Protein–RNA interactions for Protein: P27544

CERS1, Ceramide synthase 1, humanhuman

Predictions only

Length 350 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CERS1P27544 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CERS1P27544 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CERS1P27544 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CERS1P27544 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CERS1P27544 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CERS1P27544 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CERS1P27544 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
CERS1P27544 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CERS1P27544 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CERS1P27544 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CERS1P27544 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CERS1P27544 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CERS1P27544 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CERS1P27544 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CERS1P27544 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CERS1P27544 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CERS1P27544 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CERS1P27544 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CERS1P27544 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CERS1P27544 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CERS1P27544 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CERS1P27544 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
CERS1P27544 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CERS1P27544 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CERS1P27544 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CERS1P27544 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CERS1P27544 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CERS1P27544 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CERS1P27544 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CERS1P27544 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CERS1P27544 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CERS1P27544 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CERS1P27544 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CERS1P27544 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CERS1P27544 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CERS1P27544 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CERS1P27544 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CERS1P27544 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CERS1P27544 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CERS1P27544 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
CERS1P27544 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
CERS1P27544 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CERS1P27544 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
CERS1P27544 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CERS1P27544 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CERS1P27544 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CERS1P27544 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CERS1P27544 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CERS1P27544 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CERS1P27544 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CERS1P27544 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CERS1P27544 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CERS1P27544 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CERS1P27544 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CERS1P27544 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CERS1P27544 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CERS1P27544 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CERS1P27544 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CERS1P27544 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CERS1P27544 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CERS1P27544 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CERS1P27544 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CERS1P27544 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
CERS1P27544 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CERS1P27544 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CERS1P27544 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CERS1P27544 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CERS1P27544 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CERS1P27544 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
CERS1P27544 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CERS1P27544 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CERS1P27544 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CERS1P27544 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CERS1P27544 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CERS1P27544 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CERS1P27544 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CERS1P27544 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CERS1P27544 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CERS1P27544 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CERS1P27544 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CERS1P27544 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CERS1P27544 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CERS1P27544 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
CERS1P27544 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CERS1P27544 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CERS1P27544 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CERS1P27544 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CERS1P27544 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CERS1P27544 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CERS1P27544 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CERS1P27544 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CERS1P27544 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CERS1P27544 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CERS1P27544 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CERS1P27544 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
CERS1P27544 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
CERS1P27544 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CERS1P27544 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CERS1P27544 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CERS1P27544 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.4 ms