Protein–RNA interactions for Protein: Q9NS62

THSD1, Thrombospondin type-1 domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 852 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
THSD1Q9NS62 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
THSD1Q9NS62 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC22.97■■□□□ 1.27
THSD1Q9NS62 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
THSD1Q9NS62 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
THSD1Q9NS62 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
THSD1Q9NS62 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
THSD1Q9NS62 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
THSD1Q9NS62 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
THSD1Q9NS62 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
THSD1Q9NS62 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
THSD1Q9NS62 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
THSD1Q9NS62 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
THSD1Q9NS62 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
THSD1Q9NS62 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
THSD1Q9NS62 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
THSD1Q9NS62 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
THSD1Q9NS62 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
THSD1Q9NS62 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
THSD1Q9NS62 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
THSD1Q9NS62 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
THSD1Q9NS62 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
THSD1Q9NS62 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
THSD1Q9NS62 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
THSD1Q9NS62 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
THSD1Q9NS62 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
THSD1Q9NS62 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
THSD1Q9NS62 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
THSD1Q9NS62 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
THSD1Q9NS62 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
THSD1Q9NS62 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
THSD1Q9NS62 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
THSD1Q9NS62 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
THSD1Q9NS62 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
THSD1Q9NS62 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
THSD1Q9NS62 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
THSD1Q9NS62 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
THSD1Q9NS62 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
THSD1Q9NS62 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
THSD1Q9NS62 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
THSD1Q9NS62 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
THSD1Q9NS62 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
THSD1Q9NS62 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
THSD1Q9NS62 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC22.9■■□□□ 1.26
THSD1Q9NS62 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
THSD1Q9NS62 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
THSD1Q9NS62 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
THSD1Q9NS62 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
THSD1Q9NS62 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
THSD1Q9NS62 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
THSD1Q9NS62 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
THSD1Q9NS62 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
THSD1Q9NS62 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
THSD1Q9NS62 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
THSD1Q9NS62 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
THSD1Q9NS62 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
THSD1Q9NS62 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
THSD1Q9NS62 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
THSD1Q9NS62 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
THSD1Q9NS62 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
THSD1Q9NS62 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
THSD1Q9NS62 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
THSD1Q9NS62 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC22.88■■□□□ 1.25
THSD1Q9NS62 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
THSD1Q9NS62 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
THSD1Q9NS62 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
THSD1Q9NS62 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
THSD1Q9NS62 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
THSD1Q9NS62 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
THSD1Q9NS62 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
THSD1Q9NS62 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC22.87■■□□□ 1.25
THSD1Q9NS62 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
THSD1Q9NS62 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
THSD1Q9NS62 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
THSD1Q9NS62 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
THSD1Q9NS62 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
THSD1Q9NS62 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
THSD1Q9NS62 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
THSD1Q9NS62 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
THSD1Q9NS62 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
THSD1Q9NS62 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
THSD1Q9NS62 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
THSD1Q9NS62 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC22.86■■□□□ 1.25
THSD1Q9NS62 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
THSD1Q9NS62 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
THSD1Q9NS62 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
THSD1Q9NS62 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
THSD1Q9NS62 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
THSD1Q9NS62 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
THSD1Q9NS62 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
THSD1Q9NS62 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
THSD1Q9NS62 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
THSD1Q9NS62 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
THSD1Q9NS62 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC22.85■■□□□ 1.25
THSD1Q9NS62 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
THSD1Q9NS62 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
THSD1Q9NS62 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
THSD1Q9NS62 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
THSD1Q9NS62 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
THSD1Q9NS62 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
THSD1Q9NS62 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.3 ms