Protein–RNA interactions for Protein: P13500

CCL2, C-C motif chemokine 2, humanhuman

Predictions only

Length 99 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCL2P13500 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
CCL2P13500 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
CCL2P13500 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
CCL2P13500 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
CCL2P13500 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
CCL2P13500 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
CCL2P13500 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
CCL2P13500 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
CCL2P13500 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
CCL2P13500 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
CCL2P13500 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
CCL2P13500 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
CCL2P13500 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
CCL2P13500 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
CCL2P13500 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
CCL2P13500 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
CCL2P13500 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
CCL2P13500 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
CCL2P13500 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
CCL2P13500 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
CCL2P13500 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
CCL2P13500 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.54■□□□□ 0.88
CCL2P13500 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
CCL2P13500 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC20.54■□□□□ 0.88
CCL2P13500 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC20.54■□□□□ 0.88
CCL2P13500 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
CCL2P13500 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
CCL2P13500 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
CCL2P13500 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
CCL2P13500 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
CCL2P13500 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
CCL2P13500 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
CCL2P13500 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
CCL2P13500 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
CCL2P13500 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
CCL2P13500 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
CCL2P13500 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
CCL2P13500 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
CCL2P13500 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
CCL2P13500 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
CCL2P13500 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
CCL2P13500 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
CCL2P13500 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
CCL2P13500 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
CCL2P13500 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
CCL2P13500 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.87
CCL2P13500 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
CCL2P13500 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
CCL2P13500 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
CCL2P13500 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CCL2P13500 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CCL2P13500 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
CCL2P13500 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
CCL2P13500 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
CCL2P13500 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CCL2P13500 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CCL2P13500 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CCL2P13500 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CCL2P13500 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
CCL2P13500 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CCL2P13500 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CCL2P13500 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CCL2P13500 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CCL2P13500 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CCL2P13500 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CCL2P13500 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CCL2P13500 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CCL2P13500 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CCL2P13500 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CCL2P13500 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CCL2P13500 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CCL2P13500 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
CCL2P13500 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CCL2P13500 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CCL2P13500 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CCL2P13500 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CCL2P13500 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CCL2P13500 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CCL2P13500 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CCL2P13500 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CCL2P13500 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CCL2P13500 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CCL2P13500 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CCL2P13500 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CCL2P13500 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CCL2P13500 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CCL2P13500 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CCL2P13500 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CCL2P13500 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CCL2P13500 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CCL2P13500 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CCL2P13500 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CCL2P13500 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CCL2P13500 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CCL2P13500 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CCL2P13500 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CCL2P13500 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CCL2P13500 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CCL2P13500 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CCL2P13500 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.1 ms