Protein–RNA interactions for Protein: O95996

APC2, Adenomatous polyposis coli protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 2,303 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APC2O95996 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
APC2O95996 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
APC2O95996 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
APC2O95996 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
APC2O95996 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
APC2O95996 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
APC2O95996 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
APC2O95996 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC22.32■■□□□ 1.16
APC2O95996 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
APC2O95996 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
APC2O95996 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
APC2O95996 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
APC2O95996 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
APC2O95996 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
APC2O95996 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
APC2O95996 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
APC2O95996 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
APC2O95996 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
APC2O95996 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
APC2O95996 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
APC2O95996 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
APC2O95996 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
APC2O95996 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
APC2O95996 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
APC2O95996 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
APC2O95996 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
APC2O95996 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
APC2O95996 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
APC2O95996 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
APC2O95996 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
APC2O95996 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC22.3■■□□□ 1.16
APC2O95996 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
APC2O95996 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
APC2O95996 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
APC2O95996 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
APC2O95996 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
APC2O95996 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
APC2O95996 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
APC2O95996 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
APC2O95996 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC22.29■■□□□ 1.16
APC2O95996 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
APC2O95996 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
APC2O95996 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
APC2O95996 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
APC2O95996 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
APC2O95996 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
APC2O95996 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
APC2O95996 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
APC2O95996 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
APC2O95996 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
APC2O95996 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
APC2O95996 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
APC2O95996 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
APC2O95996 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
APC2O95996 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
APC2O95996 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
APC2O95996 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
APC2O95996 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
APC2O95996 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
APC2O95996 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
APC2O95996 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
APC2O95996 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
APC2O95996 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
APC2O95996 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
APC2O95996 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
APC2O95996 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
APC2O95996 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
APC2O95996 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
APC2O95996 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
APC2O95996 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
APC2O95996 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
APC2O95996 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
APC2O95996 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
APC2O95996 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
APC2O95996 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
APC2O95996 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
APC2O95996 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC22.24■■□□□ 1.15
APC2O95996 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
APC2O95996 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
APC2O95996 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
APC2O95996 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
APC2O95996 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
APC2O95996 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
APC2O95996 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
APC2O95996 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
APC2O95996 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
APC2O95996 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
APC2O95996 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
APC2O95996 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
APC2O95996 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
APC2O95996 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
APC2O95996 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
APC2O95996 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
APC2O95996 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
APC2O95996 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
APC2O95996 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
APC2O95996 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
APC2O95996 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
APC2O95996 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
APC2O95996 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.6 ms