Protein–RNA interactions for Protein: Q06265

EXOSC9, Exosome complex component RRP45, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 439 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EXOSC9Q06265 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.61■■■□□ 2.49
EXOSC9Q06265 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.61■■■□□ 2.49
EXOSC9Q06265 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.6■■■□□ 2.49
EXOSC9Q06265 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC30.6■■■□□ 2.49
EXOSC9Q06265 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.6■■■□□ 2.49
EXOSC9Q06265 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC30.6■■■□□ 2.49
EXOSC9Q06265 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.6■■■□□ 2.49
EXOSC9Q06265 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.6■■■□□ 2.49
EXOSC9Q06265 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC30.6■■■□□ 2.49
EXOSC9Q06265 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.6■■■□□ 2.49
EXOSC9Q06265 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC30.59■■■□□ 2.49
EXOSC9Q06265 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC30.59■■■□□ 2.49
EXOSC9Q06265 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC30.59■■■□□ 2.49
EXOSC9Q06265 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC30.59■■■□□ 2.49
EXOSC9Q06265 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.59■■■□□ 2.49
EXOSC9Q06265 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.59■■■□□ 2.49
EXOSC9Q06265 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.59■■■□□ 2.49
EXOSC9Q06265 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.58■■■□□ 2.49
EXOSC9Q06265 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC30.58■■■□□ 2.49
EXOSC9Q06265 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.58■■■□□ 2.49
EXOSC9Q06265 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.58■■■□□ 2.49
EXOSC9Q06265 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.58■■■□□ 2.49
EXOSC9Q06265 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.58■■■□□ 2.49
EXOSC9Q06265 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC30.58■■■□□ 2.49
EXOSC9Q06265 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.57■■■□□ 2.48
EXOSC9Q06265 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.57■■■□□ 2.48
EXOSC9Q06265 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.57■■■□□ 2.48
EXOSC9Q06265 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC30.57■■■□□ 2.48
EXOSC9Q06265 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC30.57■■■□□ 2.48
EXOSC9Q06265 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.57■■■□□ 2.48
EXOSC9Q06265 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.56■■■□□ 2.48
EXOSC9Q06265 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC30.56■■■□□ 2.48
EXOSC9Q06265 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.56■■■□□ 2.48
EXOSC9Q06265 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC30.56■■■□□ 2.48
EXOSC9Q06265 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.56■■■□□ 2.48
EXOSC9Q06265 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.56■■■□□ 2.48
EXOSC9Q06265 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC30.56■■■□□ 2.48
EXOSC9Q06265 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.56■■■□□ 2.48
EXOSC9Q06265 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.56■■■□□ 2.48
EXOSC9Q06265 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC30.55■■■□□ 2.48
EXOSC9Q06265 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC30.55■■■□□ 2.48
EXOSC9Q06265 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC30.55■■■□□ 2.48
EXOSC9Q06265 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC30.55■■■□□ 2.48
EXOSC9Q06265 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.55■■■□□ 2.48
EXOSC9Q06265 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.54■■■□□ 2.48
EXOSC9Q06265 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.54■■■□□ 2.48
EXOSC9Q06265 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.54■■■□□ 2.48
EXOSC9Q06265 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.54■■■□□ 2.48
EXOSC9Q06265 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC30.54■■■□□ 2.48
EXOSC9Q06265 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.54■■■□□ 2.48
EXOSC9Q06265 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC30.54■■■□□ 2.48
EXOSC9Q06265 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.53■■■□□ 2.48
EXOSC9Q06265 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.53■■■□□ 2.48
EXOSC9Q06265 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.53■■■□□ 2.48
EXOSC9Q06265 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC30.53■■■□□ 2.48
EXOSC9Q06265 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.53■■■□□ 2.48
EXOSC9Q06265 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC30.53■■■□□ 2.48
EXOSC9Q06265 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.53■■■□□ 2.48
EXOSC9Q06265 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.53■■■□□ 2.48
EXOSC9Q06265 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.53■■■□□ 2.48
EXOSC9Q06265 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.52■■■□□ 2.48
EXOSC9Q06265 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC30.52■■■□□ 2.48
EXOSC9Q06265 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC30.52■■■□□ 2.48
EXOSC9Q06265 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC30.52■■■□□ 2.48
EXOSC9Q06265 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.52■■■□□ 2.48
EXOSC9Q06265 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.52■■■□□ 2.48
EXOSC9Q06265 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC30.52■■■□□ 2.48
EXOSC9Q06265 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.52■■■□□ 2.48
EXOSC9Q06265 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.51■■■□□ 2.47
EXOSC9Q06265 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC30.51■■■□□ 2.47
EXOSC9Q06265 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC30.51■■■□□ 2.47
EXOSC9Q06265 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.51■■■□□ 2.47
EXOSC9Q06265 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.51■■■□□ 2.47
EXOSC9Q06265 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.5■■■□□ 2.47
EXOSC9Q06265 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.5■■■□□ 2.47
EXOSC9Q06265 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.5■■■□□ 2.47
EXOSC9Q06265 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.5■■■□□ 2.47
EXOSC9Q06265 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.5■■■□□ 2.47
EXOSC9Q06265 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.5■■■□□ 2.47
EXOSC9Q06265 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC30.5■■■□□ 2.47
EXOSC9Q06265 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC30.49■■■□□ 2.47
EXOSC9Q06265 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC30.49■■■□□ 2.47
EXOSC9Q06265 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC30.49■■■□□ 2.47
EXOSC9Q06265 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC30.48■■■□□ 2.47
EXOSC9Q06265 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC30.48■■■□□ 2.47
EXOSC9Q06265 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.48■■■□□ 2.47
EXOSC9Q06265 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC30.48■■■□□ 2.47
EXOSC9Q06265 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.48■■■□□ 2.47
EXOSC9Q06265 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.48■■■□□ 2.47
EXOSC9Q06265 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.48■■■□□ 2.47
EXOSC9Q06265 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.48■■■□□ 2.47
EXOSC9Q06265 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC30.47■■■□□ 2.47
EXOSC9Q06265 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
EXOSC9Q06265 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC30.47■■■□□ 2.47
EXOSC9Q06265 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC30.47■■■□□ 2.47
EXOSC9Q06265 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
EXOSC9Q06265 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
EXOSC9Q06265 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
EXOSC9Q06265 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.46■■■□□ 2.47
EXOSC9Q06265 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC30.46■■■□□ 2.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 85.4 ms