Protein–RNA interactions for Protein: A0A0B4J277

TRAV22, T-cell receptor alpha variable 22 (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 110 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAV22A0A0B4J277 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
TRAV22A0A0B4J277 HAGHL-201ENST00000341413 1701 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
TRAV22A0A0B4J277 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
TRAV22A0A0B4J277 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
TRAV22A0A0B4J277 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
TRAV22A0A0B4J277 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TRAV22A0A0B4J277 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TRAV22A0A0B4J277 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TRAV22A0A0B4J277 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TRAV22A0A0B4J277 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
TRAV22A0A0B4J277 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TRAV22A0A0B4J277 HAPLN2-201ENST00000255039 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TRAV22A0A0B4J277 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TRAV22A0A0B4J277 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TRAV22A0A0B4J277 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TRAV22A0A0B4J277 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TRAV22A0A0B4J277 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
TRAV22A0A0B4J277 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
TRAV22A0A0B4J277 ILK-212ENST00000532063 1617 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
TRAV22A0A0B4J277 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
TRAV22A0A0B4J277 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
TRAV22A0A0B4J277 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
TRAV22A0A0B4J277 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
TRAV22A0A0B4J277 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
TRAV22A0A0B4J277 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
TRAV22A0A0B4J277 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
TRAV22A0A0B4J277 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
TRAV22A0A0B4J277 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
TRAV22A0A0B4J277 METRNL-201ENST00000320095 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
TRAV22A0A0B4J277 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
TRAV22A0A0B4J277 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
TRAV22A0A0B4J277 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
TRAV22A0A0B4J277 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
TRAV22A0A0B4J277 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
TRAV22A0A0B4J277 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
TRAV22A0A0B4J277 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
TRAV22A0A0B4J277 PPP1CA-203ENST00000376745 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
TRAV22A0A0B4J277 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
TRAV22A0A0B4J277 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
TRAV22A0A0B4J277 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
TRAV22A0A0B4J277 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
TRAV22A0A0B4J277 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
TRAV22A0A0B4J277 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
TRAV22A0A0B4J277 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
TRAV22A0A0B4J277 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
TRAV22A0A0B4J277 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
TRAV22A0A0B4J277 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
TRAV22A0A0B4J277 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TRAV22A0A0B4J277 NT5DC2-203ENST00000459839 1639 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TRAV22A0A0B4J277 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
TRAV22A0A0B4J277 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
TRAV22A0A0B4J277 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
TRAV22A0A0B4J277 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
TRAV22A0A0B4J277 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
TRAV22A0A0B4J277 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
TRAV22A0A0B4J277 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
TRAV22A0A0B4J277 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
TRAV22A0A0B4J277 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TRAV22A0A0B4J277 ZFYVE21-201ENST00000216602 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
TRAV22A0A0B4J277 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TRAV22A0A0B4J277 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TRAV22A0A0B4J277 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TRAV22A0A0B4J277 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TRAV22A0A0B4J277 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TRAV22A0A0B4J277 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
TRAV22A0A0B4J277 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TRAV22A0A0B4J277 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TRAV22A0A0B4J277 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TRAV22A0A0B4J277 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
TRAV22A0A0B4J277 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TRAV22A0A0B4J277 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TRAV22A0A0B4J277 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TRAV22A0A0B4J277 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TRAV22A0A0B4J277 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TRAV22A0A0B4J277 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TRAV22A0A0B4J277 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TRAV22A0A0B4J277 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TRAV22A0A0B4J277 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TRAV22A0A0B4J277 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TRAV22A0A0B4J277 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TRAV22A0A0B4J277 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TRAV22A0A0B4J277 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TRAV22A0A0B4J277 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TRAV22A0A0B4J277 NT5DC2-202ENST00000422318 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
TRAV22A0A0B4J277 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
TRAV22A0A0B4J277 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TRAV22A0A0B4J277 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TRAV22A0A0B4J277 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TRAV22A0A0B4J277 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TRAV22A0A0B4J277 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TRAV22A0A0B4J277 PWWP2B-202ENST00000631148 2013 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
TRAV22A0A0B4J277 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
TRAV22A0A0B4J277 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
TRAV22A0A0B4J277 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
TRAV22A0A0B4J277 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
TRAV22A0A0B4J277 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
TRAV22A0A0B4J277 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
TRAV22A0A0B4J277 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
TRAV22A0A0B4J277 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TRAV22A0A0B4J277 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.8 ms