Protein–RNA interactions for Protein: Q9NY47

CACNA2D2, Voltage-dependent calcium channel subunit alpha-2/delta-2, humanhuman

Predictions only

Length 1,150 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNA2D2Q9NY47 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CACNA2D2Q9NY47 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CACNA2D2Q9NY47 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CACNA2D2Q9NY47 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CACNA2D2Q9NY47 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CACNA2D2Q9NY47 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CACNA2D2Q9NY47 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
CACNA2D2Q9NY47 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CACNA2D2Q9NY47 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CACNA2D2Q9NY47 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CACNA2D2Q9NY47 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CACNA2D2Q9NY47 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CACNA2D2Q9NY47 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CACNA2D2Q9NY47 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CACNA2D2Q9NY47 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
CACNA2D2Q9NY47 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CACNA2D2Q9NY47 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CACNA2D2Q9NY47 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CACNA2D2Q9NY47 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CACNA2D2Q9NY47 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CACNA2D2Q9NY47 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CACNA2D2Q9NY47 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CACNA2D2Q9NY47 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CACNA2D2Q9NY47 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CACNA2D2Q9NY47 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CACNA2D2Q9NY47 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CACNA2D2Q9NY47 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
CACNA2D2Q9NY47 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
CACNA2D2Q9NY47 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
CACNA2D2Q9NY47 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CACNA2D2Q9NY47 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CACNA2D2Q9NY47 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
CACNA2D2Q9NY47 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CACNA2D2Q9NY47 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CACNA2D2Q9NY47 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CACNA2D2Q9NY47 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CACNA2D2Q9NY47 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CACNA2D2Q9NY47 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC24.2■■□□□ 1.46
CACNA2D2Q9NY47 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CACNA2D2Q9NY47 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CACNA2D2Q9NY47 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CACNA2D2Q9NY47 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CACNA2D2Q9NY47 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CACNA2D2Q9NY47 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CACNA2D2Q9NY47 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
CACNA2D2Q9NY47 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CACNA2D2Q9NY47 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CACNA2D2Q9NY47 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CACNA2D2Q9NY47 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CACNA2D2Q9NY47 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CACNA2D2Q9NY47 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CACNA2D2Q9NY47 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CACNA2D2Q9NY47 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CACNA2D2Q9NY47 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
CACNA2D2Q9NY47 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CACNA2D2Q9NY47 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CACNA2D2Q9NY47 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CACNA2D2Q9NY47 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CACNA2D2Q9NY47 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CACNA2D2Q9NY47 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CACNA2D2Q9NY47 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CACNA2D2Q9NY47 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CACNA2D2Q9NY47 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CACNA2D2Q9NY47 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CACNA2D2Q9NY47 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CACNA2D2Q9NY47 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CACNA2D2Q9NY47 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CACNA2D2Q9NY47 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CACNA2D2Q9NY47 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CACNA2D2Q9NY47 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CACNA2D2Q9NY47 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CACNA2D2Q9NY47 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CACNA2D2Q9NY47 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CACNA2D2Q9NY47 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CACNA2D2Q9NY47 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CACNA2D2Q9NY47 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CACNA2D2Q9NY47 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CACNA2D2Q9NY47 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CACNA2D2Q9NY47 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CACNA2D2Q9NY47 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CACNA2D2Q9NY47 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
CACNA2D2Q9NY47 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CACNA2D2Q9NY47 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
CACNA2D2Q9NY47 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
CACNA2D2Q9NY47 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CACNA2D2Q9NY47 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CACNA2D2Q9NY47 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
CACNA2D2Q9NY47 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
CACNA2D2Q9NY47 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
CACNA2D2Q9NY47 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
CACNA2D2Q9NY47 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
CACNA2D2Q9NY47 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
CACNA2D2Q9NY47 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CACNA2D2Q9NY47 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CACNA2D2Q9NY47 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CACNA2D2Q9NY47 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CACNA2D2Q9NY47 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CACNA2D2Q9NY47 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CACNA2D2Q9NY47 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
CACNA2D2Q9NY47 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24 ms