Protein–RNA interactions for Protein: O15172

PSPHP1, Putative phosphoserine phosphatase-like protein, humanhuman

Predictions only

Length 72 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSPHP1O15172 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
PSPHP1O15172 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
PSPHP1O15172 ZNF358-202ENST00000597229 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
PSPHP1O15172 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
PSPHP1O15172 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PSPHP1O15172 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PSPHP1O15172 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PSPHP1O15172 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
PSPHP1O15172 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PSPHP1O15172 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
PSPHP1O15172 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PSPHP1O15172 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
PSPHP1O15172 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PSPHP1O15172 SLC25A10-203ENST00000545862 1911 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PSPHP1O15172 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PSPHP1O15172 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PSPHP1O15172 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PSPHP1O15172 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PSPHP1O15172 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PSPHP1O15172 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PSPHP1O15172 TRIP10-202ENST00000313285 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PSPHP1O15172 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PSPHP1O15172 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PSPHP1O15172 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PSPHP1O15172 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PSPHP1O15172 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PSPHP1O15172 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PSPHP1O15172 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PSPHP1O15172 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PSPHP1O15172 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PSPHP1O15172 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PSPHP1O15172 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PSPHP1O15172 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PSPHP1O15172 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PSPHP1O15172 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
PSPHP1O15172 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PSPHP1O15172 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PSPHP1O15172 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
PSPHP1O15172 CRIP2-201ENST00000329146 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PSPHP1O15172 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
PSPHP1O15172 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
PSPHP1O15172 PABPN1-201ENST00000216727 2001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PSPHP1O15172 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PSPHP1O15172 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PSPHP1O15172 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PSPHP1O15172 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PSPHP1O15172 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PSPHP1O15172 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PSPHP1O15172 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
PSPHP1O15172 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PSPHP1O15172 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PSPHP1O15172 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PSPHP1O15172 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PSPHP1O15172 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
PSPHP1O15172 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
PSPHP1O15172 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
PSPHP1O15172 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
PSPHP1O15172 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
PSPHP1O15172 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
PSPHP1O15172 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
PSPHP1O15172 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
PSPHP1O15172 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
PSPHP1O15172 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
PSPHP1O15172 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
PSPHP1O15172 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
PSPHP1O15172 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PSPHP1O15172 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PSPHP1O15172 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
PSPHP1O15172 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PSPHP1O15172 HES6-203ENST00000409160 1600 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PSPHP1O15172 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PSPHP1O15172 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PSPHP1O15172 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PSPHP1O15172 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PSPHP1O15172 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PSPHP1O15172 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
PSPHP1O15172 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
PSPHP1O15172 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
PSPHP1O15172 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
PSPHP1O15172 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
PSPHP1O15172 KIAA2013-203ENST00000616327 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
PSPHP1O15172 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
PSPHP1O15172 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
PSPHP1O15172 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
PSPHP1O15172 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
PSPHP1O15172 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
PSPHP1O15172 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PSPHP1O15172 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PSPHP1O15172 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PSPHP1O15172 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PSPHP1O15172 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PSPHP1O15172 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PSPHP1O15172 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PSPHP1O15172 TCF15-201ENST00000246080 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PSPHP1O15172 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PSPHP1O15172 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
PSPHP1O15172 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PSPHP1O15172 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PSPHP1O15172 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PSPHP1O15172 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 7.5 ms