Protein–RNA interactions for Protein: Q96EB6

SIRT1, NAD-dependent protein deacetylase sirtuin-1, humanhuman

Predictions only

Length 747 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIRT1Q96EB6 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.28■■■□□ 2.92
SIRT1Q96EB6 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC33.28■■■□□ 2.92
SIRT1Q96EB6 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC33.28■■■□□ 2.92
SIRT1Q96EB6 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.27■■■□□ 2.92
SIRT1Q96EB6 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC33.27■■■□□ 2.92
SIRT1Q96EB6 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.26■■■□□ 2.92
SIRT1Q96EB6 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC33.26■■■□□ 2.91
SIRT1Q96EB6 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.26■■■□□ 2.91
SIRT1Q96EB6 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC33.26■■■□□ 2.91
SIRT1Q96EB6 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC33.26■■■□□ 2.91
SIRT1Q96EB6 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC33.25■■■□□ 2.91
SIRT1Q96EB6 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC33.25■■■□□ 2.91
SIRT1Q96EB6 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC33.25■■■□□ 2.91
SIRT1Q96EB6 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC33.24■■■□□ 2.91
SIRT1Q96EB6 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC33.24■■■□□ 2.91
SIRT1Q96EB6 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC33.24■■■□□ 2.91
SIRT1Q96EB6 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.24■■■□□ 2.91
SIRT1Q96EB6 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC33.23■■■□□ 2.91
SIRT1Q96EB6 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC33.23■■■□□ 2.91
SIRT1Q96EB6 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.23■■■□□ 2.91
SIRT1Q96EB6 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC33.23■■■□□ 2.91
SIRT1Q96EB6 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC33.23■■■□□ 2.91
SIRT1Q96EB6 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC33.23■■■□□ 2.91
SIRT1Q96EB6 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC33.23■■■□□ 2.91
SIRT1Q96EB6 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC33.22■■■□□ 2.91
SIRT1Q96EB6 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.22■■■□□ 2.91
SIRT1Q96EB6 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.22■■■□□ 2.91
SIRT1Q96EB6 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC33.21■■■□□ 2.91
SIRT1Q96EB6 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.21■■■□□ 2.91
SIRT1Q96EB6 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.21■■■□□ 2.91
SIRT1Q96EB6 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC33.21■■■□□ 2.91
SIRT1Q96EB6 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC33.21■■■□□ 2.91
SIRT1Q96EB6 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.21■■■□□ 2.91
SIRT1Q96EB6 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.21■■■□□ 2.91
SIRT1Q96EB6 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.21■■■□□ 2.91
SIRT1Q96EB6 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC33.2■■■□□ 2.91
SIRT1Q96EB6 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC33.2■■■□□ 2.91
SIRT1Q96EB6 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC33.2■■■□□ 2.91
SIRT1Q96EB6 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.19■■■□□ 2.9
SIRT1Q96EB6 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.19■■■□□ 2.9
SIRT1Q96EB6 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.19■■■□□ 2.9
SIRT1Q96EB6 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC33.19■■■□□ 2.9
SIRT1Q96EB6 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.19■■■□□ 2.9
SIRT1Q96EB6 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.18■■■□□ 2.9
SIRT1Q96EB6 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC33.18■■■□□ 2.9
SIRT1Q96EB6 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC33.18■■■□□ 2.9
SIRT1Q96EB6 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.18■■■□□ 2.9
SIRT1Q96EB6 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.17■■■□□ 2.9
SIRT1Q96EB6 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.17■■■□□ 2.9
SIRT1Q96EB6 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC33.17■■■□□ 2.9
SIRT1Q96EB6 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.16■■■□□ 2.9
SIRT1Q96EB6 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC33.16■■■□□ 2.9
SIRT1Q96EB6 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC33.16■■■□□ 2.9
SIRT1Q96EB6 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC33.16■■■□□ 2.9
SIRT1Q96EB6 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC33.16■■■□□ 2.9
SIRT1Q96EB6 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC33.16■■■□□ 2.9
SIRT1Q96EB6 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.15■■■□□ 2.9
SIRT1Q96EB6 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.15■■■□□ 2.9
SIRT1Q96EB6 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC33.15■■■□□ 2.9
SIRT1Q96EB6 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.14■■■□□ 2.9
SIRT1Q96EB6 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.14■■■□□ 2.9
SIRT1Q96EB6 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC33.14■■■□□ 2.9
SIRT1Q96EB6 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC33.14■■■□□ 2.9
SIRT1Q96EB6 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC33.14■■■□□ 2.9
SIRT1Q96EB6 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC33.14■■■□□ 2.9
SIRT1Q96EB6 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC33.14■■■□□ 2.9
SIRT1Q96EB6 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC33.13■■■□□ 2.89
SIRT1Q96EB6 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.12■■■□□ 2.89
SIRT1Q96EB6 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC33.12■■■□□ 2.89
SIRT1Q96EB6 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC33.12■■■□□ 2.89
SIRT1Q96EB6 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC33.12■■■□□ 2.89
SIRT1Q96EB6 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC33.12■■■□□ 2.89
SIRT1Q96EB6 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.12■■■□□ 2.89
SIRT1Q96EB6 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.12■■■□□ 2.89
SIRT1Q96EB6 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC33.11■■■□□ 2.89
SIRT1Q96EB6 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC33.11■■■□□ 2.89
SIRT1Q96EB6 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC33.1■■■□□ 2.89
SIRT1Q96EB6 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC33.1■■■□□ 2.89
SIRT1Q96EB6 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC33.1■■■□□ 2.89
SIRT1Q96EB6 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.1■■■□□ 2.89
SIRT1Q96EB6 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.1■■■□□ 2.89
SIRT1Q96EB6 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.09■■■□□ 2.89
SIRT1Q96EB6 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.09■■■□□ 2.89
SIRT1Q96EB6 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC33.09■■■□□ 2.89
SIRT1Q96EB6 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC33.09■■■□□ 2.89
SIRT1Q96EB6 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC33.09■■■□□ 2.89
SIRT1Q96EB6 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC33.09■■■□□ 2.89
SIRT1Q96EB6 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.08■■■□□ 2.89
SIRT1Q96EB6 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC33.08■■■□□ 2.89
SIRT1Q96EB6 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.08■■■□□ 2.89
SIRT1Q96EB6 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC33.08■■■□□ 2.89
SIRT1Q96EB6 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC33.08■■■□□ 2.89
SIRT1Q96EB6 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC33.08■■■□□ 2.89
SIRT1Q96EB6 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.08■■■□□ 2.89
SIRT1Q96EB6 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.08■■■□□ 2.89
SIRT1Q96EB6 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC33.07■■■□□ 2.88
SIRT1Q96EB6 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC33.07■■■□□ 2.88
SIRT1Q96EB6 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC33.07■■■□□ 2.88
SIRT1Q96EB6 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.07■■■□□ 2.88
SIRT1Q96EB6 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC33.06■■■□□ 2.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 124.9 ms