Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y678

COPG1, Coatomer subunit gamma-1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 874 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COPG1Q9Y678 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
COPG1Q9Y678 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
COPG1Q9Y678 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
COPG1Q9Y678 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
COPG1Q9Y678 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
COPG1Q9Y678 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
COPG1Q9Y678 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
COPG1Q9Y678 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
COPG1Q9Y678 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
COPG1Q9Y678 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
COPG1Q9Y678 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
COPG1Q9Y678 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
COPG1Q9Y678 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
COPG1Q9Y678 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
COPG1Q9Y678 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
COPG1Q9Y678 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
COPG1Q9Y678 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
COPG1Q9Y678 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
COPG1Q9Y678 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
COPG1Q9Y678 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
COPG1Q9Y678 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
COPG1Q9Y678 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
COPG1Q9Y678 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
COPG1Q9Y678 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
COPG1Q9Y678 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
COPG1Q9Y678 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
COPG1Q9Y678 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
COPG1Q9Y678 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
COPG1Q9Y678 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
COPG1Q9Y678 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
COPG1Q9Y678 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
COPG1Q9Y678 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
COPG1Q9Y678 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
COPG1Q9Y678 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
COPG1Q9Y678 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
COPG1Q9Y678 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
COPG1Q9Y678 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
COPG1Q9Y678 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
COPG1Q9Y678 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
COPG1Q9Y678 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
COPG1Q9Y678 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
COPG1Q9Y678 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
COPG1Q9Y678 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
COPG1Q9Y678 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
COPG1Q9Y678 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
COPG1Q9Y678 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
COPG1Q9Y678 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
COPG1Q9Y678 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
COPG1Q9Y678 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
COPG1Q9Y678 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
COPG1Q9Y678 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
COPG1Q9Y678 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
COPG1Q9Y678 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
COPG1Q9Y678 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
COPG1Q9Y678 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
COPG1Q9Y678 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
COPG1Q9Y678 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
COPG1Q9Y678 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
COPG1Q9Y678 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC23.02■■□□□ 1.28
COPG1Q9Y678 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
COPG1Q9Y678 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
COPG1Q9Y678 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
COPG1Q9Y678 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
COPG1Q9Y678 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
COPG1Q9Y678 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
COPG1Q9Y678 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
COPG1Q9Y678 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
COPG1Q9Y678 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
COPG1Q9Y678 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
COPG1Q9Y678 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
COPG1Q9Y678 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
COPG1Q9Y678 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
COPG1Q9Y678 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
COPG1Q9Y678 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
COPG1Q9Y678 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
COPG1Q9Y678 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
COPG1Q9Y678 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
COPG1Q9Y678 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
COPG1Q9Y678 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
COPG1Q9Y678 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
COPG1Q9Y678 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
COPG1Q9Y678 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
COPG1Q9Y678 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
COPG1Q9Y678 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
COPG1Q9Y678 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
COPG1Q9Y678 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
COPG1Q9Y678 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
COPG1Q9Y678 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC22.98■■□□□ 1.27
COPG1Q9Y678 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
COPG1Q9Y678 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
COPG1Q9Y678 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
COPG1Q9Y678 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
COPG1Q9Y678 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
COPG1Q9Y678 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC22.98■■□□□ 1.27
COPG1Q9Y678 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
COPG1Q9Y678 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
COPG1Q9Y678 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
COPG1Q9Y678 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
COPG1Q9Y678 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
COPG1Q9Y678 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.2 ms