Protein–RNA interactions for Protein: Q9NYV4

CDK12, Cyclin-dependent kinase 12, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,490 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK12Q9NYV4 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC32.58■■■□□ 2.81
CDK12Q9NYV4 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.58■■■□□ 2.81
CDK12Q9NYV4 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC32.57■■■□□ 2.8
CDK12Q9NYV4 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC32.57■■■□□ 2.8
CDK12Q9NYV4 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.57■■■□□ 2.8
CDK12Q9NYV4 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.57■■■□□ 2.8
CDK12Q9NYV4 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC32.57■■■□□ 2.8
CDK12Q9NYV4 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.57■■■□□ 2.8
CDK12Q9NYV4 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.56■■■□□ 2.8
CDK12Q9NYV4 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC32.56■■■□□ 2.8
CDK12Q9NYV4 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC32.56■■■□□ 2.8
CDK12Q9NYV4 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC32.56■■■□□ 2.8
CDK12Q9NYV4 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC32.55■■■□□ 2.8
CDK12Q9NYV4 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.55■■■□□ 2.8
CDK12Q9NYV4 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC32.55■■■□□ 2.8
CDK12Q9NYV4 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC32.55■■■□□ 2.8
CDK12Q9NYV4 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.55■■■□□ 2.8
CDK12Q9NYV4 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.55■■■□□ 2.8
CDK12Q9NYV4 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC32.55■■■□□ 2.8
CDK12Q9NYV4 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.54■■■□□ 2.8
CDK12Q9NYV4 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC32.54■■■□□ 2.8
CDK12Q9NYV4 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC32.54■■■□□ 2.8
CDK12Q9NYV4 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.54■■■□□ 2.8
CDK12Q9NYV4 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.54■■■□□ 2.8
CDK12Q9NYV4 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.54■■■□□ 2.8
CDK12Q9NYV4 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC32.54■■■□□ 2.8
CDK12Q9NYV4 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC32.54■■■□□ 2.8
CDK12Q9NYV4 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC32.54■■■□□ 2.8
CDK12Q9NYV4 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.53■■■□□ 2.8
CDK12Q9NYV4 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC32.53■■■□□ 2.8
CDK12Q9NYV4 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC32.53■■■□□ 2.8
CDK12Q9NYV4 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC32.53■■■□□ 2.8
CDK12Q9NYV4 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.53■■■□□ 2.8
CDK12Q9NYV4 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC32.52■■■□□ 2.8
CDK12Q9NYV4 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC32.51■■■□□ 2.8
CDK12Q9NYV4 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.51■■■□□ 2.79
CDK12Q9NYV4 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC32.51■■■□□ 2.79
CDK12Q9NYV4 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.51■■■□□ 2.79
CDK12Q9NYV4 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC32.5■■■□□ 2.79
CDK12Q9NYV4 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.5■■■□□ 2.79
CDK12Q9NYV4 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC32.49■■■□□ 2.79
CDK12Q9NYV4 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC32.49■■■□□ 2.79
CDK12Q9NYV4 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC32.49■■■□□ 2.79
CDK12Q9NYV4 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC32.49■■■□□ 2.79
CDK12Q9NYV4 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC32.49■■■□□ 2.79
CDK12Q9NYV4 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.49■■■□□ 2.79
CDK12Q9NYV4 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.48■■■□□ 2.79
CDK12Q9NYV4 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC32.48■■■□□ 2.79
CDK12Q9NYV4 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC32.48■■■□□ 2.79
CDK12Q9NYV4 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.48■■■□□ 2.79
CDK12Q9NYV4 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC32.48■■■□□ 2.79
CDK12Q9NYV4 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC32.48■■■□□ 2.79
CDK12Q9NYV4 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC32.47■■■□□ 2.79
CDK12Q9NYV4 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC32.47■■■□□ 2.79
CDK12Q9NYV4 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.47■■■□□ 2.79
CDK12Q9NYV4 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC32.46■■■□□ 2.79
CDK12Q9NYV4 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.46■■■□□ 2.79
CDK12Q9NYV4 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC32.46■■■□□ 2.79
CDK12Q9NYV4 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC32.46■■■□□ 2.79
CDK12Q9NYV4 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC32.46■■■□□ 2.79
CDK12Q9NYV4 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.46■■■□□ 2.79
CDK12Q9NYV4 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.46■■■□□ 2.79
CDK12Q9NYV4 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC32.45■■■□□ 2.79
CDK12Q9NYV4 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.45■■■□□ 2.79
CDK12Q9NYV4 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.44■■■□□ 2.78
CDK12Q9NYV4 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC32.44■■■□□ 2.78
CDK12Q9NYV4 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.44■■■□□ 2.78
CDK12Q9NYV4 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC32.44■■■□□ 2.78
CDK12Q9NYV4 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC32.44■■■□□ 2.78
CDK12Q9NYV4 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC32.44■■■□□ 2.78
CDK12Q9NYV4 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.44■■■□□ 2.78
CDK12Q9NYV4 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.43■■■□□ 2.78
CDK12Q9NYV4 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC32.43■■■□□ 2.78
CDK12Q9NYV4 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC32.43■■■□□ 2.78
CDK12Q9NYV4 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC32.43■■■□□ 2.78
CDK12Q9NYV4 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC32.43■■■□□ 2.78
CDK12Q9NYV4 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC32.43■■■□□ 2.78
CDK12Q9NYV4 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC32.43■■■□□ 2.78
CDK12Q9NYV4 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.43■■■□□ 2.78
CDK12Q9NYV4 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC32.42■■■□□ 2.78
CDK12Q9NYV4 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC32.42■■■□□ 2.78
CDK12Q9NYV4 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC32.42■■■□□ 2.78
CDK12Q9NYV4 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC32.42■■■□□ 2.78
CDK12Q9NYV4 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.41■■■□□ 2.78
CDK12Q9NYV4 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC32.41■■■□□ 2.78
CDK12Q9NYV4 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.41■■■□□ 2.78
CDK12Q9NYV4 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.41■■■□□ 2.78
CDK12Q9NYV4 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC32.41■■■□□ 2.78
CDK12Q9NYV4 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC32.41■■■□□ 2.78
CDK12Q9NYV4 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC32.4■■■□□ 2.78
CDK12Q9NYV4 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC32.4■■■□□ 2.78
CDK12Q9NYV4 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.4■■■□□ 2.78
CDK12Q9NYV4 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC32.4■■■□□ 2.78
CDK12Q9NYV4 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC32.4■■■□□ 2.78
CDK12Q9NYV4 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC32.39■■■□□ 2.78
CDK12Q9NYV4 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC32.39■■■□□ 2.78
CDK12Q9NYV4 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.38■■■□□ 2.77
CDK12Q9NYV4 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.38■■■□□ 2.77
CDK12Q9NYV4 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC32.38■■■□□ 2.77
CDK12Q9NYV4 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.38■■■□□ 2.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.8 ms