Protein–RNA interactions for Protein: Q9H4Z3

PCIF1, Phosphorylated CTD-interacting factor 1, humanhuman

Predictions only

Length 704 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCIF1Q9H4Z3 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
PCIF1Q9H4Z3 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
PCIF1Q9H4Z3 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
PCIF1Q9H4Z3 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
PCIF1Q9H4Z3 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
PCIF1Q9H4Z3 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
PCIF1Q9H4Z3 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
PCIF1Q9H4Z3 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
PCIF1Q9H4Z3 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
PCIF1Q9H4Z3 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
PCIF1Q9H4Z3 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC25.86■■□□□ 1.73
PCIF1Q9H4Z3 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
PCIF1Q9H4Z3 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
PCIF1Q9H4Z3 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
PCIF1Q9H4Z3 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
PCIF1Q9H4Z3 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
PCIF1Q9H4Z3 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
PCIF1Q9H4Z3 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
PCIF1Q9H4Z3 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
PCIF1Q9H4Z3 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
PCIF1Q9H4Z3 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
PCIF1Q9H4Z3 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
PCIF1Q9H4Z3 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
PCIF1Q9H4Z3 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
PCIF1Q9H4Z3 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
PCIF1Q9H4Z3 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
PCIF1Q9H4Z3 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
PCIF1Q9H4Z3 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
PCIF1Q9H4Z3 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
PCIF1Q9H4Z3 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
PCIF1Q9H4Z3 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
PCIF1Q9H4Z3 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
PCIF1Q9H4Z3 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
PCIF1Q9H4Z3 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
PCIF1Q9H4Z3 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
PCIF1Q9H4Z3 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
PCIF1Q9H4Z3 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
PCIF1Q9H4Z3 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
PCIF1Q9H4Z3 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.72
PCIF1Q9H4Z3 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.72
PCIF1Q9H4Z3 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
PCIF1Q9H4Z3 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
PCIF1Q9H4Z3 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
PCIF1Q9H4Z3 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
PCIF1Q9H4Z3 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
PCIF1Q9H4Z3 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
PCIF1Q9H4Z3 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
PCIF1Q9H4Z3 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
PCIF1Q9H4Z3 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
PCIF1Q9H4Z3 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
PCIF1Q9H4Z3 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
PCIF1Q9H4Z3 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
PCIF1Q9H4Z3 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
PCIF1Q9H4Z3 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
PCIF1Q9H4Z3 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
PCIF1Q9H4Z3 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
PCIF1Q9H4Z3 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
PCIF1Q9H4Z3 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
PCIF1Q9H4Z3 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.79■■□□□ 1.72
PCIF1Q9H4Z3 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
PCIF1Q9H4Z3 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC25.79■■□□□ 1.72
PCIF1Q9H4Z3 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
PCIF1Q9H4Z3 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
PCIF1Q9H4Z3 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
PCIF1Q9H4Z3 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
PCIF1Q9H4Z3 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
PCIF1Q9H4Z3 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
PCIF1Q9H4Z3 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
PCIF1Q9H4Z3 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC25.78■■□□□ 1.72
PCIF1Q9H4Z3 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
PCIF1Q9H4Z3 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
PCIF1Q9H4Z3 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
PCIF1Q9H4Z3 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
PCIF1Q9H4Z3 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
PCIF1Q9H4Z3 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
PCIF1Q9H4Z3 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
PCIF1Q9H4Z3 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
PCIF1Q9H4Z3 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
PCIF1Q9H4Z3 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
PCIF1Q9H4Z3 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
PCIF1Q9H4Z3 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
PCIF1Q9H4Z3 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
PCIF1Q9H4Z3 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
PCIF1Q9H4Z3 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
PCIF1Q9H4Z3 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
PCIF1Q9H4Z3 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
PCIF1Q9H4Z3 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
PCIF1Q9H4Z3 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
PCIF1Q9H4Z3 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
PCIF1Q9H4Z3 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
PCIF1Q9H4Z3 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
PCIF1Q9H4Z3 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
PCIF1Q9H4Z3 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
PCIF1Q9H4Z3 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
PCIF1Q9H4Z3 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
PCIF1Q9H4Z3 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
PCIF1Q9H4Z3 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
PCIF1Q9H4Z3 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
PCIF1Q9H4Z3 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
PCIF1Q9H4Z3 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 67.3 ms