Protein–RNA interactions for Protein: P21399

ACO1, Cytoplasmic aconitate hydratase, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 889 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACO1P21399 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
ACO1P21399 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
ACO1P21399 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
ACO1P21399 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
ACO1P21399 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
ACO1P21399 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
ACO1P21399 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
ACO1P21399 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
ACO1P21399 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
ACO1P21399 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
ACO1P21399 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
ACO1P21399 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
ACO1P21399 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
ACO1P21399 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
ACO1P21399 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
ACO1P21399 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
ACO1P21399 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
ACO1P21399 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
ACO1P21399 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
ACO1P21399 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
ACO1P21399 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
ACO1P21399 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
ACO1P21399 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
ACO1P21399 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
ACO1P21399 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
ACO1P21399 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
ACO1P21399 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
ACO1P21399 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC25.3■■□□□ 1.64
ACO1P21399 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC25.3■■□□□ 1.64
ACO1P21399 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
ACO1P21399 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
ACO1P21399 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
ACO1P21399 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
ACO1P21399 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
ACO1P21399 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
ACO1P21399 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
ACO1P21399 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
ACO1P21399 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
ACO1P21399 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
ACO1P21399 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
ACO1P21399 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
ACO1P21399 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
ACO1P21399 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
ACO1P21399 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
ACO1P21399 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
ACO1P21399 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
ACO1P21399 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
ACO1P21399 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
ACO1P21399 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
ACO1P21399 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
ACO1P21399 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
ACO1P21399 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
ACO1P21399 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
ACO1P21399 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
ACO1P21399 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
ACO1P21399 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
ACO1P21399 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
ACO1P21399 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
ACO1P21399 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
ACO1P21399 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
ACO1P21399 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
ACO1P21399 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
ACO1P21399 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC25.24■■□□□ 1.63
ACO1P21399 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
ACO1P21399 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
ACO1P21399 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
ACO1P21399 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
ACO1P21399 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
ACO1P21399 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
ACO1P21399 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
ACO1P21399 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
ACO1P21399 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
ACO1P21399 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
ACO1P21399 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
ACO1P21399 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
ACO1P21399 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
ACO1P21399 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
ACO1P21399 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
ACO1P21399 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
ACO1P21399 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
ACO1P21399 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC25.2■■□□□ 1.62
ACO1P21399 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
ACO1P21399 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.62
ACO1P21399 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
ACO1P21399 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
ACO1P21399 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
ACO1P21399 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
ACO1P21399 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
ACO1P21399 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
ACO1P21399 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC25.19■■□□□ 1.62
ACO1P21399 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
ACO1P21399 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
ACO1P21399 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
ACO1P21399 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
ACO1P21399 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
ACO1P21399 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
ACO1P21399 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
ACO1P21399 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
ACO1P21399 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
ACO1P21399 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.1 ms