Protein–RNA interactions for Protein: Q8NCJ5

SPRYD3, SPRY domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 442 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPRYD3Q8NCJ5 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.17■■■□□ 2.1
SPRYD3Q8NCJ5 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
SPRYD3Q8NCJ5 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
SPRYD3Q8NCJ5 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC28.16■■■□□ 2.1
SPRYD3Q8NCJ5 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC28.16■■■□□ 2.1
SPRYD3Q8NCJ5 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
SPRYD3Q8NCJ5 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC28.16■■■□□ 2.1
SPRYD3Q8NCJ5 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
SPRYD3Q8NCJ5 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
SPRYD3Q8NCJ5 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC28.16■■■□□ 2.1
SPRYD3Q8NCJ5 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
SPRYD3Q8NCJ5 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
SPRYD3Q8NCJ5 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
SPRYD3Q8NCJ5 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
SPRYD3Q8NCJ5 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
SPRYD3Q8NCJ5 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
SPRYD3Q8NCJ5 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
SPRYD3Q8NCJ5 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC28.14■■■□□ 2.1
SPRYD3Q8NCJ5 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.1
SPRYD3Q8NCJ5 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
SPRYD3Q8NCJ5 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.1
SPRYD3Q8NCJ5 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
SPRYD3Q8NCJ5 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
SPRYD3Q8NCJ5 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
SPRYD3Q8NCJ5 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
SPRYD3Q8NCJ5 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.09
SPRYD3Q8NCJ5 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
SPRYD3Q8NCJ5 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.09
SPRYD3Q8NCJ5 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
SPRYD3Q8NCJ5 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.13■■■□□ 2.09
SPRYD3Q8NCJ5 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
SPRYD3Q8NCJ5 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
SPRYD3Q8NCJ5 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
SPRYD3Q8NCJ5 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
SPRYD3Q8NCJ5 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
SPRYD3Q8NCJ5 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
SPRYD3Q8NCJ5 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC28.12■■■□□ 2.09
SPRYD3Q8NCJ5 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC28.12■■■□□ 2.09
SPRYD3Q8NCJ5 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
SPRYD3Q8NCJ5 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
SPRYD3Q8NCJ5 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
SPRYD3Q8NCJ5 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
SPRYD3Q8NCJ5 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
SPRYD3Q8NCJ5 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
SPRYD3Q8NCJ5 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
SPRYD3Q8NCJ5 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC28.11■■■□□ 2.09
SPRYD3Q8NCJ5 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC28.11■■■□□ 2.09
SPRYD3Q8NCJ5 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC28.11■■■□□ 2.09
SPRYD3Q8NCJ5 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC28.11■■■□□ 2.09
SPRYD3Q8NCJ5 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
SPRYD3Q8NCJ5 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
SPRYD3Q8NCJ5 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
SPRYD3Q8NCJ5 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC28.1■■■□□ 2.09
SPRYD3Q8NCJ5 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
SPRYD3Q8NCJ5 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
SPRYD3Q8NCJ5 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
SPRYD3Q8NCJ5 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
SPRYD3Q8NCJ5 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
SPRYD3Q8NCJ5 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
SPRYD3Q8NCJ5 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.09■■■□□ 2.09
SPRYD3Q8NCJ5 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
SPRYD3Q8NCJ5 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
SPRYD3Q8NCJ5 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
SPRYD3Q8NCJ5 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
SPRYD3Q8NCJ5 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
SPRYD3Q8NCJ5 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
SPRYD3Q8NCJ5 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
SPRYD3Q8NCJ5 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
SPRYD3Q8NCJ5 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
SPRYD3Q8NCJ5 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
SPRYD3Q8NCJ5 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC28.06■■■□□ 2.08
SPRYD3Q8NCJ5 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC28.06■■■□□ 2.08
SPRYD3Q8NCJ5 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
SPRYD3Q8NCJ5 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
SPRYD3Q8NCJ5 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
SPRYD3Q8NCJ5 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
SPRYD3Q8NCJ5 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
SPRYD3Q8NCJ5 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
SPRYD3Q8NCJ5 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
SPRYD3Q8NCJ5 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
SPRYD3Q8NCJ5 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
SPRYD3Q8NCJ5 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
SPRYD3Q8NCJ5 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
SPRYD3Q8NCJ5 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
SPRYD3Q8NCJ5 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC28.04■■■□□ 2.08
SPRYD3Q8NCJ5 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
SPRYD3Q8NCJ5 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
SPRYD3Q8NCJ5 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
SPRYD3Q8NCJ5 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
SPRYD3Q8NCJ5 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
SPRYD3Q8NCJ5 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
SPRYD3Q8NCJ5 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
SPRYD3Q8NCJ5 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
SPRYD3Q8NCJ5 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.08
SPRYD3Q8NCJ5 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
SPRYD3Q8NCJ5 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
SPRYD3Q8NCJ5 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
SPRYD3Q8NCJ5 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
SPRYD3Q8NCJ5 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC28.01■■■□□ 2.07
SPRYD3Q8NCJ5 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.9 ms