Protein–RNA interactions for Protein: Q00888

PSG4, Pregnancy-specific beta-1-glycoprotein 4, humanhuman

Predictions only

Length 419 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSG4Q00888 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
PSG4Q00888 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
PSG4Q00888 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
PSG4Q00888 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
PSG4Q00888 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
PSG4Q00888 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
PSG4Q00888 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
PSG4Q00888 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
PSG4Q00888 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
PSG4Q00888 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
PSG4Q00888 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
PSG4Q00888 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
PSG4Q00888 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
PSG4Q00888 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
PSG4Q00888 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
PSG4Q00888 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
PSG4Q00888 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
PSG4Q00888 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
PSG4Q00888 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
PSG4Q00888 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
PSG4Q00888 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
PSG4Q00888 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
PSG4Q00888 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
PSG4Q00888 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC20.61■□□□□ 0.89
PSG4Q00888 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
PSG4Q00888 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC20.61■□□□□ 0.89
PSG4Q00888 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
PSG4Q00888 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
PSG4Q00888 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
PSG4Q00888 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
PSG4Q00888 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
PSG4Q00888 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
PSG4Q00888 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
PSG4Q00888 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
PSG4Q00888 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
PSG4Q00888 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
PSG4Q00888 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
PSG4Q00888 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
PSG4Q00888 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
PSG4Q00888 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC20.59■□□□□ 0.89
PSG4Q00888 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
PSG4Q00888 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
PSG4Q00888 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
PSG4Q00888 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
PSG4Q00888 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
PSG4Q00888 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
PSG4Q00888 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.88
PSG4Q00888 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
PSG4Q00888 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
PSG4Q00888 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
PSG4Q00888 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
PSG4Q00888 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
PSG4Q00888 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
PSG4Q00888 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
PSG4Q00888 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
PSG4Q00888 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
PSG4Q00888 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
PSG4Q00888 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
PSG4Q00888 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
PSG4Q00888 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
PSG4Q00888 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
PSG4Q00888 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
PSG4Q00888 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
PSG4Q00888 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
PSG4Q00888 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
PSG4Q00888 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
PSG4Q00888 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
PSG4Q00888 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
PSG4Q00888 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC20.55■□□□□ 0.88
PSG4Q00888 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
PSG4Q00888 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC20.55■□□□□ 0.88
PSG4Q00888 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
PSG4Q00888 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
PSG4Q00888 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
PSG4Q00888 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
PSG4Q00888 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
PSG4Q00888 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
PSG4Q00888 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC20.54■□□□□ 0.88
PSG4Q00888 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC20.54■□□□□ 0.88
PSG4Q00888 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC20.54■□□□□ 0.88
PSG4Q00888 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
PSG4Q00888 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
PSG4Q00888 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
PSG4Q00888 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
PSG4Q00888 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
PSG4Q00888 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
PSG4Q00888 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
PSG4Q00888 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
PSG4Q00888 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
PSG4Q00888 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
PSG4Q00888 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
PSG4Q00888 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
PSG4Q00888 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
PSG4Q00888 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
PSG4Q00888 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
PSG4Q00888 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC20.52■□□□□ 0.88
PSG4Q00888 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC20.52■□□□□ 0.88
PSG4Q00888 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
PSG4Q00888 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
PSG4Q00888 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.7 ms