Protein–RNA interactions for Protein: Q96L08

SUSD3, Sushi domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 255 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SUSD3Q96L08 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
SUSD3Q96L08 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
SUSD3Q96L08 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
SUSD3Q96L08 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
SUSD3Q96L08 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
SUSD3Q96L08 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
SUSD3Q96L08 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
SUSD3Q96L08 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
SUSD3Q96L08 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
SUSD3Q96L08 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
SUSD3Q96L08 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
SUSD3Q96L08 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
SUSD3Q96L08 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
SUSD3Q96L08 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
SUSD3Q96L08 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC25.25■■□□□ 1.63
SUSD3Q96L08 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
SUSD3Q96L08 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
SUSD3Q96L08 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
SUSD3Q96L08 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
SUSD3Q96L08 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
SUSD3Q96L08 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
SUSD3Q96L08 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
SUSD3Q96L08 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
SUSD3Q96L08 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
SUSD3Q96L08 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
SUSD3Q96L08 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
SUSD3Q96L08 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
SUSD3Q96L08 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
SUSD3Q96L08 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
SUSD3Q96L08 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
SUSD3Q96L08 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
SUSD3Q96L08 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC25.22■■□□□ 1.63
SUSD3Q96L08 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
SUSD3Q96L08 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
SUSD3Q96L08 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
SUSD3Q96L08 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
SUSD3Q96L08 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
SUSD3Q96L08 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
SUSD3Q96L08 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
SUSD3Q96L08 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
SUSD3Q96L08 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
SUSD3Q96L08 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
SUSD3Q96L08 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
SUSD3Q96L08 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
SUSD3Q96L08 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
SUSD3Q96L08 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
SUSD3Q96L08 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
SUSD3Q96L08 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
SUSD3Q96L08 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
SUSD3Q96L08 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC25.19■■□□□ 1.62
SUSD3Q96L08 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
SUSD3Q96L08 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
SUSD3Q96L08 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
SUSD3Q96L08 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
SUSD3Q96L08 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
SUSD3Q96L08 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
SUSD3Q96L08 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
SUSD3Q96L08 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
SUSD3Q96L08 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
SUSD3Q96L08 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
SUSD3Q96L08 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
SUSD3Q96L08 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
SUSD3Q96L08 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC25.18■■□□□ 1.62
SUSD3Q96L08 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
SUSD3Q96L08 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
SUSD3Q96L08 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
SUSD3Q96L08 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC25.18■■□□□ 1.62
SUSD3Q96L08 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
SUSD3Q96L08 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
SUSD3Q96L08 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
SUSD3Q96L08 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
SUSD3Q96L08 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
SUSD3Q96L08 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
SUSD3Q96L08 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
SUSD3Q96L08 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
SUSD3Q96L08 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
SUSD3Q96L08 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
SUSD3Q96L08 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
SUSD3Q96L08 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC25.16■■□□□ 1.62
SUSD3Q96L08 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
SUSD3Q96L08 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
SUSD3Q96L08 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
SUSD3Q96L08 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
SUSD3Q96L08 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
SUSD3Q96L08 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
SUSD3Q96L08 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
SUSD3Q96L08 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC25.14■■□□□ 1.62
SUSD3Q96L08 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
SUSD3Q96L08 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
SUSD3Q96L08 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.61
SUSD3Q96L08 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
SUSD3Q96L08 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
SUSD3Q96L08 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.61
SUSD3Q96L08 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
SUSD3Q96L08 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
SUSD3Q96L08 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC25.13■■□□□ 1.61
SUSD3Q96L08 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
SUSD3Q96L08 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
SUSD3Q96L08 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
SUSD3Q96L08 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.7 ms