Protein–RNA interactions for Protein: O43365

HOXA3, Homeobox protein Hox-A3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 443 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXA3O43365 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
HOXA3O43365 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
HOXA3O43365 C11orf84-201ENST00000294244 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
HOXA3O43365 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
HOXA3O43365 ILK-212ENST00000532063 1617 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
HOXA3O43365 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
HOXA3O43365 TRIP10-202ENST00000313285 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
HOXA3O43365 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
HOXA3O43365 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
HOXA3O43365 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
HOXA3O43365 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
HOXA3O43365 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
HOXA3O43365 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
HOXA3O43365 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
HOXA3O43365 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
HOXA3O43365 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
HOXA3O43365 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC23.24■■□□□ 1.31
HOXA3O43365 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
HOXA3O43365 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
HOXA3O43365 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
HOXA3O43365 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
HOXA3O43365 HAPLN2-201ENST00000255039 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
HOXA3O43365 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
HOXA3O43365 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
HOXA3O43365 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
HOXA3O43365 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
HOXA3O43365 FOXD1-202ENST00000615637 2272 ntAPPRIS P1 BASIC23.1■■□□□ 1.29
HOXA3O43365 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
HOXA3O43365 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
HOXA3O43365 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
HOXA3O43365 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
HOXA3O43365 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
HOXA3O43365 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
HOXA3O43365 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
HOXA3O43365 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
HOXA3O43365 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
HOXA3O43365 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
HOXA3O43365 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
HOXA3O43365 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
HOXA3O43365 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
HOXA3O43365 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
HOXA3O43365 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
HOXA3O43365 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
HOXA3O43365 RAB12-201ENST00000329286 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
HOXA3O43365 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
HOXA3O43365 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
HOXA3O43365 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC22.93■■□□□ 1.26
HOXA3O43365 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
HOXA3O43365 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
HOXA3O43365 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
HOXA3O43365 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
HOXA3O43365 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
HOXA3O43365 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
HOXA3O43365 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
HOXA3O43365 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
HOXA3O43365 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
HOXA3O43365 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
HOXA3O43365 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
HOXA3O43365 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
HOXA3O43365 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
HOXA3O43365 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
HOXA3O43365 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
HOXA3O43365 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
HOXA3O43365 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
HOXA3O43365 TPRG1L-201ENST00000344579 2189 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
HOXA3O43365 MAPK3-202ENST00000322266 1743 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
HOXA3O43365 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
HOXA3O43365 PPP2CB-201ENST00000221138 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
HOXA3O43365 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
HOXA3O43365 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
HOXA3O43365 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
HOXA3O43365 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
HOXA3O43365 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
HOXA3O43365 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
HOXA3O43365 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
HOXA3O43365 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
HOXA3O43365 PABPN1-201ENST00000216727 2001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
HOXA3O43365 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
HOXA3O43365 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
HOXA3O43365 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
HOXA3O43365 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
HOXA3O43365 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
HOXA3O43365 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
HOXA3O43365 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
HOXA3O43365 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
HOXA3O43365 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
HOXA3O43365 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
HOXA3O43365 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
HOXA3O43365 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
HOXA3O43365 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
HOXA3O43365 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
HOXA3O43365 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
HOXA3O43365 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
HOXA3O43365 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
HOXA3O43365 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
HOXA3O43365 CRIP2-201ENST00000329146 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
HOXA3O43365 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
HOXA3O43365 B4GALT2-203ENST00000372324 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
HOXA3O43365 TGIF1-202ENST00000343820 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
HOXA3O43365 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63.8 ms