Protein–RNA interactions for Protein: Q6UWE3

CLPSL2, Colipase-like protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 100 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLPSL2Q6UWE3 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CLPSL2Q6UWE3 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CLPSL2Q6UWE3 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CLPSL2Q6UWE3 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CLPSL2Q6UWE3 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CLPSL2Q6UWE3 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CLPSL2Q6UWE3 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CLPSL2Q6UWE3 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CLPSL2Q6UWE3 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CLPSL2Q6UWE3 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
CLPSL2Q6UWE3 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CLPSL2Q6UWE3 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CLPSL2Q6UWE3 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CLPSL2Q6UWE3 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CLPSL2Q6UWE3 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
CLPSL2Q6UWE3 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
CLPSL2Q6UWE3 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CLPSL2Q6UWE3 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CLPSL2Q6UWE3 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CLPSL2Q6UWE3 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CLPSL2Q6UWE3 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CLPSL2Q6UWE3 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CLPSL2Q6UWE3 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CLPSL2Q6UWE3 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CLPSL2Q6UWE3 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CLPSL2Q6UWE3 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CLPSL2Q6UWE3 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CLPSL2Q6UWE3 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CLPSL2Q6UWE3 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CLPSL2Q6UWE3 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CLPSL2Q6UWE3 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CLPSL2Q6UWE3 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CLPSL2Q6UWE3 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CLPSL2Q6UWE3 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CLPSL2Q6UWE3 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CLPSL2Q6UWE3 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CLPSL2Q6UWE3 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CLPSL2Q6UWE3 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CLPSL2Q6UWE3 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CLPSL2Q6UWE3 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CLPSL2Q6UWE3 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CLPSL2Q6UWE3 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CLPSL2Q6UWE3 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CLPSL2Q6UWE3 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CLPSL2Q6UWE3 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CLPSL2Q6UWE3 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CLPSL2Q6UWE3 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CLPSL2Q6UWE3 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CLPSL2Q6UWE3 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CLPSL2Q6UWE3 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CLPSL2Q6UWE3 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CLPSL2Q6UWE3 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CLPSL2Q6UWE3 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CLPSL2Q6UWE3 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CLPSL2Q6UWE3 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CLPSL2Q6UWE3 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CLPSL2Q6UWE3 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CLPSL2Q6UWE3 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
CLPSL2Q6UWE3 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CLPSL2Q6UWE3 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CLPSL2Q6UWE3 CNNM1-201ENST00000356713 5959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CLPSL2Q6UWE3 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CLPSL2Q6UWE3 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CLPSL2Q6UWE3 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CLPSL2Q6UWE3 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CLPSL2Q6UWE3 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CLPSL2Q6UWE3 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CLPSL2Q6UWE3 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CLPSL2Q6UWE3 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CLPSL2Q6UWE3 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CLPSL2Q6UWE3 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
CLPSL2Q6UWE3 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CLPSL2Q6UWE3 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CLPSL2Q6UWE3 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CLPSL2Q6UWE3 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CLPSL2Q6UWE3 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CLPSL2Q6UWE3 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CLPSL2Q6UWE3 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CLPSL2Q6UWE3 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CLPSL2Q6UWE3 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.18
CLPSL2Q6UWE3 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CLPSL2Q6UWE3 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CLPSL2Q6UWE3 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CLPSL2Q6UWE3 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CLPSL2Q6UWE3 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CLPSL2Q6UWE3 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CLPSL2Q6UWE3 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CLPSL2Q6UWE3 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CLPSL2Q6UWE3 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CLPSL2Q6UWE3 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CLPSL2Q6UWE3 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CLPSL2Q6UWE3 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CLPSL2Q6UWE3 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CLPSL2Q6UWE3 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CLPSL2Q6UWE3 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CLPSL2Q6UWE3 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CLPSL2Q6UWE3 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CLPSL2Q6UWE3 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CLPSL2Q6UWE3 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CLPSL2Q6UWE3 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.4 ms