Protein–RNA interactions for Protein: Q96M60

FAM227B, Protein FAM227B, humanhuman

Predictions only

Length 508 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM227BQ96M60 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
FAM227BQ96M60 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC28.52■■■□□ 2.16
FAM227BQ96M60 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC28.52■■■□□ 2.16
FAM227BQ96M60 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC28.52■■■□□ 2.16
FAM227BQ96M60 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.16
FAM227BQ96M60 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC28.51■■■□□ 2.16
FAM227BQ96M60 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC28.51■■■□□ 2.16
FAM227BQ96M60 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.51■■■□□ 2.15
FAM227BQ96M60 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
FAM227BQ96M60 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
FAM227BQ96M60 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.51■■■□□ 2.15
FAM227BQ96M60 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC28.51■■■□□ 2.15
FAM227BQ96M60 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC28.51■■■□□ 2.15
FAM227BQ96M60 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC28.5■■■□□ 2.15
FAM227BQ96M60 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
FAM227BQ96M60 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC28.5■■■□□ 2.15
FAM227BQ96M60 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
FAM227BQ96M60 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
FAM227BQ96M60 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
FAM227BQ96M60 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
FAM227BQ96M60 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
FAM227BQ96M60 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
FAM227BQ96M60 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC28.49■■■□□ 2.15
FAM227BQ96M60 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC28.49■■■□□ 2.15
FAM227BQ96M60 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
FAM227BQ96M60 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
FAM227BQ96M60 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
FAM227BQ96M60 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
FAM227BQ96M60 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
FAM227BQ96M60 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
FAM227BQ96M60 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
FAM227BQ96M60 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
FAM227BQ96M60 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC28.47■■■□□ 2.15
FAM227BQ96M60 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC28.47■■■□□ 2.15
FAM227BQ96M60 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC28.47■■■□□ 2.15
FAM227BQ96M60 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
FAM227BQ96M60 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC28.47■■■□□ 2.15
FAM227BQ96M60 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC28.47■■■□□ 2.15
FAM227BQ96M60 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC28.47■■■□□ 2.15
FAM227BQ96M60 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
FAM227BQ96M60 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
FAM227BQ96M60 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC28.47■■■□□ 2.15
FAM227BQ96M60 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
FAM227BQ96M60 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
FAM227BQ96M60 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
FAM227BQ96M60 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
FAM227BQ96M60 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
FAM227BQ96M60 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
FAM227BQ96M60 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC28.46■■■□□ 2.15
FAM227BQ96M60 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC28.46■■■□□ 2.15
FAM227BQ96M60 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC28.46■■■□□ 2.15
FAM227BQ96M60 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC28.46■■■□□ 2.15
FAM227BQ96M60 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC28.45■■■□□ 2.14
FAM227BQ96M60 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
FAM227BQ96M60 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
FAM227BQ96M60 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
FAM227BQ96M60 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
FAM227BQ96M60 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
FAM227BQ96M60 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
FAM227BQ96M60 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.44■■■□□ 2.14
FAM227BQ96M60 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
FAM227BQ96M60 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
FAM227BQ96M60 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.44■■■□□ 2.14
FAM227BQ96M60 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
FAM227BQ96M60 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC28.43■■■□□ 2.14
FAM227BQ96M60 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
FAM227BQ96M60 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
FAM227BQ96M60 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
FAM227BQ96M60 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
FAM227BQ96M60 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
FAM227BQ96M60 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC28.42■■■□□ 2.14
FAM227BQ96M60 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
FAM227BQ96M60 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
FAM227BQ96M60 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC28.41■■■□□ 2.14
FAM227BQ96M60 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
FAM227BQ96M60 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.41■■■□□ 2.14
FAM227BQ96M60 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
FAM227BQ96M60 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC28.4■■■□□ 2.14
FAM227BQ96M60 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
FAM227BQ96M60 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
FAM227BQ96M60 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC28.4■■■□□ 2.14
FAM227BQ96M60 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC28.4■■■□□ 2.14
FAM227BQ96M60 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC28.4■■■□□ 2.14
FAM227BQ96M60 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
FAM227BQ96M60 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
FAM227BQ96M60 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
FAM227BQ96M60 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
FAM227BQ96M60 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC28.4■■■□□ 2.14
FAM227BQ96M60 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.39■■■□□ 2.14
FAM227BQ96M60 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
FAM227BQ96M60 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC28.39■■■□□ 2.14
FAM227BQ96M60 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC28.39■■■□□ 2.14
FAM227BQ96M60 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
FAM227BQ96M60 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
FAM227BQ96M60 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC28.39■■■□□ 2.14
FAM227BQ96M60 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC28.38■■■□□ 2.13
FAM227BQ96M60 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC28.38■■■□□ 2.13
FAM227BQ96M60 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC28.38■■■□□ 2.13
FAM227BQ96M60 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
FAM227BQ96M60 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.7 ms