Protein–RNA interactions for Protein: Q8TDD5

MCOLN3, Mucolipin-3, humanhuman

Predictions only

Length 553 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MCOLN3Q8TDD5 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
MCOLN3Q8TDD5 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
MCOLN3Q8TDD5 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
MCOLN3Q8TDD5 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
MCOLN3Q8TDD5 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
MCOLN3Q8TDD5 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
MCOLN3Q8TDD5 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
MCOLN3Q8TDD5 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
MCOLN3Q8TDD5 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
MCOLN3Q8TDD5 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
MCOLN3Q8TDD5 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC23.08■■□□□ 1.29
MCOLN3Q8TDD5 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC23.08■■□□□ 1.29
MCOLN3Q8TDD5 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
MCOLN3Q8TDD5 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
MCOLN3Q8TDD5 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
MCOLN3Q8TDD5 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
MCOLN3Q8TDD5 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.28
MCOLN3Q8TDD5 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
MCOLN3Q8TDD5 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
MCOLN3Q8TDD5 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
MCOLN3Q8TDD5 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
MCOLN3Q8TDD5 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
MCOLN3Q8TDD5 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
MCOLN3Q8TDD5 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
MCOLN3Q8TDD5 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
MCOLN3Q8TDD5 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
MCOLN3Q8TDD5 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
MCOLN3Q8TDD5 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
MCOLN3Q8TDD5 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
MCOLN3Q8TDD5 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
MCOLN3Q8TDD5 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
MCOLN3Q8TDD5 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
MCOLN3Q8TDD5 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
MCOLN3Q8TDD5 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
MCOLN3Q8TDD5 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
MCOLN3Q8TDD5 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
MCOLN3Q8TDD5 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
MCOLN3Q8TDD5 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
MCOLN3Q8TDD5 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
MCOLN3Q8TDD5 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
MCOLN3Q8TDD5 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
MCOLN3Q8TDD5 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
MCOLN3Q8TDD5 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
MCOLN3Q8TDD5 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
MCOLN3Q8TDD5 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
MCOLN3Q8TDD5 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
MCOLN3Q8TDD5 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
MCOLN3Q8TDD5 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
MCOLN3Q8TDD5 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
MCOLN3Q8TDD5 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
MCOLN3Q8TDD5 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
MCOLN3Q8TDD5 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
MCOLN3Q8TDD5 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
MCOLN3Q8TDD5 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
MCOLN3Q8TDD5 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
MCOLN3Q8TDD5 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
MCOLN3Q8TDD5 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
MCOLN3Q8TDD5 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
MCOLN3Q8TDD5 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
MCOLN3Q8TDD5 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
MCOLN3Q8TDD5 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
MCOLN3Q8TDD5 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
MCOLN3Q8TDD5 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
MCOLN3Q8TDD5 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
MCOLN3Q8TDD5 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
MCOLN3Q8TDD5 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
MCOLN3Q8TDD5 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
MCOLN3Q8TDD5 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
MCOLN3Q8TDD5 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
MCOLN3Q8TDD5 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
MCOLN3Q8TDD5 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
MCOLN3Q8TDD5 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC23■■□□□ 1.27
MCOLN3Q8TDD5 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
MCOLN3Q8TDD5 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
MCOLN3Q8TDD5 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
MCOLN3Q8TDD5 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
MCOLN3Q8TDD5 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
MCOLN3Q8TDD5 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
MCOLN3Q8TDD5 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
MCOLN3Q8TDD5 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
MCOLN3Q8TDD5 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
MCOLN3Q8TDD5 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
MCOLN3Q8TDD5 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
MCOLN3Q8TDD5 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
MCOLN3Q8TDD5 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
MCOLN3Q8TDD5 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC22.99■■□□□ 1.27
MCOLN3Q8TDD5 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
MCOLN3Q8TDD5 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
MCOLN3Q8TDD5 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
MCOLN3Q8TDD5 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
MCOLN3Q8TDD5 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
MCOLN3Q8TDD5 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
MCOLN3Q8TDD5 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
MCOLN3Q8TDD5 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
MCOLN3Q8TDD5 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
MCOLN3Q8TDD5 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
MCOLN3Q8TDD5 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
MCOLN3Q8TDD5 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
MCOLN3Q8TDD5 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
MCOLN3Q8TDD5 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.6 ms