Protein–RNA interactions for Protein: P25705

ATP5A1, ATP synthase subunit alpha, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 553 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP5A1P25705 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
ATP5A1P25705 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC22.45■■□□□ 1.18
ATP5A1P25705 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
ATP5A1P25705 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
ATP5A1P25705 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
ATP5A1P25705 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
ATP5A1P25705 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
ATP5A1P25705 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
ATP5A1P25705 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
ATP5A1P25705 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ATP5A1P25705 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ATP5A1P25705 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
ATP5A1P25705 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ATP5A1P25705 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
ATP5A1P25705 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
ATP5A1P25705 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
ATP5A1P25705 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
ATP5A1P25705 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
ATP5A1P25705 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
ATP5A1P25705 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
ATP5A1P25705 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
ATP5A1P25705 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
ATP5A1P25705 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
ATP5A1P25705 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
ATP5A1P25705 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
ATP5A1P25705 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
ATP5A1P25705 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
ATP5A1P25705 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
ATP5A1P25705 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
ATP5A1P25705 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
ATP5A1P25705 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
ATP5A1P25705 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
ATP5A1P25705 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
ATP5A1P25705 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
ATP5A1P25705 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
ATP5A1P25705 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
ATP5A1P25705 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
ATP5A1P25705 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
ATP5A1P25705 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ATP5A1P25705 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ATP5A1P25705 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
ATP5A1P25705 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ATP5A1P25705 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
ATP5A1P25705 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
ATP5A1P25705 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ATP5A1P25705 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ATP5A1P25705 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
ATP5A1P25705 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ATP5A1P25705 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
ATP5A1P25705 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
ATP5A1P25705 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
ATP5A1P25705 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
ATP5A1P25705 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
ATP5A1P25705 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
ATP5A1P25705 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
ATP5A1P25705 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
ATP5A1P25705 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
ATP5A1P25705 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ATP5A1P25705 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ATP5A1P25705 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ATP5A1P25705 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ATP5A1P25705 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
ATP5A1P25705 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ATP5A1P25705 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ATP5A1P25705 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ATP5A1P25705 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
ATP5A1P25705 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
ATP5A1P25705 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ATP5A1P25705 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ATP5A1P25705 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ATP5A1P25705 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ATP5A1P25705 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
ATP5A1P25705 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
ATP5A1P25705 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ATP5A1P25705 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ATP5A1P25705 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ATP5A1P25705 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ATP5A1P25705 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
ATP5A1P25705 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ATP5A1P25705 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
ATP5A1P25705 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
ATP5A1P25705 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ATP5A1P25705 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ATP5A1P25705 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
ATP5A1P25705 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ATP5A1P25705 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
ATP5A1P25705 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
ATP5A1P25705 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
ATP5A1P25705 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
ATP5A1P25705 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ATP5A1P25705 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ATP5A1P25705 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
ATP5A1P25705 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ATP5A1P25705 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ATP5A1P25705 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
ATP5A1P25705 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ATP5A1P25705 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
ATP5A1P25705 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
ATP5A1P25705 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
ATP5A1P25705 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 98.1 ms