Protein–RNA interactions for Protein: Q5T2Q4

CCNYL2, Cyclin-Y-like protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 361 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCNYL2Q5T2Q4 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CCNYL2Q5T2Q4 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
CCNYL2Q5T2Q4 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
CCNYL2Q5T2Q4 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
CCNYL2Q5T2Q4 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
CCNYL2Q5T2Q4 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC22.64■■□□□ 1.22
CCNYL2Q5T2Q4 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
CCNYL2Q5T2Q4 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CCNYL2Q5T2Q4 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CCNYL2Q5T2Q4 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CCNYL2Q5T2Q4 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CCNYL2Q5T2Q4 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC22.64■■□□□ 1.21
CCNYL2Q5T2Q4 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
CCNYL2Q5T2Q4 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CCNYL2Q5T2Q4 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CCNYL2Q5T2Q4 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CCNYL2Q5T2Q4 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CCNYL2Q5T2Q4 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
CCNYL2Q5T2Q4 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CCNYL2Q5T2Q4 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CCNYL2Q5T2Q4 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CCNYL2Q5T2Q4 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
CCNYL2Q5T2Q4 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CCNYL2Q5T2Q4 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CCNYL2Q5T2Q4 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CCNYL2Q5T2Q4 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CCNYL2Q5T2Q4 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CCNYL2Q5T2Q4 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CCNYL2Q5T2Q4 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CCNYL2Q5T2Q4 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CCNYL2Q5T2Q4 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CCNYL2Q5T2Q4 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CCNYL2Q5T2Q4 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CCNYL2Q5T2Q4 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CCNYL2Q5T2Q4 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CCNYL2Q5T2Q4 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CCNYL2Q5T2Q4 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CCNYL2Q5T2Q4 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CCNYL2Q5T2Q4 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CCNYL2Q5T2Q4 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CCNYL2Q5T2Q4 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CCNYL2Q5T2Q4 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
CCNYL2Q5T2Q4 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CCNYL2Q5T2Q4 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CCNYL2Q5T2Q4 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CCNYL2Q5T2Q4 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CCNYL2Q5T2Q4 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
CCNYL2Q5T2Q4 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CCNYL2Q5T2Q4 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CCNYL2Q5T2Q4 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CCNYL2Q5T2Q4 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CCNYL2Q5T2Q4 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CCNYL2Q5T2Q4 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CCNYL2Q5T2Q4 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
CCNYL2Q5T2Q4 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CCNYL2Q5T2Q4 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CCNYL2Q5T2Q4 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CCNYL2Q5T2Q4 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CCNYL2Q5T2Q4 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CCNYL2Q5T2Q4 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
CCNYL2Q5T2Q4 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
CCNYL2Q5T2Q4 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
CCNYL2Q5T2Q4 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
CCNYL2Q5T2Q4 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CCNYL2Q5T2Q4 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CCNYL2Q5T2Q4 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CCNYL2Q5T2Q4 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CCNYL2Q5T2Q4 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CCNYL2Q5T2Q4 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CCNYL2Q5T2Q4 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CCNYL2Q5T2Q4 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CCNYL2Q5T2Q4 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CCNYL2Q5T2Q4 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CCNYL2Q5T2Q4 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
CCNYL2Q5T2Q4 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CCNYL2Q5T2Q4 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CCNYL2Q5T2Q4 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CCNYL2Q5T2Q4 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
CCNYL2Q5T2Q4 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CCNYL2Q5T2Q4 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CCNYL2Q5T2Q4 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CCNYL2Q5T2Q4 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CCNYL2Q5T2Q4 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CCNYL2Q5T2Q4 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CCNYL2Q5T2Q4 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CCNYL2Q5T2Q4 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
CCNYL2Q5T2Q4 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CCNYL2Q5T2Q4 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
CCNYL2Q5T2Q4 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
CCNYL2Q5T2Q4 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CCNYL2Q5T2Q4 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CCNYL2Q5T2Q4 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CCNYL2Q5T2Q4 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CCNYL2Q5T2Q4 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CCNYL2Q5T2Q4 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CCNYL2Q5T2Q4 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CCNYL2Q5T2Q4 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CCNYL2Q5T2Q4 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CCNYL2Q5T2Q4 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CCNYL2Q5T2Q4 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.1 ms