Protein–RNA interactions for Protein: Q04771

ACVR1, Activin receptor type-1, humanhuman

Predictions only

Length 509 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACVR1Q04771 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
ACVR1Q04771 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
ACVR1Q04771 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
ACVR1Q04771 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
ACVR1Q04771 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
ACVR1Q04771 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
ACVR1Q04771 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
ACVR1Q04771 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
ACVR1Q04771 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
ACVR1Q04771 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
ACVR1Q04771 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
ACVR1Q04771 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
ACVR1Q04771 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
ACVR1Q04771 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
ACVR1Q04771 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
ACVR1Q04771 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
ACVR1Q04771 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
ACVR1Q04771 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
ACVR1Q04771 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
ACVR1Q04771 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
ACVR1Q04771 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
ACVR1Q04771 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
ACVR1Q04771 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
ACVR1Q04771 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
ACVR1Q04771 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
ACVR1Q04771 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
ACVR1Q04771 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
ACVR1Q04771 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
ACVR1Q04771 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
ACVR1Q04771 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
ACVR1Q04771 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
ACVR1Q04771 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
ACVR1Q04771 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
ACVR1Q04771 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
ACVR1Q04771 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
ACVR1Q04771 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
ACVR1Q04771 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
ACVR1Q04771 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
ACVR1Q04771 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
ACVR1Q04771 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
ACVR1Q04771 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
ACVR1Q04771 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
ACVR1Q04771 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
ACVR1Q04771 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
ACVR1Q04771 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
ACVR1Q04771 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
ACVR1Q04771 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
ACVR1Q04771 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
ACVR1Q04771 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
ACVR1Q04771 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
ACVR1Q04771 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
ACVR1Q04771 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
ACVR1Q04771 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
ACVR1Q04771 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
ACVR1Q04771 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
ACVR1Q04771 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
ACVR1Q04771 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
ACVR1Q04771 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
ACVR1Q04771 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
ACVR1Q04771 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
ACVR1Q04771 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
ACVR1Q04771 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
ACVR1Q04771 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
ACVR1Q04771 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
ACVR1Q04771 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
ACVR1Q04771 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
ACVR1Q04771 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
ACVR1Q04771 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
ACVR1Q04771 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
ACVR1Q04771 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
ACVR1Q04771 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
ACVR1Q04771 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
ACVR1Q04771 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
ACVR1Q04771 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
ACVR1Q04771 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
ACVR1Q04771 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
ACVR1Q04771 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
ACVR1Q04771 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
ACVR1Q04771 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
ACVR1Q04771 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
ACVR1Q04771 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
ACVR1Q04771 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
ACVR1Q04771 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
ACVR1Q04771 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
ACVR1Q04771 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
ACVR1Q04771 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
ACVR1Q04771 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
ACVR1Q04771 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
ACVR1Q04771 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
ACVR1Q04771 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
ACVR1Q04771 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
ACVR1Q04771 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
ACVR1Q04771 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
ACVR1Q04771 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
ACVR1Q04771 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
ACVR1Q04771 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
ACVR1Q04771 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
ACVR1Q04771 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
ACVR1Q04771 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
ACVR1Q04771 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.5 ms