Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZNB6

NFXL1, NF-X1-type zinc finger protein NFXL1, humanhuman

Predictions only

Length 911 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NFXL1Q6ZNB6 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
NFXL1Q6ZNB6 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC27.75■■■□□ 2.03
NFXL1Q6ZNB6 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
NFXL1Q6ZNB6 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC27.75■■■□□ 2.03
NFXL1Q6ZNB6 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
NFXL1Q6ZNB6 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
NFXL1Q6ZNB6 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
NFXL1Q6ZNB6 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
NFXL1Q6ZNB6 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC27.74■■■□□ 2.03
NFXL1Q6ZNB6 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
NFXL1Q6ZNB6 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
NFXL1Q6ZNB6 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
NFXL1Q6ZNB6 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
NFXL1Q6ZNB6 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
NFXL1Q6ZNB6 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
NFXL1Q6ZNB6 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC27.73■■■□□ 2.03
NFXL1Q6ZNB6 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
NFXL1Q6ZNB6 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
NFXL1Q6ZNB6 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
NFXL1Q6ZNB6 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
NFXL1Q6ZNB6 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
NFXL1Q6ZNB6 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
NFXL1Q6ZNB6 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
NFXL1Q6ZNB6 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
NFXL1Q6ZNB6 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
NFXL1Q6ZNB6 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
NFXL1Q6ZNB6 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
NFXL1Q6ZNB6 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
NFXL1Q6ZNB6 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
NFXL1Q6ZNB6 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
NFXL1Q6ZNB6 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
NFXL1Q6ZNB6 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
NFXL1Q6ZNB6 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC27.71■■■□□ 2.03
NFXL1Q6ZNB6 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC27.71■■■□□ 2.03
NFXL1Q6ZNB6 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
NFXL1Q6ZNB6 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
NFXL1Q6ZNB6 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
NFXL1Q6ZNB6 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
NFXL1Q6ZNB6 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
NFXL1Q6ZNB6 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
NFXL1Q6ZNB6 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
NFXL1Q6ZNB6 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
NFXL1Q6ZNB6 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
NFXL1Q6ZNB6 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
NFXL1Q6ZNB6 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
NFXL1Q6ZNB6 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
NFXL1Q6ZNB6 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
NFXL1Q6ZNB6 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
NFXL1Q6ZNB6 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
NFXL1Q6ZNB6 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
NFXL1Q6ZNB6 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
NFXL1Q6ZNB6 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.68■■■□□ 2.02
NFXL1Q6ZNB6 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
NFXL1Q6ZNB6 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC27.68■■■□□ 2.02
NFXL1Q6ZNB6 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC27.68■■■□□ 2.02
NFXL1Q6ZNB6 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
NFXL1Q6ZNB6 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
NFXL1Q6ZNB6 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
NFXL1Q6ZNB6 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
NFXL1Q6ZNB6 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
NFXL1Q6ZNB6 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
NFXL1Q6ZNB6 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
NFXL1Q6ZNB6 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
NFXL1Q6ZNB6 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
NFXL1Q6ZNB6 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC27.67■■■□□ 2.02
NFXL1Q6ZNB6 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
NFXL1Q6ZNB6 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
NFXL1Q6ZNB6 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
NFXL1Q6ZNB6 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
NFXL1Q6ZNB6 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
NFXL1Q6ZNB6 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
NFXL1Q6ZNB6 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
NFXL1Q6ZNB6 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
NFXL1Q6ZNB6 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
NFXL1Q6ZNB6 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
NFXL1Q6ZNB6 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
NFXL1Q6ZNB6 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
NFXL1Q6ZNB6 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
NFXL1Q6ZNB6 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
NFXL1Q6ZNB6 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
NFXL1Q6ZNB6 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
NFXL1Q6ZNB6 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
NFXL1Q6ZNB6 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
NFXL1Q6ZNB6 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
NFXL1Q6ZNB6 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
NFXL1Q6ZNB6 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
NFXL1Q6ZNB6 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC27.64■■■□□ 2.02
NFXL1Q6ZNB6 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC27.64■■■□□ 2.02
NFXL1Q6ZNB6 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC27.64■■■□□ 2.02
NFXL1Q6ZNB6 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
NFXL1Q6ZNB6 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
NFXL1Q6ZNB6 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
NFXL1Q6ZNB6 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
NFXL1Q6ZNB6 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
NFXL1Q6ZNB6 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
NFXL1Q6ZNB6 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
NFXL1Q6ZNB6 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
NFXL1Q6ZNB6 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
NFXL1Q6ZNB6 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
NFXL1Q6ZNB6 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.7 ms