Protein–RNA interactions for Protein: Q09470

KCNA1, Potassium voltage-gated channel subfamily A member 1, humanhuman

Predictions only

Length 495 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNA1Q09470 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
KCNA1Q09470 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
KCNA1Q09470 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
KCNA1Q09470 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC26.03■■□□□ 1.76
KCNA1Q09470 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
KCNA1Q09470 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
KCNA1Q09470 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
KCNA1Q09470 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
KCNA1Q09470 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
KCNA1Q09470 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
KCNA1Q09470 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
KCNA1Q09470 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC26.02■■□□□ 1.76
KCNA1Q09470 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
KCNA1Q09470 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
KCNA1Q09470 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
KCNA1Q09470 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
KCNA1Q09470 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
KCNA1Q09470 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
KCNA1Q09470 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
KCNA1Q09470 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
KCNA1Q09470 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC26.01■■□□□ 1.75
KCNA1Q09470 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
KCNA1Q09470 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
KCNA1Q09470 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
KCNA1Q09470 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
KCNA1Q09470 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC26■■□□□ 1.75
KCNA1Q09470 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
KCNA1Q09470 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC25.99■■□□□ 1.75
KCNA1Q09470 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
KCNA1Q09470 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
KCNA1Q09470 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
KCNA1Q09470 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
KCNA1Q09470 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC25.99■■□□□ 1.75
KCNA1Q09470 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
KCNA1Q09470 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
KCNA1Q09470 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
KCNA1Q09470 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
KCNA1Q09470 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC25.98■■□□□ 1.75
KCNA1Q09470 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
KCNA1Q09470 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
KCNA1Q09470 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
KCNA1Q09470 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
KCNA1Q09470 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
KCNA1Q09470 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
KCNA1Q09470 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
KCNA1Q09470 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
KCNA1Q09470 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
KCNA1Q09470 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
KCNA1Q09470 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
KCNA1Q09470 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
KCNA1Q09470 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
KCNA1Q09470 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
KCNA1Q09470 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
KCNA1Q09470 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
KCNA1Q09470 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
KCNA1Q09470 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
KCNA1Q09470 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
KCNA1Q09470 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
KCNA1Q09470 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
KCNA1Q09470 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
KCNA1Q09470 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
KCNA1Q09470 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
KCNA1Q09470 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
KCNA1Q09470 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
KCNA1Q09470 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
KCNA1Q09470 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
KCNA1Q09470 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
KCNA1Q09470 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
KCNA1Q09470 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
KCNA1Q09470 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
KCNA1Q09470 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
KCNA1Q09470 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC25.93■■□□□ 1.74
KCNA1Q09470 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
KCNA1Q09470 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
KCNA1Q09470 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
KCNA1Q09470 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
KCNA1Q09470 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
KCNA1Q09470 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
KCNA1Q09470 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
KCNA1Q09470 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
KCNA1Q09470 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
KCNA1Q09470 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
KCNA1Q09470 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
KCNA1Q09470 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
KCNA1Q09470 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
KCNA1Q09470 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
KCNA1Q09470 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
KCNA1Q09470 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
KCNA1Q09470 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
KCNA1Q09470 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
KCNA1Q09470 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
KCNA1Q09470 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
KCNA1Q09470 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
KCNA1Q09470 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
KCNA1Q09470 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
KCNA1Q09470 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
KCNA1Q09470 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
KCNA1Q09470 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
KCNA1Q09470 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
KCNA1Q09470 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 82.8 ms