Protein–RNA interactions for Protein: Q15929

ZNF56, Putative zinc finger protein 56, humanhuman

Predictions only

Length 161 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF56Q15929 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
ZNF56Q15929 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
ZNF56Q15929 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
ZNF56Q15929 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
ZNF56Q15929 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
ZNF56Q15929 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
ZNF56Q15929 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
ZNF56Q15929 EMILIN2-201ENST00000254528 5910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
ZNF56Q15929 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
ZNF56Q15929 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
ZNF56Q15929 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC17.07■□□□□ 0.32
ZNF56Q15929 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
ZNF56Q15929 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
ZNF56Q15929 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC17.07■□□□□ 0.32
ZNF56Q15929 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
ZNF56Q15929 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
ZNF56Q15929 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
ZNF56Q15929 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
ZNF56Q15929 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
ZNF56Q15929 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
ZNF56Q15929 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
ZNF56Q15929 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
ZNF56Q15929 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
ZNF56Q15929 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
ZNF56Q15929 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
ZNF56Q15929 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
ZNF56Q15929 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
ZNF56Q15929 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
ZNF56Q15929 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
ZNF56Q15929 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC17.05■□□□□ 0.32
ZNF56Q15929 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
ZNF56Q15929 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
ZNF56Q15929 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
ZNF56Q15929 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
ZNF56Q15929 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
ZNF56Q15929 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
ZNF56Q15929 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
ZNF56Q15929 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
ZNF56Q15929 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
ZNF56Q15929 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
ZNF56Q15929 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
ZNF56Q15929 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
ZNF56Q15929 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
ZNF56Q15929 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
ZNF56Q15929 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
ZNF56Q15929 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
ZNF56Q15929 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
ZNF56Q15929 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
ZNF56Q15929 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
ZNF56Q15929 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
ZNF56Q15929 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
ZNF56Q15929 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC17.04■□□□□ 0.32
ZNF56Q15929 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
ZNF56Q15929 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
ZNF56Q15929 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
ZNF56Q15929 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
ZNF56Q15929 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
ZNF56Q15929 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
ZNF56Q15929 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC17.04■□□□□ 0.32
ZNF56Q15929 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
ZNF56Q15929 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
ZNF56Q15929 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
ZNF56Q15929 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
ZNF56Q15929 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
ZNF56Q15929 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
ZNF56Q15929 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
ZNF56Q15929 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
ZNF56Q15929 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
ZNF56Q15929 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
ZNF56Q15929 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
ZNF56Q15929 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
ZNF56Q15929 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
ZNF56Q15929 SOBP-201ENST00000317357 5245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
ZNF56Q15929 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
ZNF56Q15929 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
ZNF56Q15929 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
ZNF56Q15929 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
ZNF56Q15929 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
ZNF56Q15929 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
ZNF56Q15929 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
ZNF56Q15929 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
ZNF56Q15929 SCYL2-201ENST00000360820 5779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
ZNF56Q15929 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
ZNF56Q15929 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
ZNF56Q15929 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
ZNF56Q15929 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
ZNF56Q15929 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ZNF56Q15929 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ZNF56Q15929 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ZNF56Q15929 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ZNF56Q15929 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ZNF56Q15929 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ZNF56Q15929 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
ZNF56Q15929 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ZNF56Q15929 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ZNF56Q15929 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
ZNF56Q15929 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
ZNF56Q15929 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ZNF56Q15929 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ZNF56Q15929 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54 ms