Protein–RNA interactions for Protein: O14817

TSPAN4, Tetraspanin-4, humanhuman

Predictions only

Length 238 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSPAN4O14817 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
TSPAN4O14817 OLFM1-208ENST00000392991 1057 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
TSPAN4O14817 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
TSPAN4O14817 KIAA2013-203ENST00000616327 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
TSPAN4O14817 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
TSPAN4O14817 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
TSPAN4O14817 ANKRD60-201ENST00000457363 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
TSPAN4O14817 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
TSPAN4O14817 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
TSPAN4O14817 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
TSPAN4O14817 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC23.73■■□□□ 1.39
TSPAN4O14817 TAF5L-202ENST00000366674 492 ntTSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
TSPAN4O14817 MPND-201ENST00000262966 1567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
TSPAN4O14817 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
TSPAN4O14817 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
TSPAN4O14817 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
TSPAN4O14817 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
TSPAN4O14817 NECTIN3-201ENST00000319792 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
TSPAN4O14817 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
TSPAN4O14817 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
TSPAN4O14817 PPP2CB-204ENST00000518564 691 ntTSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
TSPAN4O14817 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
TSPAN4O14817 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
TSPAN4O14817 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
TSPAN4O14817 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
TSPAN4O14817 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
TSPAN4O14817 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
TSPAN4O14817 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
TSPAN4O14817 MPND-207ENST00000599840 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
TSPAN4O14817 GIPC1-205ENST00000586027 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
TSPAN4O14817 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
TSPAN4O14817 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
TSPAN4O14817 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
TSPAN4O14817 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
TSPAN4O14817 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
TSPAN4O14817 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC23.46■■□□□ 1.35
TSPAN4O14817 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
TSPAN4O14817 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
TSPAN4O14817 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
TSPAN4O14817 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
TSPAN4O14817 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
TSPAN4O14817 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
TSPAN4O14817 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
TSPAN4O14817 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
TSPAN4O14817 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
TSPAN4O14817 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
TSPAN4O14817 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
TSPAN4O14817 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
TSPAN4O14817 CAPNS1-206ENST00000588815 1471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
TSPAN4O14817 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
TSPAN4O14817 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
TSPAN4O14817 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
TSPAN4O14817 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
TSPAN4O14817 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
TSPAN4O14817 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
TSPAN4O14817 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
TSPAN4O14817 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
TSPAN4O14817 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
TSPAN4O14817 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
TSPAN4O14817 HAGHL-201ENST00000341413 1701 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
TSPAN4O14817 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC23.31■■□□□ 1.32
TSPAN4O14817 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
TSPAN4O14817 SLC25A28-201ENST00000370495 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
TSPAN4O14817 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
TSPAN4O14817 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
TSPAN4O14817 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
TSPAN4O14817 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
TSPAN4O14817 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
TSPAN4O14817 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
TSPAN4O14817 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
TSPAN4O14817 NT5DC2-203ENST00000459839 1639 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
TSPAN4O14817 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
TSPAN4O14817 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
TSPAN4O14817 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
TSPAN4O14817 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
TSPAN4O14817 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
TSPAN4O14817 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
TSPAN4O14817 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
TSPAN4O14817 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
TSPAN4O14817 MAPK3-202ENST00000322266 1743 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
TSPAN4O14817 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
TSPAN4O14817 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
TSPAN4O14817 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
TSPAN4O14817 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
TSPAN4O14817 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
TSPAN4O14817 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
TSPAN4O14817 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
TSPAN4O14817 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
TSPAN4O14817 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
TSPAN4O14817 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
TSPAN4O14817 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
TSPAN4O14817 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
TSPAN4O14817 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
TSPAN4O14817 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
TSPAN4O14817 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
TSPAN4O14817 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
TSPAN4O14817 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
TSPAN4O14817 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
TSPAN4O14817 FAM149A-215ENST00000514153 2070 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
TSPAN4O14817 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32 ms