Protein–RNA interactions for Protein: A9Z1Z3

FER1L4, Fer-1-like protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 1,794 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FER1L4A9Z1Z3 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC44.65■■■■■ 4.74
FER1L4A9Z1Z3 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC44.63■■■■■ 4.73
FER1L4A9Z1Z3 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC44.62■■■■■ 4.73
FER1L4A9Z1Z3 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC44.61■■■■■ 4.73
FER1L4A9Z1Z3 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.58■■■■■ 4.73
FER1L4A9Z1Z3 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC44.55■■■■■ 4.72
FER1L4A9Z1Z3 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.51■■■■■ 4.72
FER1L4A9Z1Z3 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.49■■■■■ 4.71
FER1L4A9Z1Z3 NECTIN3-201ENST00000319792 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC44.48■■■■■ 4.71
FER1L4A9Z1Z3 CAPNS1-206ENST00000588815 1471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC44.47■■■■■ 4.71
FER1L4A9Z1Z3 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC44.46■■■■■ 4.71
FER1L4A9Z1Z3 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC44.38■■■■■ 4.69
FER1L4A9Z1Z3 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC44.33■■■■■ 4.69
FER1L4A9Z1Z3 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC44.28■■■■■ 4.68
FER1L4A9Z1Z3 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC44.2■■■■■ 4.67
FER1L4A9Z1Z3 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC44.15■■■■■ 4.66
FER1L4A9Z1Z3 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC44.12■■■■■ 4.65
FER1L4A9Z1Z3 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC44.03■■■■■ 4.64
FER1L4A9Z1Z3 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.98■■■■■ 4.63
FER1L4A9Z1Z3 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC43.94■■■■■ 4.62
FER1L4A9Z1Z3 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC43.93■■■■■ 4.62
FER1L4A9Z1Z3 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.93■■■■■ 4.62
FER1L4A9Z1Z3 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.9■■■■■ 4.62
FER1L4A9Z1Z3 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.89■■■■■ 4.62
FER1L4A9Z1Z3 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC43.88■■■■■ 4.62
FER1L4A9Z1Z3 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC43.88■■■■■ 4.62
FER1L4A9Z1Z3 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC43.87■■■■■ 4.61
FER1L4A9Z1Z3 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC43.86■■■■■ 4.61
FER1L4A9Z1Z3 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.85■■■■■ 4.61
FER1L4A9Z1Z3 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.83■■■■■ 4.61
FER1L4A9Z1Z3 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC43.79■■■■■ 4.6
FER1L4A9Z1Z3 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC43.78■■■■■ 4.6
FER1L4A9Z1Z3 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC43.77■■■■■ 4.6
FER1L4A9Z1Z3 SEPT3-204ENST00000406029 1866 ntTSL 5 BASIC43.76■■■■■ 4.6
FER1L4A9Z1Z3 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC43.75■■■■■ 4.59
FER1L4A9Z1Z3 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC43.69■■■■■ 4.59
FER1L4A9Z1Z3 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC43.65■■■■■ 4.58
FER1L4A9Z1Z3 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC43.64■■■■■ 4.58
FER1L4A9Z1Z3 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.64■■■■■ 4.58
FER1L4A9Z1Z3 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC43.63■■■■■ 4.57
FER1L4A9Z1Z3 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC43.62■■■■■ 4.57
FER1L4A9Z1Z3 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC43.57■■■■■ 4.56
FER1L4A9Z1Z3 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.53■■■■■ 4.56
FER1L4A9Z1Z3 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC43.52■■■■■ 4.56
FER1L4A9Z1Z3 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC43.51■■■■■ 4.56
FER1L4A9Z1Z3 NT5DC2-202ENST00000422318 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC43.49■■■■■ 4.55
FER1L4A9Z1Z3 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.47■■■■■ 4.55
FER1L4A9Z1Z3 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.42■■■■■ 4.54
FER1L4A9Z1Z3 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC43.37■■■■■ 4.53
FER1L4A9Z1Z3 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC43.37■■■■■ 4.53
FER1L4A9Z1Z3 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC43.37■■■■■ 4.53
FER1L4A9Z1Z3 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC43.35■■■■■ 4.53
FER1L4A9Z1Z3 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC43.33■■■■■ 4.53
FER1L4A9Z1Z3 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC43.31■■■■■ 4.52
FER1L4A9Z1Z3 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC43.28■■■■■ 4.52
FER1L4A9Z1Z3 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC43.28■■■■■ 4.52
FER1L4A9Z1Z3 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC43.26■■■■■ 4.52
FER1L4A9Z1Z3 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.22■■■■■ 4.51
FER1L4A9Z1Z3 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC43.21■■■■■ 4.51
FER1L4A9Z1Z3 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.2■■■■■ 4.51
FER1L4A9Z1Z3 FAM149A-215ENST00000514153 2070 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC43.2■■■■■ 4.51
FER1L4A9Z1Z3 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.19■■■■■ 4.5
FER1L4A9Z1Z3 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.16■■■■■ 4.5
FER1L4A9Z1Z3 PWWP2B-202ENST00000631148 2013 ntTSL 5 BASIC43.16■■■■■ 4.5
FER1L4A9Z1Z3 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC43.15■■■■■ 4.5
FER1L4A9Z1Z3 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC43.12■■■■■ 4.49
FER1L4A9Z1Z3 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC43.08■■■■■ 4.49
FER1L4A9Z1Z3 CCM2-219ENST00000544363 1620 ntTSL 3 BASIC43.05■■■■■ 4.48
FER1L4A9Z1Z3 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC43.04■■■■■ 4.48
FER1L4A9Z1Z3 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC43.03■■■■■ 4.48
FER1L4A9Z1Z3 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC43.03■■■■■ 4.48
FER1L4A9Z1Z3 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.02■■■■■ 4.48
FER1L4A9Z1Z3 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.01■■■■■ 4.48
FER1L4A9Z1Z3 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC42.99■■■■■ 4.47
FER1L4A9Z1Z3 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC42.98■■■■■ 4.47
FER1L4A9Z1Z3 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC42.95■■■■■ 4.47
FER1L4A9Z1Z3 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.95■■■■■ 4.47
FER1L4A9Z1Z3 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC42.92■■■■■ 4.46
FER1L4A9Z1Z3 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC42.9■■■■■ 4.46
FER1L4A9Z1Z3 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC42.89■■■■■ 4.46
FER1L4A9Z1Z3 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC42.88■■■■■ 4.46
FER1L4A9Z1Z3 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC42.88■■■■■ 4.46
FER1L4A9Z1Z3 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC42.81■■■■■ 4.44
FER1L4A9Z1Z3 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC42.8■■■■■ 4.44
FER1L4A9Z1Z3 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.8■■■■■ 4.44
FER1L4A9Z1Z3 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC42.78■■■■■ 4.44
FER1L4A9Z1Z3 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.75■■■■■ 4.43
FER1L4A9Z1Z3 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.75■■■■■ 4.43
FER1L4A9Z1Z3 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC42.75■■■■■ 4.43
FER1L4A9Z1Z3 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC42.75■■■■■ 4.43
FER1L4A9Z1Z3 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC42.75■■■■■ 4.43
FER1L4A9Z1Z3 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC42.74■■■■■ 4.43
FER1L4A9Z1Z3 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC42.73■■■■■ 4.43
FER1L4A9Z1Z3 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC42.73■■■■■ 4.43
FER1L4A9Z1Z3 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC42.72■■■■■ 4.43
FER1L4A9Z1Z3 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC42.7■■■■■ 4.43
FER1L4A9Z1Z3 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC42.63■■■■■ 4.42
FER1L4A9Z1Z3 MPND-207ENST00000599840 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC42.59■■■■■ 4.41
FER1L4A9Z1Z3 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC42.59■■■■■ 4.41
FER1L4A9Z1Z3 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC42.56■■■■■ 4.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.8 ms