Protein–RNA interactions for Protein: P68400

CSNK2A1, Casein kinase II subunit alpha, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 391 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSNK2A1P68400 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC21.23■□□□□ 0.99
CSNK2A1P68400 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
CSNK2A1P68400 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
CSNK2A1P68400 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
CSNK2A1P68400 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
CSNK2A1P68400 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CSNK2A1P68400 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CSNK2A1P68400 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
CSNK2A1P68400 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
CSNK2A1P68400 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CSNK2A1P68400 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
CSNK2A1P68400 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CSNK2A1P68400 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CSNK2A1P68400 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
CSNK2A1P68400 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
CSNK2A1P68400 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CSNK2A1P68400 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CSNK2A1P68400 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CSNK2A1P68400 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
CSNK2A1P68400 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
CSNK2A1P68400 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
CSNK2A1P68400 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
CSNK2A1P68400 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
CSNK2A1P68400 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
CSNK2A1P68400 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CSNK2A1P68400 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
CSNK2A1P68400 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
CSNK2A1P68400 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
CSNK2A1P68400 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
CSNK2A1P68400 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
CSNK2A1P68400 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
CSNK2A1P68400 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
CSNK2A1P68400 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
CSNK2A1P68400 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
CSNK2A1P68400 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CSNK2A1P68400 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CSNK2A1P68400 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CSNK2A1P68400 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CSNK2A1P68400 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CSNK2A1P68400 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
CSNK2A1P68400 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
CSNK2A1P68400 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
CSNK2A1P68400 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
CSNK2A1P68400 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
CSNK2A1P68400 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
CSNK2A1P68400 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
CSNK2A1P68400 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
CSNK2A1P68400 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
CSNK2A1P68400 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
CSNK2A1P68400 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
CSNK2A1P68400 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
CSNK2A1P68400 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
CSNK2A1P68400 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
CSNK2A1P68400 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
CSNK2A1P68400 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
CSNK2A1P68400 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
CSNK2A1P68400 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
CSNK2A1P68400 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
CSNK2A1P68400 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
CSNK2A1P68400 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
CSNK2A1P68400 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
CSNK2A1P68400 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
CSNK2A1P68400 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
CSNK2A1P68400 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CSNK2A1P68400 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CSNK2A1P68400 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CSNK2A1P68400 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CSNK2A1P68400 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC21.15■□□□□ 0.98
CSNK2A1P68400 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
CSNK2A1P68400 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CSNK2A1P68400 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CSNK2A1P68400 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
CSNK2A1P68400 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
CSNK2A1P68400 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
CSNK2A1P68400 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
CSNK2A1P68400 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
CSNK2A1P68400 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
CSNK2A1P68400 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
CSNK2A1P68400 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
CSNK2A1P68400 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
CSNK2A1P68400 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
CSNK2A1P68400 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
CSNK2A1P68400 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
CSNK2A1P68400 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
CSNK2A1P68400 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CSNK2A1P68400 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CSNK2A1P68400 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
CSNK2A1P68400 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CSNK2A1P68400 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CSNK2A1P68400 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CSNK2A1P68400 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
CSNK2A1P68400 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CSNK2A1P68400 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CSNK2A1P68400 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CSNK2A1P68400 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CSNK2A1P68400 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CSNK2A1P68400 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
CSNK2A1P68400 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
CSNK2A1P68400 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CSNK2A1P68400 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.5 ms