Protein–RNA interactions for Protein: P46939

UTRN, Utrophin, humanhuman

Predictions only

Length 3,433 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UTRNP46939 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC29.64■■■□□ 2.34
UTRNP46939 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC29.64■■■□□ 2.33
UTRNP46939 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC29.64■■■□□ 2.33
UTRNP46939 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
UTRNP46939 TMEM263-203ENST00000547242 811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.63■■■□□ 2.33
UTRNP46939 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC29.63■■■□□ 2.33
UTRNP46939 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
UTRNP46939 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.62■■■□□ 2.33
UTRNP46939 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
UTRNP46939 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC29.62■■■□□ 2.33
UTRNP46939 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.62■■■□□ 2.33
UTRNP46939 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
UTRNP46939 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC29.61■■■□□ 2.33
UTRNP46939 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
UTRNP46939 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC29.61■■■□□ 2.33
UTRNP46939 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC29.61■■■□□ 2.33
UTRNP46939 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
UTRNP46939 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC29.61■■■□□ 2.33
UTRNP46939 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
UTRNP46939 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
UTRNP46939 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.59■■■□□ 2.33
UTRNP46939 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
UTRNP46939 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC29.59■■■□□ 2.33
UTRNP46939 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
UTRNP46939 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
UTRNP46939 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
UTRNP46939 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
UTRNP46939 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
UTRNP46939 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC29.58■■■□□ 2.33
UTRNP46939 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC29.58■■■□□ 2.33
UTRNP46939 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
UTRNP46939 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
UTRNP46939 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
UTRNP46939 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
UTRNP46939 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC29.57■■■□□ 2.32
UTRNP46939 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC29.57■■■□□ 2.32
UTRNP46939 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC29.57■■■□□ 2.32
UTRNP46939 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.57■■■□□ 2.32
UTRNP46939 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
UTRNP46939 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
UTRNP46939 C11orf63-202ENST00000307257 1964 ntTSL 2 BASIC29.56■■■□□ 2.32
UTRNP46939 HIST1H2AM-201ENST00000359611 393 ntAPPRIS P1 BASIC29.56■■■□□ 2.32
UTRNP46939 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC29.56■■■□□ 2.32
UTRNP46939 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC29.56■■■□□ 2.32
UTRNP46939 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
UTRNP46939 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
UTRNP46939 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC29.55■■■□□ 2.32
UTRNP46939 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
UTRNP46939 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC29.55■■■□□ 2.32
UTRNP46939 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC29.55■■■□□ 2.32
UTRNP46939 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.55■■■□□ 2.32
UTRNP46939 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC29.54■■■□□ 2.32
UTRNP46939 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
UTRNP46939 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
UTRNP46939 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC29.54■■■□□ 2.32
UTRNP46939 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
UTRNP46939 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.53■■■□□ 2.32
UTRNP46939 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC29.53■■■□□ 2.32
UTRNP46939 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
UTRNP46939 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC29.52■■■□□ 2.32
UTRNP46939 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC29.52■■■□□ 2.32
UTRNP46939 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC29.52■■■□□ 2.32
UTRNP46939 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC29.52■■■□□ 2.32
UTRNP46939 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC29.52■■■□□ 2.32
UTRNP46939 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
UTRNP46939 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC29.51■■■□□ 2.31
UTRNP46939 AC066615.1-201ENST00000640911 628 ntBASIC29.51■■■□□ 2.31
UTRNP46939 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC29.51■■■□□ 2.31
UTRNP46939 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC29.51■■■□□ 2.31
UTRNP46939 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC29.51■■■□□ 2.31
UTRNP46939 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC29.5■■■□□ 2.31
UTRNP46939 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC29.5■■■□□ 2.31
UTRNP46939 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
UTRNP46939 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC29.5■■■□□ 2.31
UTRNP46939 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC29.5■■■□□ 2.31
UTRNP46939 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
UTRNP46939 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.49■■■□□ 2.31
UTRNP46939 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC29.49■■■□□ 2.31
UTRNP46939 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
UTRNP46939 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.49■■■□□ 2.31
UTRNP46939 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC29.49■■■□□ 2.31
UTRNP46939 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC29.49■■■□□ 2.31
UTRNP46939 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC29.49■■■□□ 2.31
UTRNP46939 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC29.48■■■□□ 2.31
UTRNP46939 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC29.48■■■□□ 2.31
UTRNP46939 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC29.48■■■□□ 2.31
UTRNP46939 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC29.47■■■□□ 2.31
UTRNP46939 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC29.47■■■□□ 2.31
UTRNP46939 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
UTRNP46939 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC29.47■■■□□ 2.31
UTRNP46939 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.47■■■□□ 2.31
UTRNP46939 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC29.46■■■□□ 2.31
UTRNP46939 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
UTRNP46939 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
UTRNP46939 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
UTRNP46939 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC29.45■■■□□ 2.31
UTRNP46939 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
UTRNP46939 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.3
UTRNP46939 AC108693.2-201ENST00000492981 303 ntTSL 3 BASIC29.45■■■□□ 2.3
UTRNP46939 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 83.1 ms