Protein–RNA interactions for Protein: Q3KR37

GRAMD1B, GRAM domain-containing protein 1B, humanhuman

Predictions only

Length 738 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRAMD1BQ3KR37 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
GRAMD1BQ3KR37 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
GRAMD1BQ3KR37 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
GRAMD1BQ3KR37 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
GRAMD1BQ3KR37 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
GRAMD1BQ3KR37 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
GRAMD1BQ3KR37 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
GRAMD1BQ3KR37 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
GRAMD1BQ3KR37 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
GRAMD1BQ3KR37 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
GRAMD1BQ3KR37 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
GRAMD1BQ3KR37 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
GRAMD1BQ3KR37 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
GRAMD1BQ3KR37 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
GRAMD1BQ3KR37 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
GRAMD1BQ3KR37 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
GRAMD1BQ3KR37 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
GRAMD1BQ3KR37 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
GRAMD1BQ3KR37 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
GRAMD1BQ3KR37 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
GRAMD1BQ3KR37 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
GRAMD1BQ3KR37 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
GRAMD1BQ3KR37 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
GRAMD1BQ3KR37 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
GRAMD1BQ3KR37 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
GRAMD1BQ3KR37 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
GRAMD1BQ3KR37 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
GRAMD1BQ3KR37 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
GRAMD1BQ3KR37 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
GRAMD1BQ3KR37 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
GRAMD1BQ3KR37 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
GRAMD1BQ3KR37 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
GRAMD1BQ3KR37 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
GRAMD1BQ3KR37 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
GRAMD1BQ3KR37 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
GRAMD1BQ3KR37 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
GRAMD1BQ3KR37 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
GRAMD1BQ3KR37 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
GRAMD1BQ3KR37 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
GRAMD1BQ3KR37 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
GRAMD1BQ3KR37 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
GRAMD1BQ3KR37 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
GRAMD1BQ3KR37 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
GRAMD1BQ3KR37 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
GRAMD1BQ3KR37 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
GRAMD1BQ3KR37 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
GRAMD1BQ3KR37 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
GRAMD1BQ3KR37 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
GRAMD1BQ3KR37 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
GRAMD1BQ3KR37 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
GRAMD1BQ3KR37 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
GRAMD1BQ3KR37 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
GRAMD1BQ3KR37 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
GRAMD1BQ3KR37 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
GRAMD1BQ3KR37 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
GRAMD1BQ3KR37 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
GRAMD1BQ3KR37 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
GRAMD1BQ3KR37 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
GRAMD1BQ3KR37 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
GRAMD1BQ3KR37 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
GRAMD1BQ3KR37 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
GRAMD1BQ3KR37 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
GRAMD1BQ3KR37 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
GRAMD1BQ3KR37 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
GRAMD1BQ3KR37 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
GRAMD1BQ3KR37 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
GRAMD1BQ3KR37 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
GRAMD1BQ3KR37 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
GRAMD1BQ3KR37 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
GRAMD1BQ3KR37 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
GRAMD1BQ3KR37 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
GRAMD1BQ3KR37 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
GRAMD1BQ3KR37 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
GRAMD1BQ3KR37 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
GRAMD1BQ3KR37 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
GRAMD1BQ3KR37 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
GRAMD1BQ3KR37 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
GRAMD1BQ3KR37 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
GRAMD1BQ3KR37 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.65■■□□□ 1.22
GRAMD1BQ3KR37 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
GRAMD1BQ3KR37 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
GRAMD1BQ3KR37 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
GRAMD1BQ3KR37 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
GRAMD1BQ3KR37 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
GRAMD1BQ3KR37 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
GRAMD1BQ3KR37 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
GRAMD1BQ3KR37 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
GRAMD1BQ3KR37 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
GRAMD1BQ3KR37 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
GRAMD1BQ3KR37 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
GRAMD1BQ3KR37 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
GRAMD1BQ3KR37 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
GRAMD1BQ3KR37 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
GRAMD1BQ3KR37 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
GRAMD1BQ3KR37 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
GRAMD1BQ3KR37 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
GRAMD1BQ3KR37 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
GRAMD1BQ3KR37 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
GRAMD1BQ3KR37 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
GRAMD1BQ3KR37 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.4 ms