Protein–RNA interactions for Protein: O60885

BRD4, Bromodomain-containing protein 4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,362 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRD4O60885 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.52■■■■■ 4.08
BRD4O60885 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC40.52■■■■■ 4.08
BRD4O60885 C11orf63-202ENST00000307257 1964 ntTSL 2 BASIC40.51■■■■■ 4.08
BRD4O60885 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.43■■■■■ 4.06
BRD4O60885 PABPN1-201ENST00000216727 2001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC40.42■■■■■ 4.06
BRD4O60885 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC40.39■■■■■ 4.06
BRD4O60885 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.37■■■■■ 4.05
BRD4O60885 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC40.37■■■■■ 4.05
BRD4O60885 ILK-212ENST00000532063 1617 ntTSL 2 BASIC40.36■■■■■ 4.05
BRD4O60885 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.36■■■■■ 4.05
BRD4O60885 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC40.34■■■■■ 4.05
BRD4O60885 INO80B-WBP1-202ENST00000452361 2040 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC40.31■■■■■ 4.04
BRD4O60885 MAPK3-201ENST00000263025 1861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC40.3■■■■■ 4.04
BRD4O60885 B4GALT2-203ENST00000372324 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.28■■■■■ 4.04
BRD4O60885 HAPLN2-201ENST00000255039 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.28■■■■■ 4.04
BRD4O60885 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC40.2■■■■■ 4.03
BRD4O60885 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC40.19■■■■■ 4.02
BRD4O60885 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC40.14■■■■■ 4.02
BRD4O60885 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC40.14■■■■■ 4.02
BRD4O60885 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.13■■■■■ 4.02
BRD4O60885 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.13■■■■■ 4.02
BRD4O60885 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC40.13■■■■■ 4.01
BRD4O60885 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC40.11■■■■■ 4.01
BRD4O60885 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC40.07■■■■■ 4
BRD4O60885 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC40.05■■■■■ 4
BRD4O60885 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC40.03■■■■■ 4
BRD4O60885 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC40.03■■■■■ 4
BRD4O60885 MAPK3-202ENST00000322266 1743 ntTSL 5 BASIC40.01■■■■■ 4
BRD4O60885 CRIP2-201ENST00000329146 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40■■■■□ 3.99
BRD4O60885 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.93■■■■□ 3.98
BRD4O60885 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC39.92■■■■□ 3.98
BRD4O60885 C11orf84-201ENST00000294244 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.9■■■■□ 3.98
BRD4O60885 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC39.85■■■■□ 3.97
BRD4O60885 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC39.85■■■■□ 3.97
BRD4O60885 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC39.84■■■■□ 3.97
BRD4O60885 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.83■■■■□ 3.97
BRD4O60885 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC39.83■■■■□ 3.97
BRD4O60885 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC39.79■■■■□ 3.96
BRD4O60885 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC39.77■■■■□ 3.96
BRD4O60885 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.72■■■■□ 3.95
BRD4O60885 SLC25A10-203ENST00000545862 1911 ntTSL 1 (best) BASIC39.72■■■■□ 3.95
BRD4O60885 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC39.72■■■■□ 3.95
BRD4O60885 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC39.71■■■■□ 3.95
BRD4O60885 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC39.71■■■■□ 3.95
BRD4O60885 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC39.7■■■■□ 3.95
BRD4O60885 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC39.7■■■■□ 3.95
BRD4O60885 KIAA2013-203ENST00000616327 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC39.65■■■■□ 3.94
BRD4O60885 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC39.64■■■■□ 3.94
BRD4O60885 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC39.64■■■■□ 3.94
BRD4O60885 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC39.64■■■■□ 3.94
BRD4O60885 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC39.61■■■■□ 3.93
BRD4O60885 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC39.59■■■■□ 3.93
BRD4O60885 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC39.58■■■■□ 3.93
BRD4O60885 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC39.58■■■■□ 3.93
BRD4O60885 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC39.55■■■■□ 3.92
BRD4O60885 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC39.53■■■■□ 3.92
BRD4O60885 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC39.5■■■■□ 3.91
BRD4O60885 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC39.48■■■■□ 3.91
BRD4O60885 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC39.44■■■■□ 3.9
BRD4O60885 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC39.41■■■■□ 3.9
BRD4O60885 TPRG1L-201ENST00000344579 2189 ntTSL 1 (best) BASIC39.4■■■■□ 3.9
BRD4O60885 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC39.39■■■■□ 3.9
BRD4O60885 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC39.39■■■■□ 3.9
BRD4O60885 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC39.38■■■■□ 3.89
BRD4O60885 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC39.38■■■■□ 3.89
BRD4O60885 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC39.37■■■■□ 3.89
BRD4O60885 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC39.37■■■■□ 3.89
BRD4O60885 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.36■■■■□ 3.89
BRD4O60885 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.34■■■■□ 3.89
BRD4O60885 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC39.33■■■■□ 3.89
BRD4O60885 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC39.32■■■■□ 3.89
BRD4O60885 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC39.29■■■■□ 3.88
BRD4O60885 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC39.29■■■■□ 3.88
BRD4O60885 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC39.29■■■■□ 3.88
BRD4O60885 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.28■■■■□ 3.88
BRD4O60885 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.27■■■■□ 3.88
BRD4O60885 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC39.24■■■■□ 3.87
BRD4O60885 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.21■■■■□ 3.87
BRD4O60885 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC39.21■■■■□ 3.87
BRD4O60885 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC39.2■■■■□ 3.87
BRD4O60885 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC39.19■■■■□ 3.86
BRD4O60885 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.17■■■■□ 3.86
BRD4O60885 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC39.14■■■■□ 3.86
BRD4O60885 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC39.13■■■■□ 3.85
BRD4O60885 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC39.11■■■■□ 3.85
BRD4O60885 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.1■■■■□ 3.85
BRD4O60885 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC39.09■■■■□ 3.85
BRD4O60885 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC39.08■■■■□ 3.85
BRD4O60885 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC39.04■■■■□ 3.84
BRD4O60885 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC39.01■■■■□ 3.83
BRD4O60885 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.99■■■■□ 3.83
BRD4O60885 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC38.99■■■■□ 3.83
BRD4O60885 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC38.99■■■■□ 3.83
BRD4O60885 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.97■■■■□ 3.83
BRD4O60885 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.97■■■■□ 3.83
BRD4O60885 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC38.93■■■■□ 3.82
BRD4O60885 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC38.93■■■■□ 3.82
BRD4O60885 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.86■■■■□ 3.81
BRD4O60885 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.84■■■■□ 3.81
BRD4O60885 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC38.84■■■■□ 3.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.1 ms