Protein–RNA interactions for Protein: Q5QFB9

PAPPA-AS1, Protein PAPPAS, humanhuman

Predictions only

Length 102 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PAPPA-AS1Q5QFB9 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PAPPA-AS1Q5QFB9 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
PAPPA-AS1Q5QFB9 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
PAPPA-AS1Q5QFB9 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PAPPA-AS1Q5QFB9 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
PAPPA-AS1Q5QFB9 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
PAPPA-AS1Q5QFB9 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
PAPPA-AS1Q5QFB9 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
PAPPA-AS1Q5QFB9 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
PAPPA-AS1Q5QFB9 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
PAPPA-AS1Q5QFB9 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
PAPPA-AS1Q5QFB9 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
PAPPA-AS1Q5QFB9 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
PAPPA-AS1Q5QFB9 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
PAPPA-AS1Q5QFB9 MYO15B-232ENST00000610510 9195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
PAPPA-AS1Q5QFB9 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
PAPPA-AS1Q5QFB9 ZSWIM8-220ENST00000604524 5465 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
PAPPA-AS1Q5QFB9 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
PAPPA-AS1Q5QFB9 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC16.66■□□□□ 0.26
PAPPA-AS1Q5QFB9 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
PAPPA-AS1Q5QFB9 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
PAPPA-AS1Q5QFB9 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
PAPPA-AS1Q5QFB9 CASKIN1-201ENST00000343516 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
PAPPA-AS1Q5QFB9 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
PAPPA-AS1Q5QFB9 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
PAPPA-AS1Q5QFB9 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
PAPPA-AS1Q5QFB9 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
PAPPA-AS1Q5QFB9 NRXN2-201ENST00000265459 6621 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
PAPPA-AS1Q5QFB9 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
PAPPA-AS1Q5QFB9 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
PAPPA-AS1Q5QFB9 NES-201ENST00000368223 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
PAPPA-AS1Q5QFB9 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.26
PAPPA-AS1Q5QFB9 KCNK6-201ENST00000263372 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
PAPPA-AS1Q5QFB9 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
PAPPA-AS1Q5QFB9 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
PAPPA-AS1Q5QFB9 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
PAPPA-AS1Q5QFB9 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
PAPPA-AS1Q5QFB9 OBSL1-204ENST00000404537 5841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
PAPPA-AS1Q5QFB9 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
PAPPA-AS1Q5QFB9 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
PAPPA-AS1Q5QFB9 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
PAPPA-AS1Q5QFB9 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
PAPPA-AS1Q5QFB9 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
PAPPA-AS1Q5QFB9 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
PAPPA-AS1Q5QFB9 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
PAPPA-AS1Q5QFB9 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
PAPPA-AS1Q5QFB9 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
PAPPA-AS1Q5QFB9 SRCIN1-213ENST00000617146 7058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
PAPPA-AS1Q5QFB9 QKI-203ENST00000361752 9463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
PAPPA-AS1Q5QFB9 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
PAPPA-AS1Q5QFB9 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
PAPPA-AS1Q5QFB9 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
PAPPA-AS1Q5QFB9 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
PAPPA-AS1Q5QFB9 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
PAPPA-AS1Q5QFB9 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
PAPPA-AS1Q5QFB9 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
PAPPA-AS1Q5QFB9 FAM83H-201ENST00000388913 5654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
PAPPA-AS1Q5QFB9 IRS2-201ENST00000375856 8138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
PAPPA-AS1Q5QFB9 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
PAPPA-AS1Q5QFB9 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
PAPPA-AS1Q5QFB9 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
PAPPA-AS1Q5QFB9 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
PAPPA-AS1Q5QFB9 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
PAPPA-AS1Q5QFB9 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
PAPPA-AS1Q5QFB9 EPHA10-202ENST00000373048 5425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
PAPPA-AS1Q5QFB9 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
PAPPA-AS1Q5QFB9 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
PAPPA-AS1Q5QFB9 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
PAPPA-AS1Q5QFB9 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
PAPPA-AS1Q5QFB9 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
PAPPA-AS1Q5QFB9 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
PAPPA-AS1Q5QFB9 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
PAPPA-AS1Q5QFB9 MAML1-201ENST00000292599 5723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
PAPPA-AS1Q5QFB9 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
PAPPA-AS1Q5QFB9 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
PAPPA-AS1Q5QFB9 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
PAPPA-AS1Q5QFB9 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
PAPPA-AS1Q5QFB9 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PAPPA-AS1Q5QFB9 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PAPPA-AS1Q5QFB9 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PAPPA-AS1Q5QFB9 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
PAPPA-AS1Q5QFB9 RHOBTB3-201ENST00000379982 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PAPPA-AS1Q5QFB9 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PAPPA-AS1Q5QFB9 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
PAPPA-AS1Q5QFB9 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PAPPA-AS1Q5QFB9 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
PAPPA-AS1Q5QFB9 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PAPPA-AS1Q5QFB9 ACVR1C-201ENST00000243349 8994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
PAPPA-AS1Q5QFB9 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
PAPPA-AS1Q5QFB9 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
PAPPA-AS1Q5QFB9 XYLT1-201ENST00000261381 9891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
PAPPA-AS1Q5QFB9 ADGRB1-201ENST00000323289 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
PAPPA-AS1Q5QFB9 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
PAPPA-AS1Q5QFB9 KMT5B-201ENST00000304363 5837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
PAPPA-AS1Q5QFB9 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
PAPPA-AS1Q5QFB9 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
PAPPA-AS1Q5QFB9 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
PAPPA-AS1Q5QFB9 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
PAPPA-AS1Q5QFB9 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
PAPPA-AS1Q5QFB9 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61.3 ms