Protein–RNA interactions for Protein: Q6UXZ0

TMIGD1, Transmembrane and immunoglobulin domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 262 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMIGD1Q6UXZ0 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TMIGD1Q6UXZ0 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
TMIGD1Q6UXZ0 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TMIGD1Q6UXZ0 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
TMIGD1Q6UXZ0 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
TMIGD1Q6UXZ0 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TMIGD1Q6UXZ0 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TMIGD1Q6UXZ0 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TMIGD1Q6UXZ0 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TMIGD1Q6UXZ0 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TMIGD1Q6UXZ0 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
TMIGD1Q6UXZ0 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
TMIGD1Q6UXZ0 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
TMIGD1Q6UXZ0 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TMIGD1Q6UXZ0 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
TMIGD1Q6UXZ0 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TMIGD1Q6UXZ0 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
TMIGD1Q6UXZ0 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
TMIGD1Q6UXZ0 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
TMIGD1Q6UXZ0 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC22.67■■□□□ 1.22
TMIGD1Q6UXZ0 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
TMIGD1Q6UXZ0 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
TMIGD1Q6UXZ0 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
TMIGD1Q6UXZ0 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
TMIGD1Q6UXZ0 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
TMIGD1Q6UXZ0 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
TMIGD1Q6UXZ0 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
TMIGD1Q6UXZ0 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
TMIGD1Q6UXZ0 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
TMIGD1Q6UXZ0 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
TMIGD1Q6UXZ0 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
TMIGD1Q6UXZ0 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
TMIGD1Q6UXZ0 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
TMIGD1Q6UXZ0 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
TMIGD1Q6UXZ0 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
TMIGD1Q6UXZ0 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
TMIGD1Q6UXZ0 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
TMIGD1Q6UXZ0 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
TMIGD1Q6UXZ0 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
TMIGD1Q6UXZ0 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
TMIGD1Q6UXZ0 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
TMIGD1Q6UXZ0 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
TMIGD1Q6UXZ0 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
TMIGD1Q6UXZ0 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
TMIGD1Q6UXZ0 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
TMIGD1Q6UXZ0 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
TMIGD1Q6UXZ0 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
TMIGD1Q6UXZ0 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
TMIGD1Q6UXZ0 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
TMIGD1Q6UXZ0 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
TMIGD1Q6UXZ0 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
TMIGD1Q6UXZ0 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
TMIGD1Q6UXZ0 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
TMIGD1Q6UXZ0 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
TMIGD1Q6UXZ0 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
TMIGD1Q6UXZ0 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
TMIGD1Q6UXZ0 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
TMIGD1Q6UXZ0 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
TMIGD1Q6UXZ0 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
TMIGD1Q6UXZ0 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
TMIGD1Q6UXZ0 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
TMIGD1Q6UXZ0 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
TMIGD1Q6UXZ0 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
TMIGD1Q6UXZ0 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
TMIGD1Q6UXZ0 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
TMIGD1Q6UXZ0 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
TMIGD1Q6UXZ0 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC22.61■■□□□ 1.21
TMIGD1Q6UXZ0 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
TMIGD1Q6UXZ0 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
TMIGD1Q6UXZ0 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
TMIGD1Q6UXZ0 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
TMIGD1Q6UXZ0 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
TMIGD1Q6UXZ0 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
TMIGD1Q6UXZ0 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
TMIGD1Q6UXZ0 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
TMIGD1Q6UXZ0 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
TMIGD1Q6UXZ0 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC22.6■■□□□ 1.21
TMIGD1Q6UXZ0 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TMIGD1Q6UXZ0 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TMIGD1Q6UXZ0 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TMIGD1Q6UXZ0 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TMIGD1Q6UXZ0 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TMIGD1Q6UXZ0 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TMIGD1Q6UXZ0 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TMIGD1Q6UXZ0 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
TMIGD1Q6UXZ0 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
TMIGD1Q6UXZ0 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
TMIGD1Q6UXZ0 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
TMIGD1Q6UXZ0 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
TMIGD1Q6UXZ0 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
TMIGD1Q6UXZ0 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
TMIGD1Q6UXZ0 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
TMIGD1Q6UXZ0 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
TMIGD1Q6UXZ0 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
TMIGD1Q6UXZ0 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
TMIGD1Q6UXZ0 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TMIGD1Q6UXZ0 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
TMIGD1Q6UXZ0 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
TMIGD1Q6UXZ0 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC22.57■■□□□ 1.2
TMIGD1Q6UXZ0 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.6 ms