Protein–RNA interactions for Protein: Q8N6U2

LINC00612, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00612, humanhuman

Predictions only

Length 182 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00612Q8N6U2 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
LINC00612Q8N6U2 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
LINC00612Q8N6U2 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
LINC00612Q8N6U2 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
LINC00612Q8N6U2 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
LINC00612Q8N6U2 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
LINC00612Q8N6U2 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
LINC00612Q8N6U2 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC16.77■□□□□ 0.28
LINC00612Q8N6U2 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
LINC00612Q8N6U2 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
LINC00612Q8N6U2 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
LINC00612Q8N6U2 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
LINC00612Q8N6U2 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
LINC00612Q8N6U2 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
LINC00612Q8N6U2 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
LINC00612Q8N6U2 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
LINC00612Q8N6U2 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
LINC00612Q8N6U2 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
LINC00612Q8N6U2 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
LINC00612Q8N6U2 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
LINC00612Q8N6U2 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
LINC00612Q8N6U2 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
LINC00612Q8N6U2 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
LINC00612Q8N6U2 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
LINC00612Q8N6U2 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
LINC00612Q8N6U2 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
LINC00612Q8N6U2 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
LINC00612Q8N6U2 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
LINC00612Q8N6U2 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
LINC00612Q8N6U2 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
LINC00612Q8N6U2 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
LINC00612Q8N6U2 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
LINC00612Q8N6U2 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
LINC00612Q8N6U2 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
LINC00612Q8N6U2 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
LINC00612Q8N6U2 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
LINC00612Q8N6U2 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
LINC00612Q8N6U2 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
LINC00612Q8N6U2 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
LINC00612Q8N6U2 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
LINC00612Q8N6U2 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
LINC00612Q8N6U2 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
LINC00612Q8N6U2 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
LINC00612Q8N6U2 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
LINC00612Q8N6U2 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
LINC00612Q8N6U2 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
LINC00612Q8N6U2 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
LINC00612Q8N6U2 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
LINC00612Q8N6U2 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
LINC00612Q8N6U2 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
LINC00612Q8N6U2 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
LINC00612Q8N6U2 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
LINC00612Q8N6U2 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
LINC00612Q8N6U2 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
LINC00612Q8N6U2 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
LINC00612Q8N6U2 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
LINC00612Q8N6U2 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
LINC00612Q8N6U2 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
LINC00612Q8N6U2 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
LINC00612Q8N6U2 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
LINC00612Q8N6U2 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
LINC00612Q8N6U2 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
LINC00612Q8N6U2 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
LINC00612Q8N6U2 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
LINC00612Q8N6U2 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
LINC00612Q8N6U2 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
LINC00612Q8N6U2 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
LINC00612Q8N6U2 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
LINC00612Q8N6U2 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
LINC00612Q8N6U2 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
LINC00612Q8N6U2 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
LINC00612Q8N6U2 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
LINC00612Q8N6U2 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
LINC00612Q8N6U2 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
LINC00612Q8N6U2 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
LINC00612Q8N6U2 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
LINC00612Q8N6U2 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
LINC00612Q8N6U2 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
LINC00612Q8N6U2 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
LINC00612Q8N6U2 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
LINC00612Q8N6U2 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
LINC00612Q8N6U2 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
LINC00612Q8N6U2 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
LINC00612Q8N6U2 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
LINC00612Q8N6U2 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
LINC00612Q8N6U2 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
LINC00612Q8N6U2 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
LINC00612Q8N6U2 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
LINC00612Q8N6U2 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
LINC00612Q8N6U2 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
LINC00612Q8N6U2 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
LINC00612Q8N6U2 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
LINC00612Q8N6U2 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
LINC00612Q8N6U2 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
LINC00612Q8N6U2 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
LINC00612Q8N6U2 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
LINC00612Q8N6U2 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
LINC00612Q8N6U2 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
LINC00612Q8N6U2 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
LINC00612Q8N6U2 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.1 ms