Protein–RNA interactions for Protein: P48553

TRAPPC10, Trafficking protein particle complex subunit 10, humanhuman

Predictions only

Length 1,259 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC10P48553 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
TRAPPC10P48553 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC26.88■■□□□ 1.89
TRAPPC10P48553 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
TRAPPC10P48553 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
TRAPPC10P48553 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
TRAPPC10P48553 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
TRAPPC10P48553 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
TRAPPC10P48553 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
TRAPPC10P48553 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
TRAPPC10P48553 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
TRAPPC10P48553 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
TRAPPC10P48553 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
TRAPPC10P48553 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
TRAPPC10P48553 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC26.86■■□□□ 1.89
TRAPPC10P48553 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
TRAPPC10P48553 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
TRAPPC10P48553 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
TRAPPC10P48553 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
TRAPPC10P48553 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
TRAPPC10P48553 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
TRAPPC10P48553 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
TRAPPC10P48553 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC26.85■■□□□ 1.89
TRAPPC10P48553 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
TRAPPC10P48553 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
TRAPPC10P48553 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
TRAPPC10P48553 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
TRAPPC10P48553 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
TRAPPC10P48553 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
TRAPPC10P48553 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
TRAPPC10P48553 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
TRAPPC10P48553 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
TRAPPC10P48553 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
TRAPPC10P48553 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
TRAPPC10P48553 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
TRAPPC10P48553 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
TRAPPC10P48553 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
TRAPPC10P48553 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
TRAPPC10P48553 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
TRAPPC10P48553 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
TRAPPC10P48553 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
TRAPPC10P48553 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
TRAPPC10P48553 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
TRAPPC10P48553 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC26.82■■□□□ 1.88
TRAPPC10P48553 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
TRAPPC10P48553 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC26.82■■□□□ 1.88
TRAPPC10P48553 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
TRAPPC10P48553 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
TRAPPC10P48553 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
TRAPPC10P48553 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
TRAPPC10P48553 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
TRAPPC10P48553 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
TRAPPC10P48553 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
TRAPPC10P48553 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
TRAPPC10P48553 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
TRAPPC10P48553 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
TRAPPC10P48553 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC26.81■■□□□ 1.88
TRAPPC10P48553 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
TRAPPC10P48553 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
TRAPPC10P48553 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
TRAPPC10P48553 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
TRAPPC10P48553 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
TRAPPC10P48553 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
TRAPPC10P48553 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
TRAPPC10P48553 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC26.79■■□□□ 1.88
TRAPPC10P48553 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
TRAPPC10P48553 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
TRAPPC10P48553 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC26.79■■□□□ 1.88
TRAPPC10P48553 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
TRAPPC10P48553 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC26.79■■□□□ 1.88
TRAPPC10P48553 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
TRAPPC10P48553 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
TRAPPC10P48553 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
TRAPPC10P48553 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
TRAPPC10P48553 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC26.78■■□□□ 1.88
TRAPPC10P48553 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
TRAPPC10P48553 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
TRAPPC10P48553 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
TRAPPC10P48553 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
TRAPPC10P48553 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
TRAPPC10P48553 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
TRAPPC10P48553 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
TRAPPC10P48553 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
TRAPPC10P48553 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
TRAPPC10P48553 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC26.77■■□□□ 1.88
TRAPPC10P48553 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC26.77■■□□□ 1.88
TRAPPC10P48553 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC26.77■■□□□ 1.88
TRAPPC10P48553 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
TRAPPC10P48553 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
TRAPPC10P48553 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
TRAPPC10P48553 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
TRAPPC10P48553 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC26.76■■□□□ 1.87
TRAPPC10P48553 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
TRAPPC10P48553 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
TRAPPC10P48553 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
TRAPPC10P48553 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
TRAPPC10P48553 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
TRAPPC10P48553 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
TRAPPC10P48553 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC26.75■■□□□ 1.87
TRAPPC10P48553 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
TRAPPC10P48553 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC26.75■■□□□ 1.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.6 ms