Protein–RNA interactions for Protein: P42695

NCAPD3, Condensin-2 complex subunit D3, humanhuman

Predictions only

Length 1,498 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NCAPD3P42695 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.81■■■■■ 4.44
NCAPD3P42695 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC42.81■■■■■ 4.44
NCAPD3P42695 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC42.81■■■■■ 4.44
NCAPD3P42695 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC42.79■■■■■ 4.44
NCAPD3P42695 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.78■■■■■ 4.44
NCAPD3P42695 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC42.78■■■■■ 4.44
NCAPD3P42695 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC42.78■■■■■ 4.44
NCAPD3P42695 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC42.77■■■■■ 4.44
NCAPD3P42695 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.77■■■■■ 4.44
NCAPD3P42695 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC42.77■■■■■ 4.44
NCAPD3P42695 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC42.77■■■■■ 4.44
NCAPD3P42695 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC42.77■■■■■ 4.44
NCAPD3P42695 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC42.77■■■■■ 4.44
NCAPD3P42695 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.75■■■■■ 4.43
NCAPD3P42695 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC42.75■■■■■ 4.43
NCAPD3P42695 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC42.75■■■■■ 4.43
NCAPD3P42695 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC42.75■■■■■ 4.43
NCAPD3P42695 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC42.74■■■■■ 4.43
NCAPD3P42695 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC42.74■■■■■ 4.43
NCAPD3P42695 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC42.74■■■■■ 4.43
NCAPD3P42695 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.74■■■■■ 4.43
NCAPD3P42695 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC42.74■■■■■ 4.43
NCAPD3P42695 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC42.74■■■■■ 4.43
NCAPD3P42695 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC42.73■■■■■ 4.43
NCAPD3P42695 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC42.72■■■■■ 4.43
NCAPD3P42695 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.72■■■■■ 4.43
NCAPD3P42695 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC42.71■■■■■ 4.43
NCAPD3P42695 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC42.71■■■■■ 4.43
NCAPD3P42695 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC42.71■■■■■ 4.43
NCAPD3P42695 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC42.71■■■■■ 4.43
NCAPD3P42695 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC42.7■■■■■ 4.43
NCAPD3P42695 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC42.7■■■■■ 4.43
NCAPD3P42695 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC42.7■■■■■ 4.43
NCAPD3P42695 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.7■■■■■ 4.43
NCAPD3P42695 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.7■■■■■ 4.43
NCAPD3P42695 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC42.7■■■■■ 4.43
NCAPD3P42695 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.69■■■■■ 4.43
NCAPD3P42695 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC42.68■■■■■ 4.42
NCAPD3P42695 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.68■■■■■ 4.42
NCAPD3P42695 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC42.68■■■■■ 4.42
NCAPD3P42695 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC42.68■■■■■ 4.42
NCAPD3P42695 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC42.68■■■■■ 4.42
NCAPD3P42695 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC42.68■■■■■ 4.42
NCAPD3P42695 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC42.67■■■■■ 4.42
NCAPD3P42695 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC42.67■■■■■ 4.42
NCAPD3P42695 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC42.67■■■■■ 4.42
NCAPD3P42695 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.66■■■■■ 4.42
NCAPD3P42695 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.66■■■■■ 4.42
NCAPD3P42695 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC42.66■■■■■ 4.42
NCAPD3P42695 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC42.66■■■■■ 4.42
NCAPD3P42695 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC42.65■■■■■ 4.42
NCAPD3P42695 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC42.65■■■■■ 4.42
NCAPD3P42695 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.63■■■■■ 4.42
NCAPD3P42695 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.63■■■■■ 4.42
NCAPD3P42695 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC42.63■■■■■ 4.42
NCAPD3P42695 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC42.63■■■■■ 4.42
NCAPD3P42695 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC42.62■■■■■ 4.41
NCAPD3P42695 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC42.62■■■■■ 4.41
NCAPD3P42695 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC42.62■■■■■ 4.41
NCAPD3P42695 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC42.61■■■■■ 4.41
NCAPD3P42695 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC42.61■■■■■ 4.41
NCAPD3P42695 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.6■■■■■ 4.41
NCAPD3P42695 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.6■■■■■ 4.41
NCAPD3P42695 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC42.59■■■■■ 4.41
NCAPD3P42695 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC42.59■■■■■ 4.41
NCAPD3P42695 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.59■■■■■ 4.41
NCAPD3P42695 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC42.59■■■■■ 4.41
NCAPD3P42695 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC42.59■■■■■ 4.41
NCAPD3P42695 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC42.58■■■■■ 4.41
NCAPD3P42695 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC42.58■■■■■ 4.41
NCAPD3P42695 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC42.58■■■■■ 4.41
NCAPD3P42695 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.58■■■■■ 4.41
NCAPD3P42695 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC42.58■■■■■ 4.41
NCAPD3P42695 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC42.58■■■■■ 4.41
NCAPD3P42695 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC42.58■■■■■ 4.41
NCAPD3P42695 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC42.57■■■■■ 4.41
NCAPD3P42695 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.57■■■■■ 4.41
NCAPD3P42695 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.57■■■■■ 4.41
NCAPD3P42695 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC42.57■■■■■ 4.41
NCAPD3P42695 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC42.57■■■■■ 4.41
NCAPD3P42695 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC42.57■■■■■ 4.4
NCAPD3P42695 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC42.57■■■■■ 4.4
NCAPD3P42695 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC42.56■■■■■ 4.4
NCAPD3P42695 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC42.56■■■■■ 4.4
NCAPD3P42695 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC42.55■■■■■ 4.4
NCAPD3P42695 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.55■■■■■ 4.4
NCAPD3P42695 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC42.55■■■■■ 4.4
NCAPD3P42695 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC42.55■■■■■ 4.4
NCAPD3P42695 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC42.54■■■■■ 4.4
NCAPD3P42695 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.53■■■■■ 4.4
NCAPD3P42695 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC42.53■■■■■ 4.4
NCAPD3P42695 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC42.53■■■■■ 4.4
NCAPD3P42695 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.53■■■■■ 4.4
NCAPD3P42695 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC42.53■■■■■ 4.4
NCAPD3P42695 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC42.53■■■■■ 4.4
NCAPD3P42695 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC42.52■■■■■ 4.4
NCAPD3P42695 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC42.51■■■■■ 4.4
NCAPD3P42695 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC42.51■■■■■ 4.4
NCAPD3P42695 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC42.51■■■■■ 4.4
NCAPD3P42695 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC42.5■■■■■ 4.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48 ms