Protein–RNA interactions for Protein: P32248

CCR7, C-C chemokine receptor type 7, humanhuman

Predictions only

Length 378 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCR7P32248 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CCR7P32248 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CCR7P32248 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CCR7P32248 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CCR7P32248 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CCR7P32248 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CCR7P32248 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CCR7P32248 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CCR7P32248 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CCR7P32248 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CCR7P32248 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CCR7P32248 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CCR7P32248 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CCR7P32248 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CCR7P32248 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CCR7P32248 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CCR7P32248 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CCR7P32248 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CCR7P32248 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CCR7P32248 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CCR7P32248 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CCR7P32248 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
CCR7P32248 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
CCR7P32248 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CCR7P32248 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CCR7P32248 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CCR7P32248 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CCR7P32248 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CCR7P32248 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CCR7P32248 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CCR7P32248 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CCR7P32248 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CCR7P32248 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CCR7P32248 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CCR7P32248 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CCR7P32248 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CCR7P32248 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CCR7P32248 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CCR7P32248 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CCR7P32248 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
CCR7P32248 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CCR7P32248 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CCR7P32248 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CCR7P32248 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CCR7P32248 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CCR7P32248 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CCR7P32248 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CCR7P32248 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CCR7P32248 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CCR7P32248 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CCR7P32248 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CCR7P32248 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CCR7P32248 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CCR7P32248 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CCR7P32248 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CCR7P32248 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CCR7P32248 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CCR7P32248 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CCR7P32248 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CCR7P32248 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CCR7P32248 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CCR7P32248 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CCR7P32248 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CCR7P32248 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
CCR7P32248 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
CCR7P32248 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CCR7P32248 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CCR7P32248 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CCR7P32248 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CCR7P32248 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
CCR7P32248 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
CCR7P32248 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CCR7P32248 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CCR7P32248 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CCR7P32248 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CCR7P32248 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CCR7P32248 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CCR7P32248 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CCR7P32248 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CCR7P32248 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CCR7P32248 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
CCR7P32248 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.3
CCR7P32248 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.3
CCR7P32248 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CCR7P32248 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CCR7P32248 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
CCR7P32248 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
CCR7P32248 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CCR7P32248 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
CCR7P32248 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CCR7P32248 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
CCR7P32248 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
CCR7P32248 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC23.14■■□□□ 1.29
CCR7P32248 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CCR7P32248 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
CCR7P32248 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
CCR7P32248 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CCR7P32248 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CCR7P32248 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CCR7P32248 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 122.3 ms