Protein–RNA interactions for Protein: O60239

SH3BP5, SH3 domain-binding protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 455 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP5O60239 MPND-207ENST00000599840 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29■■■□□ 2.23
SH3BP5O60239 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC28.97■■■□□ 2.23
SH3BP5O60239 CCM2-219ENST00000544363 1620 ntTSL 3 BASIC28.97■■■□□ 2.23
SH3BP5O60239 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.91■■■□□ 2.22
SH3BP5O60239 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
SH3BP5O60239 FOXD1-202ENST00000615637 2272 ntAPPRIS P1 BASIC28.89■■■□□ 2.21
SH3BP5O60239 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
SH3BP5O60239 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC28.87■■■□□ 2.21
SH3BP5O60239 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC28.87■■■□□ 2.21
SH3BP5O60239 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC28.85■■■□□ 2.21
SH3BP5O60239 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
SH3BP5O60239 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
SH3BP5O60239 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
SH3BP5O60239 ACOT7-209ENST00000545482 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
SH3BP5O60239 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC28.81■■■□□ 2.2
SH3BP5O60239 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.81■■■□□ 2.2
SH3BP5O60239 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC28.81■■■□□ 2.2
SH3BP5O60239 TRIP10-202ENST00000313285 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
SH3BP5O60239 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC28.78■■■□□ 2.2
SH3BP5O60239 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC28.76■■■□□ 2.19
SH3BP5O60239 NT5DC2-202ENST00000422318 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.75■■■□□ 2.19
SH3BP5O60239 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.75■■■□□ 2.19
SH3BP5O60239 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC28.75■■■□□ 2.19
SH3BP5O60239 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
SH3BP5O60239 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC28.74■■■□□ 2.19
SH3BP5O60239 PWWP2B-202ENST00000631148 2013 ntTSL 5 BASIC28.74■■■□□ 2.19
SH3BP5O60239 TGIF1-202ENST00000343820 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
SH3BP5O60239 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC28.69■■■□□ 2.18
SH3BP5O60239 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC28.69■■■□□ 2.18
SH3BP5O60239 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
SH3BP5O60239 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.66■■■□□ 2.18
SH3BP5O60239 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC28.64■■■□□ 2.18
SH3BP5O60239 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
SH3BP5O60239 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
SH3BP5O60239 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
SH3BP5O60239 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
SH3BP5O60239 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC28.5■■■□□ 2.15
SH3BP5O60239 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
SH3BP5O60239 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC28.43■■■□□ 2.14
SH3BP5O60239 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
SH3BP5O60239 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC28.41■■■□□ 2.14
SH3BP5O60239 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC28.41■■■□□ 2.14
SH3BP5O60239 C11orf63-202ENST00000307257 1964 ntTSL 2 BASIC28.4■■■□□ 2.14
SH3BP5O60239 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
SH3BP5O60239 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
SH3BP5O60239 KHSRP-213ENST00000619396 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
SH3BP5O60239 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC28.37■■■□□ 2.13
SH3BP5O60239 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC28.37■■■□□ 2.13
SH3BP5O60239 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
SH3BP5O60239 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC28.32■■■□□ 2.12
SH3BP5O60239 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC28.3■■■□□ 2.12
SH3BP5O60239 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
SH3BP5O60239 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
SH3BP5O60239 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC28.29■■■□□ 2.12
SH3BP5O60239 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC28.26■■■□□ 2.11
SH3BP5O60239 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
SH3BP5O60239 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
SH3BP5O60239 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
SH3BP5O60239 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
SH3BP5O60239 ILK-212ENST00000532063 1617 ntTSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
SH3BP5O60239 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
SH3BP5O60239 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.2■■■□□ 2.1
SH3BP5O60239 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
SH3BP5O60239 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
SH3BP5O60239 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC28.18■■■□□ 2.1
SH3BP5O60239 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
SH3BP5O60239 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
SH3BP5O60239 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
SH3BP5O60239 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.17■■■□□ 2.1
SH3BP5O60239 C11orf84-201ENST00000294244 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
SH3BP5O60239 HAPLN2-201ENST00000255039 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
SH3BP5O60239 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.1
SH3BP5O60239 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
SH3BP5O60239 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
SH3BP5O60239 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
SH3BP5O60239 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
SH3BP5O60239 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC28.11■■■□□ 2.09
SH3BP5O60239 INO80B-WBP1-202ENST00000452361 2040 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
SH3BP5O60239 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
SH3BP5O60239 B4GALT2-203ENST00000372324 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
SH3BP5O60239 PABPN1-201ENST00000216727 2001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
SH3BP5O60239 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
SH3BP5O60239 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC28.06■■■□□ 2.08
SH3BP5O60239 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
SH3BP5O60239 MAPK3-201ENST00000263025 1861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
SH3BP5O60239 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
SH3BP5O60239 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
SH3BP5O60239 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
SH3BP5O60239 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.93■■■□□ 2.06
SH3BP5O60239 CRIP2-201ENST00000329146 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
SH3BP5O60239 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
SH3BP5O60239 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC27.86■■■□□ 2.05
SH3BP5O60239 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
SH3BP5O60239 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
SH3BP5O60239 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
SH3BP5O60239 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
SH3BP5O60239 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
SH3BP5O60239 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC27.83■■■□□ 2.05
SH3BP5O60239 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
SH3BP5O60239 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 79.5 ms