Protein–RNA interactions for Protein: Q99619

SPSB2, SPRY domain-containing SOCS box protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 263 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPSB2Q99619 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SPSB2Q99619 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SPSB2Q99619 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SPSB2Q99619 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SPSB2Q99619 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SPSB2Q99619 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SPSB2Q99619 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SPSB2Q99619 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
SPSB2Q99619 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SPSB2Q99619 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SPSB2Q99619 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
SPSB2Q99619 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SPSB2Q99619 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SPSB2Q99619 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SPSB2Q99619 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SPSB2Q99619 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SPSB2Q99619 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SPSB2Q99619 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SPSB2Q99619 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SPSB2Q99619 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SPSB2Q99619 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SPSB2Q99619 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SPSB2Q99619 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SPSB2Q99619 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SPSB2Q99619 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SPSB2Q99619 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SPSB2Q99619 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
SPSB2Q99619 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SPSB2Q99619 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SPSB2Q99619 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SPSB2Q99619 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SPSB2Q99619 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
SPSB2Q99619 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SPSB2Q99619 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SPSB2Q99619 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
SPSB2Q99619 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
SPSB2Q99619 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SPSB2Q99619 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SPSB2Q99619 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SPSB2Q99619 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SPSB2Q99619 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SPSB2Q99619 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SPSB2Q99619 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SPSB2Q99619 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SPSB2Q99619 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SPSB2Q99619 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SPSB2Q99619 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SPSB2Q99619 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SPSB2Q99619 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SPSB2Q99619 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SPSB2Q99619 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SPSB2Q99619 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SPSB2Q99619 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SPSB2Q99619 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SPSB2Q99619 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SPSB2Q99619 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SPSB2Q99619 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SPSB2Q99619 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SPSB2Q99619 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SPSB2Q99619 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SPSB2Q99619 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SPSB2Q99619 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SPSB2Q99619 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
SPSB2Q99619 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SPSB2Q99619 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SPSB2Q99619 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SPSB2Q99619 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SPSB2Q99619 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SPSB2Q99619 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SPSB2Q99619 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SPSB2Q99619 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SPSB2Q99619 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SPSB2Q99619 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SPSB2Q99619 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SPSB2Q99619 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SPSB2Q99619 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SPSB2Q99619 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
SPSB2Q99619 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SPSB2Q99619 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SPSB2Q99619 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SPSB2Q99619 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SPSB2Q99619 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SPSB2Q99619 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SPSB2Q99619 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SPSB2Q99619 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SPSB2Q99619 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SPSB2Q99619 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SPSB2Q99619 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SPSB2Q99619 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SPSB2Q99619 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SPSB2Q99619 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SPSB2Q99619 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SPSB2Q99619 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
SPSB2Q99619 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SPSB2Q99619 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SPSB2Q99619 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SPSB2Q99619 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SPSB2Q99619 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SPSB2Q99619 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SPSB2Q99619 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 139.3 ms