Protein–RNA interactions for Protein: Q6P3S1

DENND1B, DENN domain-containing protein 1B, humanhuman

Predictions only

Length 775 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DENND1BQ6P3S1 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
DENND1BQ6P3S1 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
DENND1BQ6P3S1 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
DENND1BQ6P3S1 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
DENND1BQ6P3S1 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
DENND1BQ6P3S1 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
DENND1BQ6P3S1 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
DENND1BQ6P3S1 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
DENND1BQ6P3S1 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
DENND1BQ6P3S1 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
DENND1BQ6P3S1 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
DENND1BQ6P3S1 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
DENND1BQ6P3S1 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
DENND1BQ6P3S1 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC25.04■■□□□ 1.6
DENND1BQ6P3S1 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
DENND1BQ6P3S1 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
DENND1BQ6P3S1 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
DENND1BQ6P3S1 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
DENND1BQ6P3S1 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
DENND1BQ6P3S1 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
DENND1BQ6P3S1 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
DENND1BQ6P3S1 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
DENND1BQ6P3S1 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
DENND1BQ6P3S1 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
DENND1BQ6P3S1 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
DENND1BQ6P3S1 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
DENND1BQ6P3S1 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
DENND1BQ6P3S1 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
DENND1BQ6P3S1 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
DENND1BQ6P3S1 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC25.02■■□□□ 1.6
DENND1BQ6P3S1 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
DENND1BQ6P3S1 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
DENND1BQ6P3S1 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
DENND1BQ6P3S1 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
DENND1BQ6P3S1 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
DENND1BQ6P3S1 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
DENND1BQ6P3S1 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC25.01■■□□□ 1.59
DENND1BQ6P3S1 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
DENND1BQ6P3S1 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
DENND1BQ6P3S1 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
DENND1BQ6P3S1 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
DENND1BQ6P3S1 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
DENND1BQ6P3S1 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
DENND1BQ6P3S1 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
DENND1BQ6P3S1 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC25■■□□□ 1.59
DENND1BQ6P3S1 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC25■■□□□ 1.59
DENND1BQ6P3S1 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
DENND1BQ6P3S1 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
DENND1BQ6P3S1 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
DENND1BQ6P3S1 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
DENND1BQ6P3S1 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
DENND1BQ6P3S1 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
DENND1BQ6P3S1 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
DENND1BQ6P3S1 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
DENND1BQ6P3S1 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
DENND1BQ6P3S1 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
DENND1BQ6P3S1 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
DENND1BQ6P3S1 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
DENND1BQ6P3S1 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
DENND1BQ6P3S1 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
DENND1BQ6P3S1 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
DENND1BQ6P3S1 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
DENND1BQ6P3S1 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
DENND1BQ6P3S1 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
DENND1BQ6P3S1 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
DENND1BQ6P3S1 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
DENND1BQ6P3S1 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
DENND1BQ6P3S1 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
DENND1BQ6P3S1 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
DENND1BQ6P3S1 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
DENND1BQ6P3S1 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
DENND1BQ6P3S1 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
DENND1BQ6P3S1 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
DENND1BQ6P3S1 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
DENND1BQ6P3S1 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC24.96■■□□□ 1.59
DENND1BQ6P3S1 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
DENND1BQ6P3S1 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
DENND1BQ6P3S1 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
DENND1BQ6P3S1 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
DENND1BQ6P3S1 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
DENND1BQ6P3S1 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
DENND1BQ6P3S1 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
DENND1BQ6P3S1 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
DENND1BQ6P3S1 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
DENND1BQ6P3S1 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
DENND1BQ6P3S1 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
DENND1BQ6P3S1 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
DENND1BQ6P3S1 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC24.94■■□□□ 1.58
DENND1BQ6P3S1 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
DENND1BQ6P3S1 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
DENND1BQ6P3S1 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
DENND1BQ6P3S1 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
DENND1BQ6P3S1 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
DENND1BQ6P3S1 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
DENND1BQ6P3S1 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
DENND1BQ6P3S1 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
DENND1BQ6P3S1 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
DENND1BQ6P3S1 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
DENND1BQ6P3S1 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
DENND1BQ6P3S1 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.2 ms