Protein–RNA interactions for Protein: B2RTY4

MYO9A, Unconventional myosin-IXa, humanhuman

Predictions only

Length 2,548 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MYO9AB2RTY4 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC25.61■■□□□ 1.69
MYO9AB2RTY4 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
MYO9AB2RTY4 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
MYO9AB2RTY4 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
MYO9AB2RTY4 UBE2M-201ENST00000253023 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
MYO9AB2RTY4 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
MYO9AB2RTY4 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
MYO9AB2RTY4 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
MYO9AB2RTY4 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
MYO9AB2RTY4 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
MYO9AB2RTY4 METRNL-201ENST00000320095 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
MYO9AB2RTY4 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
MYO9AB2RTY4 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC25.44■■□□□ 1.66
MYO9AB2RTY4 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
MYO9AB2RTY4 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC25.42■■□□□ 1.66
MYO9AB2RTY4 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC25.41■■□□□ 1.66
MYO9AB2RTY4 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
MYO9AB2RTY4 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
MYO9AB2RTY4 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
MYO9AB2RTY4 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
MYO9AB2RTY4 NKAIN4-203ENST00000370316 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
MYO9AB2RTY4 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
MYO9AB2RTY4 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
MYO9AB2RTY4 NT5DC2-203ENST00000459839 1639 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
MYO9AB2RTY4 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
MYO9AB2RTY4 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC25.26■■□□□ 1.63
MYO9AB2RTY4 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
MYO9AB2RTY4 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
MYO9AB2RTY4 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
MYO9AB2RTY4 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
MYO9AB2RTY4 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
MYO9AB2RTY4 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
MYO9AB2RTY4 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
MYO9AB2RTY4 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
MYO9AB2RTY4 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
MYO9AB2RTY4 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
MYO9AB2RTY4 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
MYO9AB2RTY4 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
MYO9AB2RTY4 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
MYO9AB2RTY4 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
MYO9AB2RTY4 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC25.11■■□□□ 1.61
MYO9AB2RTY4 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
MYO9AB2RTY4 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
MYO9AB2RTY4 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
MYO9AB2RTY4 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
MYO9AB2RTY4 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
MYO9AB2RTY4 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
MYO9AB2RTY4 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
MYO9AB2RTY4 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC25■■□□□ 1.59
MYO9AB2RTY4 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC24.99■■□□□ 1.59
MYO9AB2RTY4 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC24.96■■□□□ 1.59
MYO9AB2RTY4 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.95■■□□□ 1.59
MYO9AB2RTY4 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
MYO9AB2RTY4 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
MYO9AB2RTY4 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC24.91■■□□□ 1.58
MYO9AB2RTY4 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
MYO9AB2RTY4 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
MYO9AB2RTY4 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.57
MYO9AB2RTY4 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
MYO9AB2RTY4 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
MYO9AB2RTY4 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC24.84■■□□□ 1.57
MYO9AB2RTY4 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
MYO9AB2RTY4 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
MYO9AB2RTY4 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.83■■□□□ 1.57
MYO9AB2RTY4 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
MYO9AB2RTY4 NECTIN3-201ENST00000319792 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
MYO9AB2RTY4 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
MYO9AB2RTY4 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
MYO9AB2RTY4 CAPNS1-206ENST00000588815 1471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
MYO9AB2RTY4 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
MYO9AB2RTY4 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
MYO9AB2RTY4 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
MYO9AB2RTY4 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
MYO9AB2RTY4 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
MYO9AB2RTY4 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
MYO9AB2RTY4 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
MYO9AB2RTY4 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
MYO9AB2RTY4 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
MYO9AB2RTY4 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
MYO9AB2RTY4 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
MYO9AB2RTY4 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
MYO9AB2RTY4 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.54
MYO9AB2RTY4 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
MYO9AB2RTY4 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
MYO9AB2RTY4 SEPT3-204ENST00000406029 1866 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
MYO9AB2RTY4 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC24.68■■□□□ 1.54
MYO9AB2RTY4 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
MYO9AB2RTY4 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
MYO9AB2RTY4 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
MYO9AB2RTY4 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
MYO9AB2RTY4 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC24.64■■□□□ 1.54
MYO9AB2RTY4 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
MYO9AB2RTY4 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC24.63■■□□□ 1.53
MYO9AB2RTY4 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
MYO9AB2RTY4 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
MYO9AB2RTY4 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
MYO9AB2RTY4 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
MYO9AB2RTY4 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC24.58■■□□□ 1.52
MYO9AB2RTY4 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
MYO9AB2RTY4 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.4 ms