32.06■■■□□ 2.72
PPFIA4O75335 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.04■■■□□ 2.72
PPFIA4O75335 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.03■■■□□ 2.72
PPFIA4O75335 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC32.02■■■□□ 2.72
PPFIA4O75335 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC32.01■■■□□ 2.71
PPFIA4O75335 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32■■■□□ 2.71
PPFIA4O75335 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC31.99■■■□□ 2.71
PPFIA4O75335 MAPK3-202ENST00000322266 1743 ntTSL 5 BASIC31.98■■■□□ 2.71
PPFIA4O75335 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.96■■■□□ 2.71
PPFIA4O75335 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC31.96■■■□□ 2.71
PPFIA4O75335 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC31.95■■■□□ 2.71
PPFIA4O75335 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC31.94■■■□□ 2.7
PPFIA4O75335 TPRG1L-201ENST00000344579 2189 ntTSL 1 (best) BASIC31.93■■■□□ 2.7
PPFIA4O75335 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC31.91■■■□□ 2.7
PPFIA4O75335 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC31.89■■■□□ 2.7
PPFIA4O75335 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.88■■■□□ 2.69
PPFIA4O75335 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.87■■■□□ 2.69
PPFIA4O75335 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC31.86■■■□□ 2.69
PPFIA4O75335 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC31.86■■■□□ 2.69
PPFIA4O75335 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC31.86■■■□□ 2.69
PPFIA4O75335 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC31.85■■■□□ 2.69
PPFIA4O75335 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC31.84■■■□□ 2.69
PPFIA4O75335 PABPN1-201ENST00000216727 2001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.83■■■□□ 2.69
PPFIA4O75335 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.82■■■□□ 2.68
PPFIA4O75335 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC31.81■■■□□ 2.68
PPFIA4O75335 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC31.78■■■□□ 2.68
PPFIA4O75335 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.72■■■□□ 2.67
PPFIA4O75335 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.72■■■□□ 2.67
PPFIA4O75335 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC31.71■■■□□ 2.67
PPFIA4O75335 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.69■■■□□ 2.66
PPFIA4O75335 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.67■■■□□ 2.66
PPFIA4O75335 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC31.67■■■□□ 2.66
PPFIA4O75335 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC31.67■■■□□ 2.66
PPFIA4O75335 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.66■■■□□ 2.66
PPFIA4O75335 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC31.66■■■□□ 2.66
PPFIA4O75335 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.65■■■□□ 2.66
PPFIA4O75335 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.64■■■□□ 2.66
PPFIA4O75335 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC31.63■■■□□ 2.65
PPFIA4O75335 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.63■■■□□ 2.65
PPFIA4O75335 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.6■■■□□ 2.65
PPFIA4O75335 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC31.59■■■□□ 2.65
PPFIA4O75335 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC31.59■■■□□ 2.65
PPFIA4O75335 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC31.58■■■□□ 2.65
PPFIA4O75335 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC31.57■■■□□ 2.64
PPFIA4O75335 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC31.56■■■□□ 2.64
PPFIA4O75335 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.56■■■□□ 2.64
PPFIA4O75335 B4GALT2-203ENST00000372324 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.55■■■□□ 2.64
PPFIA4O75335 CRIP2-201ENST00000329146 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.55■■■□□ 2.64
PPFIA4O75335 INO80B-WBP1-202ENST00000452361 2040 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC31.53■■■□□ 2.64
PPFIA4O75335 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.51■■■□□ 2.64
PPFIA4O75335 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.49■■■□□ 2.63
PPFIA4O75335 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.47■■■□□ 2.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.7 ms