Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZUM4

ARHGAP27, Rho GTPase-activating protein 27, humanhuman

Predictions only

Length 889 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARHGAP27Q6ZUM4 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
ARHGAP27Q6ZUM4 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
ARHGAP27Q6ZUM4 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
ARHGAP27Q6ZUM4 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC29.36■■■□□ 2.29
ARHGAP27Q6ZUM4 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.36■■■□□ 2.29
ARHGAP27Q6ZUM4 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.35■■■□□ 2.29
ARHGAP27Q6ZUM4 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC29.35■■■□□ 2.29
ARHGAP27Q6ZUM4 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC29.35■■■□□ 2.29
ARHGAP27Q6ZUM4 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.35■■■□□ 2.29
ARHGAP27Q6ZUM4 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC29.35■■■□□ 2.29
ARHGAP27Q6ZUM4 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC29.35■■■□□ 2.29
ARHGAP27Q6ZUM4 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
ARHGAP27Q6ZUM4 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
ARHGAP27Q6ZUM4 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
ARHGAP27Q6ZUM4 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
ARHGAP27Q6ZUM4 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.34■■■□□ 2.29
ARHGAP27Q6ZUM4 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
ARHGAP27Q6ZUM4 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.34■■■□□ 2.29
ARHGAP27Q6ZUM4 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
ARHGAP27Q6ZUM4 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
ARHGAP27Q6ZUM4 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC29.33■■■□□ 2.29
ARHGAP27Q6ZUM4 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC29.33■■■□□ 2.29
ARHGAP27Q6ZUM4 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
ARHGAP27Q6ZUM4 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
ARHGAP27Q6ZUM4 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
ARHGAP27Q6ZUM4 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
ARHGAP27Q6ZUM4 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC29.32■■■□□ 2.28
ARHGAP27Q6ZUM4 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
ARHGAP27Q6ZUM4 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
ARHGAP27Q6ZUM4 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
ARHGAP27Q6ZUM4 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
ARHGAP27Q6ZUM4 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC29.31■■■□□ 2.28
ARHGAP27Q6ZUM4 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.31■■■□□ 2.28
ARHGAP27Q6ZUM4 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC29.3■■■□□ 2.28
ARHGAP27Q6ZUM4 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.3■■■□□ 2.28
ARHGAP27Q6ZUM4 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.3■■■□□ 2.28
ARHGAP27Q6ZUM4 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC29.3■■■□□ 2.28
ARHGAP27Q6ZUM4 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC29.3■■■□□ 2.28
ARHGAP27Q6ZUM4 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC29.29■■■□□ 2.28
ARHGAP27Q6ZUM4 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
ARHGAP27Q6ZUM4 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC29.29■■■□□ 2.28
ARHGAP27Q6ZUM4 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
ARHGAP27Q6ZUM4 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.28■■■□□ 2.28
ARHGAP27Q6ZUM4 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
ARHGAP27Q6ZUM4 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC29.28■■■□□ 2.28
ARHGAP27Q6ZUM4 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
ARHGAP27Q6ZUM4 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC29.27■■■□□ 2.28
ARHGAP27Q6ZUM4 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC29.27■■■□□ 2.28
ARHGAP27Q6ZUM4 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
ARHGAP27Q6ZUM4 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.28
ARHGAP27Q6ZUM4 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC29.26■■■□□ 2.28
ARHGAP27Q6ZUM4 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
ARHGAP27Q6ZUM4 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
ARHGAP27Q6ZUM4 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC29.26■■■□□ 2.27
ARHGAP27Q6ZUM4 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC29.26■■■□□ 2.27
ARHGAP27Q6ZUM4 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC29.26■■■□□ 2.27
ARHGAP27Q6ZUM4 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC29.26■■■□□ 2.27
ARHGAP27Q6ZUM4 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC29.26■■■□□ 2.27
ARHGAP27Q6ZUM4 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
ARHGAP27Q6ZUM4 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC29.25■■■□□ 2.27
ARHGAP27Q6ZUM4 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
ARHGAP27Q6ZUM4 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.25■■■□□ 2.27
ARHGAP27Q6ZUM4 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
ARHGAP27Q6ZUM4 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC29.25■■■□□ 2.27
ARHGAP27Q6ZUM4 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC29.23■■■□□ 2.27
ARHGAP27Q6ZUM4 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
ARHGAP27Q6ZUM4 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC29.23■■■□□ 2.27
ARHGAP27Q6ZUM4 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
ARHGAP27Q6ZUM4 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
ARHGAP27Q6ZUM4 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
ARHGAP27Q6ZUM4 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC29.22■■■□□ 2.27
ARHGAP27Q6ZUM4 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC29.22■■■□□ 2.27
ARHGAP27Q6ZUM4 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
ARHGAP27Q6ZUM4 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
ARHGAP27Q6ZUM4 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
ARHGAP27Q6ZUM4 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC29.21■■■□□ 2.27
ARHGAP27Q6ZUM4 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC29.21■■■□□ 2.27
ARHGAP27Q6ZUM4 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
ARHGAP27Q6ZUM4 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.21■■■□□ 2.27
ARHGAP27Q6ZUM4 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC29.21■■■□□ 2.27
ARHGAP27Q6ZUM4 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC29.21■■■□□ 2.27
ARHGAP27Q6ZUM4 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
ARHGAP27Q6ZUM4 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC29.2■■■□□ 2.27
ARHGAP27Q6ZUM4 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.2■■■□□ 2.27
ARHGAP27Q6ZUM4 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
ARHGAP27Q6ZUM4 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC29.2■■■□□ 2.26
ARHGAP27Q6ZUM4 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
ARHGAP27Q6ZUM4 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC29.2■■■□□ 2.26
ARHGAP27Q6ZUM4 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC29.19■■■□□ 2.26
ARHGAP27Q6ZUM4 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
ARHGAP27Q6ZUM4 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC29.19■■■□□ 2.26
ARHGAP27Q6ZUM4 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC29.19■■■□□ 2.26
ARHGAP27Q6ZUM4 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
ARHGAP27Q6ZUM4 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC29.18■■■□□ 2.26
ARHGAP27Q6ZUM4 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.17■■■□□ 2.26
ARHGAP27Q6ZUM4 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC29.17■■■□□ 2.26
ARHGAP27Q6ZUM4 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC29.17■■■□□ 2.26
ARHGAP27Q6ZUM4 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC29.17■■■□□ 2.26
ARHGAP27Q6ZUM4 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
ARHGAP27Q6ZUM4 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.3 ms