Protein–RNA interactions for Protein: O43896

KIF1C, Kinesin-like protein KIF1C, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,103 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KIF1CO43896 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
KIF1CO43896 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
KIF1CO43896 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
KIF1CO43896 NT5DC2-202ENST00000422318 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.8■■■□□ 2.2
KIF1CO43896 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC28.79■■■□□ 2.2
KIF1CO43896 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
KIF1CO43896 PWWP2B-202ENST00000631148 2013 ntTSL 5 BASIC28.79■■■□□ 2.2
KIF1CO43896 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC28.75■■■□□ 2.19
KIF1CO43896 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
KIF1CO43896 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
KIF1CO43896 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
KIF1CO43896 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
KIF1CO43896 TRIP10-202ENST00000313285 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
KIF1CO43896 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC28.58■■■□□ 2.17
KIF1CO43896 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
KIF1CO43896 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
KIF1CO43896 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
KIF1CO43896 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
KIF1CO43896 B4GALT2-203ENST00000372324 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
KIF1CO43896 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC28.47■■■□□ 2.15
KIF1CO43896 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
KIF1CO43896 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
KIF1CO43896 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
KIF1CO43896 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
KIF1CO43896 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC28.39■■■□□ 2.14
KIF1CO43896 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
KIF1CO43896 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
KIF1CO43896 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC28.31■■■□□ 2.12
KIF1CO43896 SLC25A10-203ENST00000545862 1911 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
KIF1CO43896 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
KIF1CO43896 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
KIF1CO43896 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
KIF1CO43896 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
KIF1CO43896 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
KIF1CO43896 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.11
KIF1CO43896 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC28.25■■■□□ 2.11
KIF1CO43896 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC28.25■■■□□ 2.11
KIF1CO43896 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
KIF1CO43896 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
KIF1CO43896 ILK-212ENST00000532063 1617 ntTSL 2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
KIF1CO43896 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
KIF1CO43896 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
KIF1CO43896 CRIP2-201ENST00000329146 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
KIF1CO43896 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC28.17■■■□□ 2.1
KIF1CO43896 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC28.17■■■□□ 2.1
KIF1CO43896 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
KIF1CO43896 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
KIF1CO43896 PABPN1-201ENST00000216727 2001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
KIF1CO43896 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
KIF1CO43896 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
KIF1CO43896 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
KIF1CO43896 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
KIF1CO43896 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC28.1■■■□□ 2.09
KIF1CO43896 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
KIF1CO43896 HAPLN2-201ENST00000255039 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
KIF1CO43896 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
KIF1CO43896 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
KIF1CO43896 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC28.08■■■□□ 2.09
KIF1CO43896 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
KIF1CO43896 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
KIF1CO43896 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC28.05■■■□□ 2.08
KIF1CO43896 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
KIF1CO43896 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
KIF1CO43896 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
KIF1CO43896 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
KIF1CO43896 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
KIF1CO43896 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
KIF1CO43896 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
KIF1CO43896 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.06
KIF1CO43896 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
KIF1CO43896 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
KIF1CO43896 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
KIF1CO43896 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
KIF1CO43896 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
KIF1CO43896 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
KIF1CO43896 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC27.87■■■□□ 2.05
KIF1CO43896 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
KIF1CO43896 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
KIF1CO43896 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
KIF1CO43896 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
KIF1CO43896 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
KIF1CO43896 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.79■■■□□ 2.04
KIF1CO43896 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
KIF1CO43896 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.04
KIF1CO43896 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC27.75■■■□□ 2.03
KIF1CO43896 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
KIF1CO43896 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
KIF1CO43896 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
KIF1CO43896 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC27.73■■■□□ 2.03
KIF1CO43896 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
KIF1CO43896 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.02
KIF1CO43896 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
KIF1CO43896 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
KIF1CO43896 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
KIF1CO43896 MAPK3-202ENST00000322266 1743 ntTSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
KIF1CO43896 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
KIF1CO43896 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC27.63■■■□□ 2.01
KIF1CO43896 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
KIF1CO43896 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
KIF1CO43896 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC27.59■■■□□ 2.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.7 ms