Protein–RNA interactions for Protein: Q96JY6

PDLIM2, PDZ and LIM domain protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 352 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDLIM2Q96JY6 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
PDLIM2Q96JY6 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
PDLIM2Q96JY6 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
PDLIM2Q96JY6 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
PDLIM2Q96JY6 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
PDLIM2Q96JY6 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
PDLIM2Q96JY6 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
PDLIM2Q96JY6 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
PDLIM2Q96JY6 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
PDLIM2Q96JY6 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
PDLIM2Q96JY6 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC26.28■■□□□ 1.8
PDLIM2Q96JY6 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
PDLIM2Q96JY6 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
PDLIM2Q96JY6 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
PDLIM2Q96JY6 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
PDLIM2Q96JY6 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
PDLIM2Q96JY6 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC26.27■■□□□ 1.8
PDLIM2Q96JY6 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
PDLIM2Q96JY6 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
PDLIM2Q96JY6 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
PDLIM2Q96JY6 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
PDLIM2Q96JY6 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
PDLIM2Q96JY6 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
PDLIM2Q96JY6 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
PDLIM2Q96JY6 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
PDLIM2Q96JY6 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
PDLIM2Q96JY6 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
PDLIM2Q96JY6 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC26.26■■□□□ 1.79
PDLIM2Q96JY6 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
PDLIM2Q96JY6 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
PDLIM2Q96JY6 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
PDLIM2Q96JY6 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
PDLIM2Q96JY6 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
PDLIM2Q96JY6 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
PDLIM2Q96JY6 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC26.25■■□□□ 1.79
PDLIM2Q96JY6 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
PDLIM2Q96JY6 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
PDLIM2Q96JY6 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
PDLIM2Q96JY6 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
PDLIM2Q96JY6 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
PDLIM2Q96JY6 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
PDLIM2Q96JY6 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
PDLIM2Q96JY6 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
PDLIM2Q96JY6 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC26.24■■□□□ 1.79
PDLIM2Q96JY6 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
PDLIM2Q96JY6 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
PDLIM2Q96JY6 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
PDLIM2Q96JY6 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
PDLIM2Q96JY6 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
PDLIM2Q96JY6 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
PDLIM2Q96JY6 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
PDLIM2Q96JY6 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
PDLIM2Q96JY6 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
PDLIM2Q96JY6 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
PDLIM2Q96JY6 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
PDLIM2Q96JY6 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.22■■□□□ 1.79
PDLIM2Q96JY6 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
PDLIM2Q96JY6 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
PDLIM2Q96JY6 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
PDLIM2Q96JY6 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
PDLIM2Q96JY6 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
PDLIM2Q96JY6 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
PDLIM2Q96JY6 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
PDLIM2Q96JY6 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
PDLIM2Q96JY6 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
PDLIM2Q96JY6 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
PDLIM2Q96JY6 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
PDLIM2Q96JY6 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC26.21■■□□□ 1.79
PDLIM2Q96JY6 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
PDLIM2Q96JY6 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
PDLIM2Q96JY6 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
PDLIM2Q96JY6 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
PDLIM2Q96JY6 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
PDLIM2Q96JY6 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
PDLIM2Q96JY6 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
PDLIM2Q96JY6 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
PDLIM2Q96JY6 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
PDLIM2Q96JY6 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
PDLIM2Q96JY6 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
PDLIM2Q96JY6 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
PDLIM2Q96JY6 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
PDLIM2Q96JY6 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
PDLIM2Q96JY6 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
PDLIM2Q96JY6 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
PDLIM2Q96JY6 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
PDLIM2Q96JY6 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
PDLIM2Q96JY6 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
PDLIM2Q96JY6 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
PDLIM2Q96JY6 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
PDLIM2Q96JY6 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
PDLIM2Q96JY6 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
PDLIM2Q96JY6 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
PDLIM2Q96JY6 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
PDLIM2Q96JY6 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
PDLIM2Q96JY6 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
PDLIM2Q96JY6 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
PDLIM2Q96JY6 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
PDLIM2Q96JY6 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
PDLIM2Q96JY6 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
PDLIM2Q96JY6 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.3 ms